系统动力学在L-苯丙氨酸生物合成过程仿真上的应用
| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-27页 |
| ·前言 | 第9-10页 |
| ·系统生物学 | 第10-13页 |
| ·生物系统结构的辨识 | 第10-11页 |
| ·自下而上的方法 | 第10页 |
| ·自上而下的方法 | 第10-11页 |
| ·混合方法 | 第11页 |
| ·生物系统行为分析 | 第11-12页 |
| ·生物系统的控制与设计 | 第12页 |
| ·生物系统的建模与仿真 | 第12-13页 |
| ·国内外系统生物学研究概况 | 第13-16页 |
| ·国外相关研究 | 第13-15页 |
| ·国内相关研究 | 第15-16页 |
| ·系统动力学 | 第16-23页 |
| ·系统动力学的概念 | 第16-17页 |
| ·因果关联与反馈环路 | 第17-18页 |
| ·因果关联 | 第17页 |
| ·反馈环路 | 第17-18页 |
| ·系统动力学模型的基本元素 | 第18-19页 |
| ·系统方程式 | 第19-20页 |
| ·系统动力学模拟工具ITHINK | 第20-23页 |
| ·ITHINK软件的特点 | 第20-21页 |
| ·ITHINK软件的基本元素 | 第21-22页 |
| ·ITHINK建模步骤 | 第22-23页 |
| ·本文研究目的与研究内容 | 第23-25页 |
| ·研究目的和内容 | 第23-24页 |
| ·研究思路 | 第24-25页 |
| ·参考文献 | 第25-27页 |
| 第二章 仿真动态模型的建立 | 第27-56页 |
| ·L-苯丙氨酸的工业化生产工艺 | 第27-29页 |
| ·发酵法合成 L-苯丙氨酸 | 第27-28页 |
| ·酶法合成 L-苯丙氨酸 | 第28-29页 |
| ·苯丙酮酸-天冬氨酸转氨酶法 | 第28页 |
| ·肉桂酸-苯丙氨酸解氨酶法 | 第28页 |
| ·两步酶转化乙酰氨基肉桂酸法 | 第28-29页 |
| ·发酵法生产 L-苯丙氨酸仿真模型 | 第29-54页 |
| ·E. coli 碳的中央代谢途径的动态模型 | 第30-52页 |
| ·糖酵解途径模型 | 第31-44页 |
| ·戊糖磷酸途径 | 第44-52页 |
| ·芳香族氨基酸合成途径模型 | 第52-54页 |
| ·PEP 和E4P 合成DAHP | 第52-53页 |
| ·从DAHP 到Chro(分支酸) | 第53页 |
| ·由Chro 形成L-苯丙氨酸和L-酪氨酸 | 第53-54页 |
| ·酶法生产 L-苯丙氨酸仿真模型 | 第54-55页 |
| ·参考文献 | 第55-56页 |
| 第三章 仿真结果与讨论 | 第56-69页 |
| ·发酵法合成L-苯丙氨酸仿真 | 第56-64页 |
| ·发酵法仿真模型的可靠性验证 | 第56-59页 |
| ·E. coli碳的中央代谢途径模型的验证 | 第56-58页 |
| ·芳香族氨基酸合成途径模型的验证 | 第58-59页 |
| ·调控方案的模拟分析 | 第59-64页 |
| ·胞外葡萄糖浓度的调控模拟 | 第59页 |
| ·PEP量的调控模拟 | 第59-61页 |
| ·E4P量的调控模拟 | 第61页 |
| ·DAHP合成酶的表达量的调控 | 第61-62页 |
| ·L-酪氨酸的量的调控 | 第62-63页 |
| ·调控方案的优化组合 | 第63-64页 |
| ·酶法生产L-苯丙氨酸仿真 | 第64-68页 |
| ·酶法仿真模型的验证 | 第64-65页 |
| ·模拟两菌双酶法 | 第64页 |
| ·氨基供体与受体浓度的比例对酶反应的影响的模拟 | 第64-65页 |
| ·反应分离耦合的模拟 | 第65-68页 |
| ·参考文献 | 第68-69页 |
| 第四章 结论与展望 | 第69-70页 |
| 附录一 | 第70-81页 |
| 附录二 | 第81-84页 |
| 致谢 | 第84页 |
