中文摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5页 |
第1章 引言 | 第8-19页 |
1.1 课题的研究背景 | 第8-14页 |
1.1.1 生物标志物的概念及其分类 | 第8-9页 |
1.1.2 癌症生物标志物的研究背景 | 第9-11页 |
1.1.3 microRNA作为生物标志物的研究背景 | 第11-13页 |
1.1.4 脓毒症生物标志物的研究现状 | 第13-14页 |
1.2 本文的研究内容 | 第14-15页 |
1.2.1 癌症microRNA生物标志物数据库的构建 | 第14-15页 |
1.2.2 生物信息学方法寻找新的脓毒症microRNA生物标志物 | 第15页 |
1.3 本课题的研究目的和意义 | 第15-17页 |
1.3.1 第一部分:癌症microRNA生物标志物数据库的构建 | 第15-16页 |
1.3.2 第二部分:生物信息学方法寻找新的脓毒症microRNA生物标志物 | 第16-17页 |
1.4 本文的组织架构 | 第17-19页 |
第2章miR-abc: 人类癌症microRNA生物标志物数据库 | 第19-30页 |
2.1 数据库开发工具介绍 | 第19-21页 |
2.1.1 XAMPP建站集成软件包 | 第19-20页 |
2.1.2 Web端-开发技术 | 第20页 |
2.1.3 数据库管理方案 | 第20-21页 |
2.2 MiR-abc数据库的设计 | 第21-23页 |
2.2.1 数据库概念结构 | 第21-22页 |
2.2.2 数据库功能模块图 | 第22-23页 |
2.3 miR-abc数据库的实现 | 第23-30页 |
第3章miR-abc数据库的数据收集与数据统计 | 第30-37页 |
3.1 人类高发性癌症的选取 | 第30-31页 |
3.2 microRNA生物标志物数据的收集 | 第31-33页 |
3.2.1 Pubmed文献搜索关键词的设定 | 第31-33页 |
3.2.2 MicroRNA生物标志物的信息注释 | 第33页 |
3.3 数据库数据统计 | 第33-37页 |
3.3.1 数据库中记录的microRNA生物标志物条目统计 | 第33-34页 |
3.3.2 各类型癌症microRNA标志物分类统计 | 第34-35页 |
3.3.3 癌症与microRNA生物标志物对应关系统计 | 第35页 |
3.3.4 癌症与microRNA生物标志对应关系的可视化图形 | 第35-37页 |
第4章 生物信息学方法寻找新的脓毒症microRNA生物标志物 | 第37-52页 |
4.1 流程介绍 | 第37-38页 |
4.2 材料及方法 | 第38-41页 |
4.2.1 已报道的脓毒症miRNA生物标志物的数据收集 | 第38页 |
4.2.2 microRNA芯片数据分析 | 第38-39页 |
4.2.3 统计分析方法 | 第39页 |
4.2.4 miRNA-mRNA调控网络的构建 | 第39页 |
4.2.5 基因功能富集分析 | 第39-41页 |
4.3 结果与讨论 | 第41-51页 |
4.3.1 已报道的脓毒症microRNA生物标志物分析 | 第41-42页 |
4.3.2 脓毒症microRNA生物标志物的预测结果 | 第42-45页 |
4.3.3 候选microRNA靶基因的富集分析 | 第45-47页 |
4.3.4 候选microRNA标志物调控的蛋白相互作用网络功能分析 | 第47-51页 |
4.4 总结 | 第51-52页 |
第5章 结论与展望 | 第52-54页 |
参考文献 | 第54-58页 |
附录 | 第58-67页 |
攻读学位期间公开发表(待发表)的论文 | 第67-68页 |
致谢 | 第68-69页 |