| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 第1章 绪论 | 第8-16页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第8-9页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第9-13页 |
| 1.2.1 存在的描述符方法 | 第9-11页 |
| 1.2.2 化合物计算相似性的核方法 | 第11-13页 |
| 1.3 本文的主要工作 | 第13页 |
| 1.4 本文的组织结构 | 第13-16页 |
| 第2章 核和图核 | 第16-26页 |
| 2.1 核方法 | 第16-17页 |
| 2.2 正定核 | 第17-18页 |
| 2.3 再生核 | 第18-19页 |
| 2.4 图核 | 第19-25页 |
| 2.4.1 图论的相关定义 | 第20页 |
| 2.4.2 卷积核 | 第20-21页 |
| 2.4.3 最优分配核 | 第21页 |
| 2.4.4 子树核 | 第21-22页 |
| 2.4.5 基于标号对的核 | 第22-23页 |
| 2.4.6 积图核 | 第23页 |
| 2.4.7 边缘化图核 | 第23-25页 |
| 2.5 本章小结 | 第25-26页 |
| 第3章 基于连接的化合物描述法和IMAX-MIN核 | 第26-36页 |
| 3.1 与摩根算法的关系 | 第26-27页 |
| 3.2 扩展连接性标识符 | 第27页 |
| 3.3 原子标识符的最初分配 | 第27-32页 |
| 3.3.1 标识符的迭代更新 | 第28-29页 |
| 3.3.2 重复结构的移除 | 第29-31页 |
| 3.3.3 重复标识符的移除 | 第31-32页 |
| 3.3.4 哈希函数的选择 | 第32页 |
| 3.4 功能类描述法 | 第32-34页 |
| 3.5 IMAX-MIN核 | 第34-35页 |
| 3.6 本章小结 | 第35-36页 |
| 第4章 子结构匹配核和子结构对核 | 第36-44页 |
| 4.1 图匹配核 | 第36-38页 |
| 4.2 基于扩展连接的子结构函数 | 第38-39页 |
| 4.2.1 子结构成员函数 | 第38页 |
| 4.2.2 子结构扩散函数 | 第38-39页 |
| 4.3 子结构对核 | 第39-42页 |
| 4.4 本章小结 | 第42-44页 |
| 第5章 核机器及实验 | 第44-54页 |
| 5.1 表示定理 | 第44-45页 |
| 5.2 样本数据点的rkHs中的特征函数 | 第45-46页 |
| 5.3 回归、分类以及其它的监管任务 | 第46-49页 |
| 5.4 HIV和PTC数据集 | 第49-51页 |
| 5.5 实验配置 | 第51-52页 |
| 5.6 评估图核函数 | 第52-53页 |
| 5.7 本章小结 | 第53-54页 |
| 结论 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-60页 |
| 攻读硕士学位期间所发表的学术论文 | 第60-62页 |
| 致谢 | 第62页 |