| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 1 文献综述 | 第10-14页 |
| 1.1 珍珠贝的分类 | 第10页 |
| 1.2 珍珠贝的矿化机制 | 第10-11页 |
| 1.3 珍珠贝的免疫机制 | 第11-12页 |
| 1.4 外套膜的相关研究 | 第12页 |
| 1.5 目的和意义 | 第12-14页 |
| 2 三角帆蚌和褶纹冠蚌外套膜转录组数据分析 | 第14-54页 |
| 2.1 实验材料 | 第14-15页 |
| 2.1.1 实验用贝及材料 | 第14页 |
| 2.1.2 实验仪器和设施 | 第14页 |
| 2.1.3 主要实验试剂 | 第14-15页 |
| 2.2 实验方法 | 第15-21页 |
| 2.2.1 总RNA质量检测 | 第15页 |
| 2.2.2 转录组De novo研究流程 | 第15-16页 |
| 2.2.3 De novo组装 | 第16-17页 |
| 2.2.4 unigene表达量计算以及差异基因检测 | 第17页 |
| 2.2.5 已知矿化基因的筛选 | 第17-18页 |
| 2.2.6 三个物种外套膜矿化相关差异表达基因筛选 | 第18页 |
| 2.2.7 三个物种外套膜矿化相关差异表达基因KEGG通路的比较分析 | 第18页 |
| 2.2.8 三个物种外套膜免疫相关差异表达基因筛选 | 第18-19页 |
| 2.2.10 引物的设计 | 第19-21页 |
| 2.3 结果 | 第21-48页 |
| 2.3.1 总RNA质量检测 | 第21-22页 |
| 2.3.2 转录组数据的概述 | 第22-23页 |
| 2.3.3 测序数据过滤 | 第23-25页 |
| 2.3.4 De novo组装的结果 | 第25-31页 |
| 2.3.5 Unigene功能注释 | 第31页 |
| 2.3.6 三角帆蚌和褶纹冠蚌已知矿化基因的筛选 | 第31-35页 |
| 2.3.7 三个物种已知矿化相关基因的荧光定量验证 | 第35-38页 |
| 2.3.8 中央膜和边缘膜中高表达基因分析 | 第38-40页 |
| 2.3.9 差异表达基因检测结果 | 第40-41页 |
| 2.3.10 三个物种差异基因KEGG通路富集分析 | 第41-46页 |
| 2.3.11 三个转录组组蛋白及乙酰化修饰相关基因的筛选 | 第46-48页 |
| 2.4 讨论 | 第48-54页 |
| 2.4.1 转录组数据测序的分析 | 第48-49页 |
| 2.4.2 已知矿化基因分析 | 第49-51页 |
| 2.4.3 三个转录组差异基因的表达分析 | 第51-52页 |
| 2.4.4 三个物种差异基因KEGG富集通路的数据分析 | 第52-54页 |
| 3 三个物种组蛋白及乙酰化修饰相关基因的克隆和表达特性分析 | 第54-73页 |
| 3.1 实验材料 | 第54页 |
| 3.1.1 实验动物与材料 | 第54页 |
| 3.1.2 主要仪器和设施 | 第54页 |
| 3.1.3 主要实验试剂 | 第54页 |
| 3.2 实验方法 | 第54-58页 |
| 3.2.1 总RNA的提取 | 第54页 |
| 3.2.2 基因克隆 | 第54-56页 |
| 3.2.3 基因的生物信息学分析 | 第56页 |
| 3.2.4 脂多糖刺激实验 | 第56页 |
| 3.2.5 荧光定量验证 | 第56页 |
| 3.2.6 引物序列列表 | 第56-58页 |
| 3.3 实验结果 | 第58-71页 |
| 3.3.1 马氏珠母贝中组蛋白相关基因的克隆结果概况 | 第58页 |
| 3.3.2 各个基因的序列特征分析 | 第58-67页 |
| 3.3.3 组蛋白基因的全组织荧光定量分析 | 第67-68页 |
| 3.3.4 LPS刺激后马氏珠母贝血液中的相关基因的表达量 | 第68-69页 |
| 3.3.5 LPS刺激后马氏珠母贝组蛋白乙酰转移酶和去乙酰化酶的活力检测结果 | 第69-71页 |
| 3.4 讨论 | 第71-73页 |
| 4 结论 | 第73-74页 |
| 参考文献 | 第74-88页 |
| 附录 | 第88-118页 |
| 致谢 | 第118-119页 |
| 作者简介 | 第119-120页 |
| 导师简介 | 第120页 |
