| 摘要 | 第1页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第1章 绪论 | 第9-15页 |
| ·课题的发展状况与研究的目的和意义 | 第9-11页 |
| ·研究意义 | 第9-10页 |
| ·国内外研究现状 | 第10-11页 |
| ·生物信息与生物信息学 | 第11-14页 |
| ·急剧增长的生物信息 | 第11-13页 |
| ·生物信息学的概念 | 第13-14页 |
| ·生物信息学的发展 | 第14页 |
| ·本文研究内容 | 第14-15页 |
| 第2章 蛋白质结构分类依据 | 第15-31页 |
| ·引言 | 第15页 |
| ·序列比对 | 第15-26页 |
| ·双序列比对 | 第16-25页 |
| ·Needleman-wunsch算法 | 第16-19页 |
| ·Smith-wateman算法 | 第19-22页 |
| ·替换矩阵 | 第22-25页 |
| ·多序列比对 | 第25-26页 |
| ·动态规划算法 | 第25-26页 |
| ·渐进算法 | 第26页 |
| ·结构比对 | 第26-29页 |
| ·蛋白质结构 | 第27-28页 |
| ·结构比对 | 第28-29页 |
| ·我们采用的多结构聚类软件:MAMMOTH-mult | 第29-30页 |
| ·本章小结 | 第30-31页 |
| 第3章 蛋白质结构分类数据库 | 第31-36页 |
| ·引言 | 第31页 |
| ·分类数据库 | 第31-34页 |
| ·SCOP分类数据库 | 第31-32页 |
| ·CATH分类数据库 | 第32-33页 |
| ·FSSP分类数据库 | 第33-34页 |
| ·蛋白质分类数据库评价 | 第34-35页 |
| ·本章小结 | 第35-36页 |
| 第4章 我们的工作:基于多结构比对的分类方法 | 第36-45页 |
| ·对SCOP、CATH、和FSSP数据库的分析 | 第36页 |
| ·基于多结构比对聚类的理论基础 | 第36-37页 |
| ·蛋白质结构数据集的筛选 | 第37页 |
| ·聚类距离函数的确定 | 第37-40页 |
| ·粗糙集理论 | 第38页 |
| ·知识的表达系统——决策表 | 第38-39页 |
| ·知识约简 | 第39-40页 |
| ·基于多结构比对的聚类结果 | 第40-44页 |
| ·本章小结 | 第44-45页 |
| 第5章 结论与展望 | 第45-46页 |
| 参考文献 | 第46-49页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果 | 第49-50页 |
| 致谢 | 第50页 |