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偶氮还原酶AZR的结构模型与功能研究

摘要第1-6页
Abstract第6-13页
1 偶氮染料的微生物脱色及相关还原酶的研究进展第13-39页
   ·染料的分类、结构与发色机理第13-15页
     ·染料的分类第13-14页
     ·染料的结构与发色机理第14-15页
   ·偶氮染料的生产应用、危害及各国政策第15-16页
     ·偶氮染料的生产与应用第15页
     ·偶氮染料的危害第15-16页
     ·各国对偶氮染料的相关政策第16页
   ·偶氮染料的微生物处理第16-20页
     ·细菌脱色偶氮染料第18-19页
     ·白腐真菌和酵母菌降解偶氮染料第19-20页
   ·细菌脱色偶氮染料的机理第20-24页
     ·偶氮染料的直接酶脱色第20-21页
     ·介体参与的偶氮染料的生物脱色第21-22页
     ·偶氮呼吸脱色偶氮染料第22-24页
     ·生物无机化合物脱色偶氮染料第24页
   ·偶氮还原酶第24-26页
     ·不含黄素的偶氮还原酶第24页
     ·FMN依赖型偶氮还原酶第24-26页
   ·硝基芳香化合物与硝基还原酶第26-28页
     ·硝基芳香化合物的危害第26-27页
     ·TNT的微生物降解与硝基还原酶第27-28页
   ·醌类化合物与醌还原酶第28-31页
     ·醌类化合物第28-29页
     ·醌还原酶第29-30页
     ·氧化应激与醌还原酶在应对氧化应激中的作用第30-31页
   ·本课题相关生物技术简介第31-36页
     ·基因工程技术及其在环境微生物研究中的应用第31-32页
     ·定点突变及其在污染物降解酶研究中的应用第32-34页
     ·生物信息学方法构建蛋白质三级结构模型第34-36页
   ·本论文研究内容与意义第36-39页
     ·前期研究工作简述及有待解决的问题第36-37页
     ·研究目的第37页
     ·研究内容第37-39页
2 细菌对模拟染料废水的脱色第39-52页
   ·材料与方法第39-43页
     ·实验材料第39-40页
     ·培养基的配制及脱色培养方法第40-41页
     ·菌体生长及染料脱色的测定第41-42页
     ·粗酶的提取第42-43页
     ·蛋白含量测定第43页
     ·酶活分析体系第43页
   ·结果与讨论第43-51页
     ·沼泽红假单胞菌对偶氮染料的脱色第43-48页
     ·三株细菌静止期细胞脱色偶氮染料能力的比较第48-51页
   ·本章小节第51-52页
3 偶氮还原酶AZR结构模型的构建与分析第52-63页
   ·材料与方法第52-54页
     ·序列、服务器、数据库与软件第52-53页
     ·同源建模方法第53-54页
   ·结果与讨论第54-61页
     ·AZR结构模型的建立与评价第54-57页
     ·AZR结构模型的分析第57-59页
     ·AZR的乒乓动力学机理第59页
     ·偶氮还原酶的分类与结构本质第59-61页
   ·本章小节第61-63页
4 AZR的硝基还原酶和FMN还原酶活性第63-76页
   ·材料与方法第63-66页
     ·实验材料第63页
     ·AZR的纯化第63-64页
     ·酶活分析第64-65页
     ·AZR性质考察第65页
     ·TNT还原产物分析第65-66页
   ·结果与讨论 #发第66-75页
     ·pH和温度对AZR硝基还原酶活性的影响第66-67页
     ·AZR的辅酶选择性第67页
     ·AZR还原多硝基甲苯第67-68页
     ·TNT还原产物分析第68-70页
     ·AZR对外加FMN的还原第70-71页
     ·外加FMN对AZR偶氮还原酶和硝基还原酶活性的影响第71-72页
     ·AZR的底物多样性考察第72-73页
     ·AZR为一种新的硝基/FMN还原酶家族成员第73-75页
   ·本章小节第75-76页
5 AZR氨基酸位点Y~(74)、H~(75)和K~(109)的定点突变研究第76-103页
   ·材料与方法第76-84页
     ·实验材料第76-77页
     ·定点突变操作第77-82页
     ·蛋白的纯化第82页
     ·AZR的SDS-PAGE第82-84页
     ·酶活分析第84页
     ·野生型与突变型AZR性质考察第84页
   ·结果与讨论第84-101页
     ·突变位点的选择第84-86页
     ·定点突变操作第86-94页
     ·野生型与突变型AZR的纯化第94-95页
     ·pH对野生型和突变型AZR活性的影响第95-96页
     ·野生型和突变型AZR的动力学性质第96-101页
   ·本章小结第101-103页
6 AZR的醌还原酶活性及其在耐受氧化应激和介导脱色中的应用第103-112页
   ·材料与方法第103-104页
     ·实验材料第103页
     ·序列与结构分析第103页
     ·酶活分析第103-104页
     ·应激源对细菌生长的影响第104页
     ·醌介体参与的偶氮染料的介导脱色第104页
   ·结果与讨论第104-111页
     ·蛋白序列与结构分析第104-106页
     ·AZR的醌还原酶活性第106-108页
     ·AZR对E.coli耐受氧化应激的影响第108-109页
     ·偶氮染料的介导脱色第109-111页
   ·本章小结第111-112页
7 结论与展望第112-115页
   ·主要结论第112-114页
   ·有待深入研究的内容第114-115页
创新点摘要第115-116页
参考文献第116-129页
附录A K109A突变序列测序结果第129-130页
附录B K109H突变序列测序结果第130-132页
附录C Y74W突变序列测序结果第132-135页
附录D H75N突变序列测序结果第135-138页
攻读博士学位期间发表学术论文情况第138-140页
致谢第140-141页
作者简介第141-142页

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