| 摘要 | 第1-9页 |
| 引言 | 第9-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-17页 |
| 1. 牛发情周期内卵泡生长发育研究进展 | 第10-14页 |
| ·卵泡概述 | 第10页 |
| ·卵泡发育波 | 第10-11页 |
| ·卵泡的募集 | 第11-12页 |
| ·卵泡的选择 | 第12-13页 |
| ·优势卵泡 | 第13-14页 |
| ·卵泡的成熟与排卵 | 第14页 |
| 2. 高通量测序技术研究进展 | 第14-17页 |
| ·Sanger测序技术 | 第15页 |
| ·454焦磷酸测序技术 | 第15-16页 |
| ·Illumina/Solexa测序技术 | 第16页 |
| ·ABI/SOLID测序技术 | 第16页 |
| ·高通量测序技术展望 | 第16-17页 |
| 第二章 牛卵泡颗粒细胞转录组测序与差异基因表达谱分析 | 第17-28页 |
| 1 材料与方法 | 第17-19页 |
| ·试验动物及样品采集 | 第17页 |
| ·卵泡采集 | 第17页 |
| ·颗粒细胞分离 | 第17页 |
| ·试验试剂、耗材及仪器 | 第17-18页 |
| ·试验试剂及耗材 | 第17页 |
| ·试验仪器 | 第17-18页 |
| ·溶液的配制 | 第18页 |
| ·试验方法 | 第18-19页 |
| ·颗粒细胞Total RNA的提取 | 第18页 |
| ·Total RNA完整性和浓度的检测 | 第18页 |
| ·牛卵泡颗粒细胞RNA文库构建并测序 | 第18-19页 |
| ·生物信息学分析 | 第19页 |
| ·重新装配与功能注释 | 第19页 |
| ·差异表达基因的筛选及KEGG pathway显著富集分析 | 第19页 |
| 2 结果与分析 | 第19-26页 |
| ·牛卵泡颗粒细胞total RNA提取结果 | 第19-20页 |
| ·Illumina测序与序列重新装配 | 第20页 |
| ·预测蛋白的功能注释 | 第20-22页 |
| ·ODF1和PDF1中差异表达基因 | 第22页 |
| ·KEGG pathway显著富集分析 | 第22-26页 |
| ·功能筛选10个可能与卵泡发育相关基因 | 第26页 |
| 3 讨论 | 第26-27页 |
| 4 小结 | 第27-28页 |
| 第三章 牛发情周期第一卵泡波优势卵泡、从属卵泡筛选 | 第28-35页 |
| 1 材料与方法 | 第28-30页 |
| ·试验动物及其组织 | 第28页 |
| ·试验试剂、耗材及仪器 | 第28页 |
| ·试验试剂及耗材 | 第28页 |
| ·试验仪器 | 第28页 |
| ·溶液的配制 | 第28页 |
| ·试验方法 | 第28-30页 |
| ·卵泡液及颗粒细胞的分离 | 第28-29页 |
| ·取卵泡 | 第28页 |
| ·抽取卵泡液 | 第28-29页 |
| ·刮取颗粒细胞 | 第29页 |
| ·雌激素和孕酮的测定 | 第29-30页 |
| ·试剂的准备 | 第29页 |
| ·检测程序 | 第29页 |
| ·计算结果 | 第29-30页 |
| 2 结果与分析 | 第30-32页 |
| ·第一卵泡波的确定 | 第30页 |
| ·卵泡液中雌激素和孕激素的测定 | 第30-32页 |
| 3 讨论 | 第32-34页 |
| 4 小结 | 第34-35页 |
| 第四章 荧光定量检测候选基因在牛优势卵泡和从属卵泡中的表达量 | 第35-46页 |
| 1 材料与方法 | 第35-37页 |
| ·试验动物及其组织 | 第35页 |
| ·试验试剂、耗材及仪器 | 第35页 |
| ·试验试剂及耗材 | 第35页 |
| ·试验仪器 | 第35页 |
| ·溶液的配制 | 第35页 |
| ·试验方法 | 第35-37页 |
| ·颗粒细胞Total RNA的提取 | 第35-36页 |
| ·Total RNA完整性和浓度的检测 | 第36页 |
| ·反转录PCR反应 | 第36页 |
| ·qRT-PCR引物设计与合成 | 第36-37页 |
| ·荧光实时定量PCR反应体系与反应条件 | 第37页 |
| ·统计分析 | 第37页 |
| 2 结果与分析 | 第37-41页 |
| ·牛优势卵泡和从属卵泡颗粒细胞总RNA提取结果 | 第37-38页 |
| ·各基因和内参基因RPLPO扩增动力学曲线 | 第38-39页 |
| ·各基因和内参基因RPLPO溶解曲线 | 第39-40页 |
| ·各基因在第一卵泡波优势和从属卵泡中表达差异分析 | 第40-41页 |
| 3 讨论 | 第41-45页 |
| 4 小结 | 第45-46页 |
| 全文结论 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-54页 |
| Abstract | 第54-56页 |
| 附录 | 第56-58页 |
| 致谢 | 第58页 |
