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猪骨骼肌发育相关新基因家族BTG/TOB的克隆及功能研究

摘要第1-13页
ABSTRACT第13-16页
缩略词表第16-17页
1 文献综述第17-46页
   ·猪基因组的研究现状第18-19页
   ·基因分离的几种方法第19-21页
     ·比较基因图谱在分离新基因中的应用第19-20页
     ·表达序列标签(EST)在分离新基因中的应用第20-21页
     ·候选基因分析法克隆基因第21页
   ·动物基因功能的研究方法第21-27页
     ·基于mRNA水平的基因表达研究方法第22页
     ·测序技术与基因表达的研究第22-23页
     ·PCR技术与基因表达的研究第23页
     ·大规模杂交技术与基因表达的研究第23-24页
     ·单核苷酸多态性第24-25页
     ·基于突变体基础上的基因功能研究第25-26页
     ·基于蛋白质水平上的基因功能研究第26-27页
   ·猪生产性状相关基因研究进展第27-28页
   ·猪骨骼肌生长发育相关基因研究进展第28-34页
     ·骨骼肌的发生、发育基本过程第28-30页
     ·影响骨骼肌肌形成和发育的调控因子第30-34页
       ·肌发生过程中特异的bHLH转录因子第31-32页
       ·成肌增强因子第32-33页
       ·其它影响肌肉生长发育的因子第33-34页
   ·BTG/TOB基因家族研究进展第34-39页
     ·BTG/TOB家族成员的发现第34页
     ·BTG/TOB家族的结构第34-35页
     ·BTG/TOB家族蛋白的特异性降解第35-36页
     ·BTG/TOB家族的生理功能第36-38页
       ·与神经细胞的分化的关系第36页
       ·BTG1与成肌细胞的关系第36-37页
       ·抗增殖与肿瘤发生第37-38页
     ·BTG/TOB家族与其它因子的相互作用第38-39页
       ·BTG1与PRMT1的关系第38页
       ·BTG/TOB家族与Wnt信号途径的关系第38页
       ·BTG/TOB家族与pRB的关系第38-39页
   ·高等动物启动子研究进展第39-46页
     ·启动子的结构第40-41页
       ·原核生物启动子的结构模型第40页
       ·真核生物启动子的结构模型第40-41页
     ·启动子的分类第41-42页
       ·组成型启动子的功能和结构特征第41页
       ·组织特异型启动子的功能和结构第41页
       ·诱导型启动子的功能和结构第41-42页
     ·启动子克隆的意义第42页
     ·启动子克隆的方法第42-44页
       ·利用启动子探针质粒载体筛选启动子第43页
       ·利用PCR技术克隆启动子第43-44页
     ·启动子功能和结构研究的策略第44-45页
       ·转染分析第44页
       ·瞬间表达分析第44-45页
       ·点突变分析第45页
     ·启动子研究存在的问题和展望第45-46页
2 研究目的与意义第46-47页
3 材料与方法第47-66页
   ·试验材料第47-53页
     ·试验样品第47-48页
       ·用于基因分离的DNA样品第47页
       ·用于基因遗传变异检测的猪DNA样品第47页
       ·用于标记-性状关联分析的DNA样品第47页
       ·用于新基因染色体定位的DNA样品第47-48页
       ·用于基因时空表达谱研究的组织样品第48页
     ·菌株、载体、细胞和转染试剂盒第48-50页
       ·菌株第48页
       ·载体第48-49页
       ·用于表达的真核细胞第49页
       ·真核细胞转染用试剂盒第49-50页
     ·主要培养基第50-51页
       ·大肠杆菌培养基第50页
       ·哺乳动物细胞培养基及消化液第50-51页
     ·主要仪器设备第51页
     ·主要试剂第51-52页
     ·主要试剂的配制第52-53页
   ·主要分子生物学软件和网站第53页
     ·主要分子生物学软件第53页
     ·主要生物学网站和数据库第53页
   ·试验方法第53-66页
     ·基因片段的的分离第53-56页
       ·cDNA的电子克隆第53-54页
       ·序列的同源性分析与鉴定第54页
       ·引物设计第54页
       ·PCR扩增条件第54-56页
     ·PCR产物的纯化、克隆与测序第56-57页
     ·IMpRH辐射杂种板定位第57-58页
       ·定位引物设计第57页
       ·定位引物扩增及其分型方法与数据分析第57-58页
     ·基因的表达与功能分析第58-60页
       ·组织和细胞中总RNA提取第58页
       ·总RNA完整性检测第58-59页
