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昆虫Piwi蛋白及microRNA的生物信息学预测与进化分析

摘要第1-8页
Abstract第8-10页
前言第10-12页
第一章 Argonaute蛋白家族的分类及功能的研究进展第12-29页
   ·Argonaute蛋白家族第12-15页
     ·Argonaute蛋白家族的结构第12-13页
     ·Argonaute蛋白家族的功能第13-14页
     ·Argonaute蛋白家族的分类第14-15页
   ·Piwi蛋白家族第15-19页
     ·Piwi蛋白家族的鉴定第15-16页
     ·Piwi蛋白家族的保守性特征第16页
     ·Piwi蛋白家族的结构特征及其相关功能第16-17页
     ·piRNA与Piwi蛋白的相互作用第17-19页
   ·microRNA的研究进展第19-23页
     ·microRNA的简介第19-20页
     ·microRNA的产生第20-21页
     ·microRNA的作用机制第21-22页
     ·microRNA的功能第22-23页
   ·展望前景第23-24页
     ·干细胞的研究以及疾病的治疗第23-24页
     ·piRNA与人类疾病第24页
     ·昆虫microRNA的研究第24页
 参考文献(References)第24-29页
第二章 昆虫Piwi蛋白的生物信息学预测及结构特征分析第29-44页
   ·材料与方法第30-32页
     ·数据搜集第30页
     ·同源搜索第30页
     ·EST延伸以及基因表达分析第30-31页
     ·结构域和模体分析第31页
     ·RT-PCR验证和测序第31页
     ·系统进化树分析第31-32页
   ·结果第32-39页
     ·昆虫Piwi-like基因的预测第32-35页
     ·RT-PCR验证和EST丰度分析第35页
     ·昆虫Piwi亚家族的结构域、模体以及催化残基分析第35-38页
     ·Piwi家族成员的基因结构分析第38页
     ·系统进化分析第38-39页
   ·讨论第39-41页
 参考文献(Reference)第41-44页
第三章 11种果蝇Piwi蛋白的生物信息学预测及进化分析第44-58页
   ·材料和方法第44-45页
     ·数据收集第44-45页
     ·11个果蝇Piwi蛋白的鉴定第45页
     ·蛋白质的结构域及保守基序分析第45页
     ·基因的结构和保守性分析第45页
     ·系统进化分析第45页
   ·结果第45-53页
     ·果蝇中Piwi亚家族基因的预测第45-50页
     ·果蝇Piwi亚家族的基因结构第50-51页
     ·果蝇Ago3基因第三个内含子中重复序列的分析第51-52页
     ·Argonaute家族的进化分析第52-53页
   ·讨论第53-54页
 参考文献(References)第54-58页
第四章 家蚕变态发育相关的microRNA的生物信息学预测第58-73页
   ·实验材料和方法第59-61页
     ·数据来源第59页
     ·家蚕SBS数据中miRNA的预测流程第59-60页
     ·家蚕microRNA基因组定位和成簇分析第60页
     ·家蚕同源的miRNA的分析第60-61页
     ·miRNA芯片分析第61页
     ·定量RT-PCR表达分析第61页
   ·结果与分析第61-69页
     ·家蚕SBS数据miRNA的预测第61-62页
     ·家蚕miRNA的长度分布第62页
     ·家蚕miRNA在基因组上的位置分布第62-63页
     ·昆虫特异性的miRNA第63-65页
     ·家蚕不同发育时期的miRNA表达谱第65-66页
     ·定量PCR验证miRNA表达差异第66-67页
     ·预测与变态发育相关的部分miRNA靶标基因第67-69页
   ·讨论第69-71页
 参考文献(References)第71-73页
第五章 结论第73-76页
致谢第76-78页
在读期间发表和待发表的论文第78-79页
附录:英文名称缩写第79页

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