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利用定点表观遗传修饰技术甲基化FMR1启动子

摘要第3-4页
Abstract第4页
第一章 文献综述第7-20页
    1.1 FXS的致病原因第7-8页
    1.2 FXS的诊断与防治第8页
    1.3 FXS的研究进展第8-10页
    1.4 FMR1基因相关介绍第10-12页
        1.4.1 fragile X mental retardation 1(FMR1)的基因结构第10页
        1.4.2 FMR1基因的功能及研究进展第10-12页
    1.5 表观遗传概况第12-14页
        1.5.1 表观遗传的概念第12页
        1.5.2 DNA甲基化第12-13页
        1.5.3 组蛋白修饰第13-14页
        1.5.4 非编码RNA第14页
    1.6 基因编辑技术第14-16页
        1.6.1 ZFN第15页
        1.6.2 TALEN第15页
        1.6.3 CRISPR/Cas9系统第15-16页
    1.7 表观遗传基因修饰技术第16-18页
    1.8 Casilio技术的原理及应用第18-20页
第二章 材料与方法第20-44页
    2.1 实验材料第20-24页
        2.1.1 细胞、菌株及质粒载体第20页
        2.1.2 实验所用试剂第20-21页
        2.1.3 实验耗材及实验仪器第21-22页
        2.1.4 本研究中所有引物序列第22-24页
    2.2 实验方法第24-44页
        2.2.1 质粒的构建第24-31页
            2.2.1.1 gRNA质粒的克隆第24-26页
            2.2.1.2 长片段的克隆第26-28页
            2.2.1.3 用Gateway的方法克隆质粒第28页
            2.2.1.4 用In-Fusion~? HD Cloning Kit进行目的序列克隆第28-29页
            2.2.1.5 菌落PCR鉴定第29-30页
            2.2.1.6 酶切鉴定第30页
            2.2.1.7 质粒大提(Endo Free Plasmid Maxi Kit ,QIAGEN)第30-31页
        2.2.2 常用试剂配置第31-32页
        2.2.3 细胞培养第32-34页
            2.2.3.1 293T细胞的培养第32-33页
                2.2.3.1.1 复苏第32页
                2.2.3.1.2 冻存第32-33页
                2.2.3.1.3 传代第33页
            2.2.3.2 人类胚胎干细胞的培养第33-34页
                2.2.3.2.1 复苏第33页
                2.2.3.2.2 冻存(六孔板)第33-34页
                2.2.3.2.3 传代第34页
        2.2.4 脂质体转染 293T细胞第34-35页
        2.2.5 Surveyor Assay第35-36页
        2.2.6 甲基化检测第36-38页
        2.2.7 实时荧光定量PCR( Real Time PCR, RT-PCR)第38-39页
            2.2.7.1 细胞总RNA的提取第38-39页
            2.2.7.2 将RNA反转录为cDNA第39页
            2.2.7.3 RT-PCR第39页
        2.2.8 慢病毒侵染第39-40页
        2.2.9 慢病毒侵染阳性细胞的筛选第40-41页
            2.2.9.1 嘌呤霉素(puro)筛选第40-41页
            2.2.9.2 流式细胞分选第41页
        2.2.11 细胞系支原体检测第41-43页
        2.2.12 统计学分析第43-44页
第三章 结果与分析第44-54页
    3.1 构建表达Casilio-效应因子融合蛋白的质粒第44-45页
    3.2 确定三种野生型细胞FMR1基因是否可以作为定点甲基化修饰的实验材料第45-46页
    3.3 探究Casilio-DNMT相关质粒是否具有甲基化抑制基因表达的功能第46-50页
    3.4 甲基化实验转染后不同时期收样检测FMR1的mRNA和甲基化水平的变化第50-51页
    3.5 建立稳定表达Casilio hDNMT3A-hDNMT3L的人类胚胎干细胞系第51-54页
第四章 讨论第54-56页
参考文献第56-62页
致谢第62页

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