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三角帆蚌转录组和数字基因表达谱分析及EF-hand基因的表达研究

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-13页
引言第13-22页
 1、淡水珍珠培育第13-15页
   ·三角帆蚌概述第13-14页
   ·淡水育珠技术第14-15页
 2、珍珠的形成第15-17页
   ·珍珠囊研究概况第16页
   ·珍珠层形成机理的研究进展第16-17页
 3、珍珠质矿化机理研究进展第17-19页
   ·贝类钙代谢第17-18页
   ·基质蛋白第18页
   ·EF-hand蛋白第18-19页
 4、RNA-seq的研究进展第19-20页
 5、研究目的与意义第20-22页
第一章 三角帆蚌转录组分析第22-42页
   ·前言第22页
   ·材料与方法第22-27页
     ·实验材料第22页
     ·主要试剂第22-23页
     ·实验主要仪器设备第23页
     ·实验方法第23-27页
   ·实验结果第27-40页
   ·讨论第40-42页
第二章 三角帆蚌不同育珠时期外套膜和内脏团DGE分析第42-54页
   ·前言第42页
   ·材料与方法第42-44页
     ·实验材料第42-43页
     ·主要试剂和仪器第43页
     ·实验方法第43-44页
   ·结果第44-52页
     ·总RNA检测第44-45页
     ·数据质量第45-46页
     ·参考序列比对分析第46页
     ·基因表达水平分析第46-47页
     ·基因差异表达分析第47-48页
     ·基因差异聚类分析第48-49页
     ·与钙代谢相关基因差异表达分析第49-52页
   ·讨论第52-54页
第三章 三角帆蚌EF-hand基因的表达研究第54-80页
   ·前言第54-55页
   ·材料与试剂第55-57页
     ·实验材料第55页
     ·主要试剂第55-56页
     ·常用试剂配制第56-57页
   ·主要仪器第57页
   ·实验方法第57-67页
     ·总RNA提取和检测第57页
     ·引物设计第57-58页
     ·反转录第58-59页
     ·三角帆蚌EFCB1 基因cDNA片段克隆第59页
     ·PCR产物检测和纯化回收第59-60页
     ·连接和转化第60页
     ·重组子筛选第60-61页
     ·5’-RACE第61-64页
     ·3’-RACE第64-66页
     ·EFCB1 片段、5’RACE和 3’RACE序列拼接第66页
     ·荧光定量PCR第66-67页
     ·生物信息学分析第67页
   ·结果与分析第67-77页
     ·三角帆蚌EFCB1 基因的克隆和序列分析第67-68页
     ·三角帆蚌EFCB1 蛋白预测和结构分析第68-69页
     ·氨基酸多序列比对和进化树分析第69-72页
     ·三角帆蚌EF-hand家族基因插核后不同育珠部位表达分析第72-76页
     ·EFCB1 基因各组织表达分析第76-77页
   ·讨论第77-80页
小结第80-81页
参考文献第81-86页
附录第86-87页
致谢第87页

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