预测血清反应因子(SRF)共调控因子及构建调控网络
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 目录 | 第8-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-16页 |
| ·研究目的及意义 | 第10-11页 |
| ·国内外研究现状 | 第11-14页 |
| ·SRF 背景及研究现状 | 第11-13页 |
| ·转录因子结合位点的预测研究现状 | 第13-14页 |
| ·调控网络研究现状 | 第14页 |
| ·本研究的设想与思路 | 第14-16页 |
| 第二章 材料和方法 | 第16-21页 |
| ·材料 | 第16页 |
| ·CArG 元件及侧翼序列的获得 | 第16页 |
| ·表达量数据的获取 | 第16页 |
| ·方法 | 第16-21页 |
| ·SRF 靶基因的预测 | 第16-17页 |
| ·靶基因按功能聚类 | 第17页 |
| ·SRF 共调控因子的预测 | 第17页 |
| ·惩罚多变量回归筛选共调控因子 | 第17-20页 |
| ·调控网络的构建 | 第20-21页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第21-33页 |
| ·结果 | 第21-31页 |
| ·SRF 靶基因预测结果 | 第21页 |
| ·靶基因按功能聚类 | 第21-22页 |
| ·不同功能类中转录因子结合位点预测结果 | 第22-23页 |
| ·惩罚多变量回归筛选转录因子 | 第23-24页 |
| ·调控网络 | 第24-31页 |
| ·讨论 | 第31-33页 |
| ·SRF 靶基因 | 第31页 |
| ·SRF 共调控因子 | 第31-32页 |
| ·转录调控网络 | 第32-33页 |
| 第四章 本研究的创新、不足与展望 | 第33-34页 |
| 参考文献 | 第34-38页 |
| 附录 | 第38-44页 |
| 致谢 | 第44-45页 |
| 作者简介 | 第45页 |