| 摘要 | 第4-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-20页 |
| 1 子陵吻虾虎鱼及小黄黝鱼的研究概况 | 第12-15页 |
| 1.1 虾虎鱼的简介 | 第12页 |
| 1.2 生物学特性 | 第12-15页 |
| 1.2.1 子陵吻虾虎鱼生物学特性及研究现状 | 第12-13页 |
| 1.2.2 小黄黝鱼生物学特性及研究现状 | 第13-15页 |
| 2 亲缘地理学的起源以及研究种群遗传结构、遗传多样性形成的机制中相关的理论基础 | 第15-16页 |
| 2.1 亲缘地理学的起源 | 第15页 |
| 2.2 研究亲缘地理学、种群结构、遗传多样性相关的理论 | 第15-16页 |
| 2.2.1 中性进化理论 | 第15页 |
| 2.2.2 溯祖理论 | 第15-16页 |
| 3 鱼类种群遗传学及亲缘地理学研究中分子标记的选择 | 第16-18页 |
| 3.1 第一代分子标记RFLP | 第16页 |
| 3.2 第二代分子标记微卫星标记SSR | 第16-17页 |
| 3.3 第三代分子标记单核苷酸多态SNP | 第17-18页 |
| 3.4 其他单个核基因标记以及基于基因富集方法的多位点标记 | 第18页 |
| 3.5 线粒体遗传标记 | 第18页 |
| 4 本研究的目的、意义及技术路线 | 第18-20页 |
| 第二章 基于线粒体Cyt b分子标记的子陵吻虾虎鱼遗传多样性及种群结构分析 | 第20-41页 |
| 1 前言 | 第20-21页 |
| 2 材料与方法 | 第21-24页 |
| 2.1 实验材料 | 第21-23页 |
| 2.2 总DNA提取 | 第23页 |
| 2.3 PCR扩增和测序 | 第23页 |
| 2.4 数据分析 | 第23-24页 |
| 3 结果 | 第24-37页 |
| 3.1 序列差异 | 第24页 |
| 3.2 遗传多样性 | 第24-28页 |
| 3.3 亲缘关系系统树与单倍型网络图 | 第28-29页 |
| 3.4 空间分子变异（SAMOVA）与分子变异（AMOVA）分析 | 第29-33页 |
| 3.5 种群遗传分化指数与遗传距离分析 | 第33-34页 |
| 3.6 种群历史动态 | 第34-37页 |
| 4 讨论 | 第37-40页 |
| 4.1 子陵吻虾虎鱼种群遗传多样性 | 第37页 |
| 4.2 子陵吻虾虎鱼系统发育关系分析 | 第37-39页 |
| 4.3 子陵吻虾虎鱼种群结构分析 | 第39页 |
| 4.4 种群历史动态 | 第39-40页 |
| 5 结论 | 第40-41页 |
| 第三章 中国小黄黝鱼种群结构和遗传多样性分析 | 第41-60页 |
| 第一节 中国小黄黝鱼种群结构和遗传多样性分析 | 第41-54页 |
| 1 前言 | 第41-42页 |
| 2 材料与方法 | 第42-45页 |
| 2.1 样本采集 | 第42-44页 |
| 2.2 实验方法 | 第44页 |
| 2.3 数据处理 | 第44-45页 |
| 3 结果 | 第45-51页 |
| 3.1 遗传多样性 | 第45页 |
| 3.2 单倍型网络图和谱系分析 | 第45-47页 |
| 3.3 种群结构与遗传分化分析 | 第47-48页 |
| 3.4 种群历史分析 | 第48-51页 |
| 4 讨论 | 第51-53页 |
| 4.1 单倍型网络图与谱系分析 | 第51-52页 |
| 4.2 AMOVA与SAMOVA分析 | 第52-53页 |
| 5 结论 | 第53-54页 |
| 第二节 小黄黝鱼的形态学形状测量与分析 | 第54-60页 |
| 1 前言 | 第54-55页 |
| 2 材料与方法 | 第55页 |
| 2.1 材料 | 第55页 |
| 2.2 方法 | 第55页 |
| 3 结果 | 第55-57页 |
| 4 结论 | 第57-60页 |
| 全文小结 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-69页 |
| 附录 | 第69-71页 |
| 致谢 | 第71页 |
