| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-12页 |
| 缩略词表 | 第12-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-34页 |
| 1 课题提出 | 第14-15页 |
| 2 植物类胡萝卜素代谢研究进展 | 第15-23页 |
| ·植物类胡萝卜素的生物学意义 | 第15-16页 |
| ·植物类胡萝卜素合成调控 | 第16-23页 |
| 3 柑橘芽变的研究 | 第23-24页 |
| ·芽变的概念及其在柑橘上的应用 | 第23-24页 |
| ·柑橘芽变机理研究概况 | 第24页 |
| 4 柑橘红肉突变体的研究 | 第24-27页 |
| 5 组学技术及其在柑橘上的应用 | 第27-32页 |
| ·转录组学 | 第27-28页 |
| ·蛋白质组学 | 第28-29页 |
| ·比较基因组杂交 | 第29-31页 |
| ·代谢组学 | 第31-32页 |
| 6 本研究的目的与内容 | 第32-34页 |
| 第二章 甜橙红肉突变体及其野生型的蛋白质组分析 | 第34-76页 |
| 1 前言 | 第34-35页 |
| 2 材料方法 | 第35-43页 |
| ·材料 | 第35页 |
| ·方法 | 第35-43页 |
| 3 结果 | 第43-70页 |
| ·柑橘愈伤、果肉、叶片的蛋白质提取与分离 | 第43页 |
| ·红暗柳橙与暗柳橙果肉蛋白质组分析 | 第43-55页 |
| ·红暗柳橙与暗柳橙叶片蛋白质组分析 | 第55-57页 |
| ·红肉脐橙与纽荷尔脐橙果肉蛋白质组分析 | 第57-63页 |
| ·红肉脐橙与纽荷尔脐橙叶片蛋白质组分析 | 第63-66页 |
| ·柑橘质体蛋白质组初探 | 第66-70页 |
| 4 讨论 | 第70-76页 |
| ·蛋白质组学研究中的几个技术性问题 | 第70-71页 |
| ·氧化逆境在红肉芽变性状形成中的作用探讨 | 第71-74页 |
| ·光合作用在红肉芽变性状形成中的作用探讨 | 第74页 |
| ·类胡萝卜素储存调节在红肉芽变中的作用探讨 | 第74-76页 |
| 第三章 红肉突变体红肉脐橙与纽荷尔脐橙的转录组分析 | 第76-90页 |
| 1 前言 | 第76页 |
| 2 材料方法 | 第76-79页 |
| ·材料 | 第76-77页 |
| ·MPSS分析 | 第77-78页 |
| ·Real-time PCR | 第78-79页 |
| 3 结果 | 第79-86页 |
| ·MPSS比较转录组鉴定红肉脐橙与纽荷尔脐橙差异表达基因 | 第79-84页 |
| ·几个差异表达基因的Real-time PCR验证 | 第84-86页 |
| 4 讨论 | 第86-90页 |
| ·参与类胡萝卜素代谢与调控的基因 | 第86-88页 |
| ·转录因子 | 第88-89页 |
| ·转运蛋白 | 第89页 |
| ·氧化逆境相关蛋白 | 第89-90页 |
| 第四章 红暗柳与暗柳甜橙的比较基因组分析 | 第90-104页 |
| 1 前言 | 第90-91页 |
| 2 材料方法 | 第91-96页 |
| ·材料 | 第91页 |
| ·方法 | 第91-96页 |
| 3 结果 | 第96-100页 |
| ·红暗柳橙与暗柳橙DNA的SSR,IRAP与AFLP分析 | 第96页 |
| ·红暗柳橙与暗柳橙的Array-CGH分析 | 第96-98页 |
| ·Real-time PCR验证 | 第98-100页 |
| ·拷贝数变异基因的转录水平与其基因剂量不一致 | 第100页 |
| 4 讨论 | 第100-104页 |
| ·比较基因组杂交：一种潜在的高效分子标记 | 第100-102页 |
| ·拷贝数变异在芽变中的可能作用 | 第102-104页 |
| 第五章 红暗柳与暗柳甜橙的代谢组分析 | 第104-115页 |
| 1 前言 | 第104页 |
| 2 材料方法 | 第104-105页 |
| ·材料 | 第104-105页 |
| ·方法 | 第105页 |
| 3 结果 | 第105-113页 |
| ·负模式下红暗柳橙与暗柳橙果实的质谱鉴定 | 第105-110页 |
| ·正模式下红暗柳橙与暗柳橙果实的质谱鉴定 | 第110-113页 |
| 4 讨论 | 第113-115页 |
| 第六章 总讨论 | 第115-120页 |
| 1 几种组学技术的比较与应用 | 第115-116页 |
| 2 柑橘红肉突变机理研究的几条重要线索 | 第116-118页 |
| 3 一些有应用潜力的基因 | 第118页 |
| 4 未来芽变机理研究设想 | 第118-120页 |
| 参考文献 | 第120-143页 |
| 附录Ⅰ 暗柳橙(A),红暗柳橙(B),纽荷尔脐橙(C)和红肉脐橙(D)果实照片 | 第143-144页 |
| 附录Ⅱ 质体蛋白质组探索中鉴定的暗柳橙蛋白质 | 第144-150页 |
| 附录Ⅲ 质体蛋白质组探索中鉴定的红暗柳橙蛋白质 | 第150-157页 |
| 附录Ⅳ MPSS鉴定到的红肉脐橙和纽荷尔脐橙差异表达的基因 | 第157-178页 |
| 附录Ⅴ MPSS鉴定到的红肉脐橙与纽荷尔脐橙呈现差异的代谢途径 | 第178-180页 |
| 附录Ⅵ 攻读博士期间发表论文 | 第180-182页 |
| 致谢 | 第182-183页 |