       ·总RNA的DNase-I处理第59页
       ·总RNA的反转录第59页
       ·引物设计第59-60页
       ·扩增反应条件第60页
       ·数据分析第60页
     ·猪基因的分型与关联分析第60-61页
       ·PCR扩增反应第60-61页
       ·酶切条件第61页
       ·基因分型第61页
       ·多态标记与性状的关联分析方法第61页
     ·BTG1基因启动子片段的克隆、分析与荧光素酶报告基因表达载体的构建第61-63页
       ·BTG1基因启动子片段的克隆第62页
       ·启动子的转录因子结合位点预测第62页
       ·荧光素酶报告基因表达载体的构建第62-63页
     ·哺乳动物细胞培养、质粒转染与荧光测定第63-66页
       ·复苏方法第63-64页
       ·传代培养第64页
       ·细胞诱导分化第64页
       ·细胞冻存第64-65页
       ·质粒转染第65页
       ·双荧光素酶活性测定第65-66页
4 结果第66-99页
   ·基因片段的分离、序列分析与鉴定结果第66-69页
     ·cDNA的电子克隆结果第66页
     ·猪基因的cDNA及DNA扩增结果第66-68页
     ·扩增产物的序列分析与鉴定结果第68-69页
   ·猪基因的氨基酸序列分析结果第69-75页
     ·BTG1基因的氨基酸序列分析第69-71页
     ·BTG2基因的氨基酸序列分析第71-72页
     ·BTG3基因的氨基酸序列分析第72-74页
     ·三个基因的氨基酸序列比对结果第74-75页
   ·基因在染色体上的定位第75-78页
     ·基因的定位结果第75-77页
     ·基因定位区域与对应染色体上的QTL第77-78页
   ·基因表达研究结果第78-85页
     ·总RNA的甲醛变性胶电泳检测结果第78-79页
     ·cDNA模板质量及引物扩增效果的检测第79页
     ·猪BTG1,BTG2和BTG3基因的组织表达第79-81页
     ·BTG1,BTG2和BTG3在通城和长白猪胚胎不同时期肌肉中的表达第81-83页
     ·BTG1,BTG2和BTG3基因在C2C12细胞分化不同时期的表达第83-85页
       ·C2C12细胞在分化不同时期的形态第83-84页
       ·BTG1,BTG2和BTG3基因在C2C12细胞分化不同时期的表达第84-85页
   ·新分离的基因SNP检测及多态分布第85-94页
     ·BTG1基因的SNP检测与多态分布第85-89页
       ·BTG1基因的SNP检测第85-87页
       ·PCR-RFLP-PsuI多态性在各猪品种中的分布情况第87-88页
       ·PCR-RFLP-Bsh1236I多态性在各猪品种中的分布情况第88-89页
     ·BTG2基因SNP检测及多态分布第89-92页
       ·BTG2基因的SNP检测第89-90页
       ·PCR-RFLP-MvaI多态性在各猪品种中的分布情况第90-92页
     ·BTG3基因多态分布第92-94页
       ·BTG3基因的SNP检测第92-93页
       ·PCR-RFLP-MvaI多态性在各猪品种中的分布情况第93-94页
   ·不同基因多态性与性状的关联分析结果第94-96页
     ·BTG1基因多态与性状关联第94-95页
     ·BTG2基因多态与性状关联第95页
     ·BTG3基因多态与性状关联第95-96页
   ·BTG1基因启动子区的克隆与功能分析第96-99页
     ·BTG1基因启动子区的克隆第96-97页
     ·启动子区转录因子结合位点预测第97页
     ·五个启动子删除片段的荧光报告基因载体的构建第97-99页
5 讨论第99-111页
   ·关于新基因的克隆第99页
   ·关于基因MRNA表达分析的方法第99-101页
   ·关于启动子的克隆第101-104页
   ·关于基因的染色体定位第104-105页
   ·关于猪TBG1/BTG2/BTG3基因的组织表达谱第105页
   ·关于猪TBG1/BTG2/BTG3基因的时空表达谱第105-107页
   ·关于TBG1/BTG2/BTG3基因对成肌细胞分化的作用第107页
   ·关于BTG/TOB基因家族的结构和功能第107-108页
   ·关于基因的SNP与性状关联分析第108-111页
     ·关于SNP检测第108-109页
     ·关于SNP与生产性状的关联第109-111页
6 小结第111-114页
   ·本研究的主要结果和结论第111-112页
   ·本研究的特色和创新点第112-113页
   ·本研究不足之处和进一步的工作第113-114页
参考文献第114-126页
在读期间发表或待发表的论文第126-127页
致谢第127-129页
附录第129-133页

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