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microRNA生物标志物的数据库构建及生物信息学分析

中文摘要第4-5页
Abstract第5页
第1章 引言第8-19页
    1.1 课题的研究背景第8-14页
        1.1.1 生物标志物的概念及其分类第8-9页
        1.1.2 癌症生物标志物的研究背景第9-11页
        1.1.3 microRNA作为生物标志物的研究背景第11-13页
        1.1.4 脓毒症生物标志物的研究现状第13-14页
    1.2 本文的研究内容第14-15页
        1.2.1 癌症microRNA生物标志物数据库的构建第14-15页
        1.2.2 生物信息学方法寻找新的脓毒症microRNA生物标志物第15页
    1.3 本课题的研究目的和意义第15-17页
        1.3.1 第一部分:癌症microRNA生物标志物数据库的构建第15-16页
        1.3.2 第二部分:生物信息学方法寻找新的脓毒症microRNA生物标志物第16-17页
    1.4 本文的组织架构第17-19页
第2章miR-abc: 人类癌症microRNA生物标志物数据库第19-30页
    2.1 数据库开发工具介绍第19-21页
        2.1.1 XAMPP建站集成软件包第19-20页
        2.1.2 Web端-开发技术第20页
        2.1.3 数据库管理方案第20-21页
    2.2 MiR-abc数据库的设计第21-23页
        2.2.1 数据库概念结构第21-22页
        2.2.2 数据库功能模块图第22-23页
    2.3 miR-abc数据库的实现第23-30页
第3章miR-abc数据库的数据收集与数据统计第30-37页
    3.1 人类高发性癌症的选取第30-31页
    3.2 microRNA生物标志物数据的收集第31-33页
        3.2.1 Pubmed文献搜索关键词的设定第31-33页
        3.2.2 MicroRNA生物标志物的信息注释第33页
    3.3 数据库数据统计第33-37页
        3.3.1 数据库中记录的microRNA生物标志物条目统计第33-34页
        3.3.2 各类型癌症microRNA标志物分类统计第34-35页
        3.3.3 癌症与microRNA生物标志物对应关系统计第35页
        3.3.4 癌症与microRNA生物标志对应关系的可视化图形第35-37页
第4章 生物信息学方法寻找新的脓毒症microRNA生物标志物第37-52页
    4.1 流程介绍第37-38页
    4.2 材料及方法第38-41页
        4.2.1 已报道的脓毒症miRNA生物标志物的数据收集第38页
        4.2.2 microRNA芯片数据分析第38-39页
        4.2.3 统计分析方法第39页
        4.2.4 miRNA-mRNA调控网络的构建第39页
        4.2.5 基因功能富集分析第39-41页
    4.3 结果与讨论第41-51页
        4.3.1 已报道的脓毒症microRNA生物标志物分析第41-42页
        4.3.2 脓毒症microRNA生物标志物的预测结果第42-45页
        4.3.3 候选microRNA靶基因的富集分析第45-47页
        4.3.4 候选microRNA标志物调控的蛋白相互作用网络功能分析第47-51页
    4.4 总结第51-52页
第5章 结论与展望第52-54页
参考文献第54-58页
附录第58-67页
攻读学位期间公开发表(待发表)的论文第67-68页
致谢第68-69页

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