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中国南方9个黄牛群体mtDNA D-loop区遗传多样性和起源进化研究

摘要第1-7页
 ABSTRACT第7-11页
前言第11-13页
第一部分 文献综述第13-31页
 第一章 分子进化概述第13-27页
   ·物种系统进化研究的分子标记第13-16页
     ·微卫星和小卫星第13-14页
     ·Y 染色体微卫星第14页
     ·线粒体DNA第14页
     ·单拷贝核基因(scnDNA)第14-15页
     ·SINEs 插入序列第15页
     ·卫星DNA第15-16页
   ·母系进化标记-mtDNA第16-22页
     ·线粒体起源的研究第16页
     ·mtDNA 的序列特征第16-18页
     ·mtDNA D-loop 的序列特点第18-19页
     ·mtDNA 的进化特征第19-20页
     ·mtDNA 的进化速率特征以及它们的应用第20页
     ·mtDNA 的遗传特征第20-21页
     ·mtDNA 作为分子标记使用时的注意事项第21-22页
   ·分子系统发生分析的原理和方法第22-24页
     ·分子系统发生分析第22页
     ·分子钟机理第22页
     ·分子系统发生与系统发生树第22-23页
     ·系统发生树的可靠性第23-24页
   ·mtDNA D-loop 在系统发生研究中的应用进展第24-27页
 第二章 中国黄牛的起源进化和研究进展第27-31页
   ·家牛的起源进化第27-28页
   ·中国黄牛起源进化研究进展第28-31页
第二部分 试验研究第31-63页
 第三章 九个黄牛群体mtDNA 多态性及其母系进化研究第31-43页
   ·材料与方法第31-33页
     ·试验材料第31页
     ·实验方法第31-33页
     ·序列分析第33页
   ·结果与分析第33-40页
     ·mtDNA D-loop 区全序列的PCR 扩增第33页
     ·南方9 个黄牛群体mtDNA D-loop 区全序列的核苷酸组成第33-34页
     ·南方9 个黄牛群体mtDNA D-loop 区的核苷酸变异和多态性分析第34-36页
     ·南方9 个黄牛群体mtDNA D-loop 区单倍型多态性第36-37页
     ·南方9 个黄牛群体间的遗传距离第37页
     ·南方9 个黄牛群体mtDNA D-loop 区单倍型的系统进化分析第37-38页
     ·南方9 个黄牛群体mtDNA D-loop 区单倍型的变异和多态性分析第38-40页
     ·南方9 个黄牛群体基于遗传距离的群体聚类第40页
   ·讨论第40-43页
     ·中国南方9 个黄牛群体mtDNA D-loop 的核苷酸变异第40-41页
     ·中国南方9 个黄牛群体的群体内遗传多样性差异第41-42页
     ·中国南方9 个黄牛群体起源关系第42-43页
 第四章 26 个中国南方黄牛群体mtDNA D-loop 区核苷酸及单倍型多态性第43-49页
   ·材料与方法第43-44页
     ·试验材料第43页
     ·序列分析第43-44页
   ·结果与分析第44-46页
     ·南方26 个黄牛群体mtDNA D-loop 区全序列的核苷酸组成第44页
     ·南方26 个黄牛群体mtDNA D-loop 区核苷酸变异和多态性分析第44-45页
     ·南方26 个黄牛群体mtDNA D-loop 区单倍型多态性第45-46页
     ·南方26 个黄牛群体mtDNA D-loop 区单倍型多样度和系统进化分析第46页
   ·讨论第46-49页
     ·南方26 个黄牛群体的遗传多样性第46-47页
     ·南方26 个黄牛群体的单倍型多样性第47页
     ·南方26 个黄牛群体的遗传组成第47-49页
 第五章 26 个中国南方黄牛群体mtDNA D-loop 区单倍型组多样性及其母系进化研究第49-61页
   ·材料与方法第50页
     ·试验材料第50页
     ·序列分析第50页
   ·结果与分析第50-56页
     ·普通牛mtDNA D-loop 区单倍型分析第50-51页
     ·瘤牛mtDNA D-loop 区单倍型分析第51-54页
     ·中国南方地区26 个黄牛群体mtDNA D-loop 区单倍型汇总第54-55页
     ·中国南方地区26 个黄牛群体的聚类关系第55-56页
   ·讨论第56-61页
     ·中国南方地区黄牛的母系血统来源第56-57页
     ·中国南方黄牛区域性母系遗传组成特征第57页
     ·单倍型i1 和其它单倍型之间的关系第57-58页
     ·地理和遗传信息之间的关系第58-60页
     ·潜在的瘤牛驯化中心第60-61页
 第六章 结论第61-63页
参考文献第63-71页
致谢第71-73页
作者简介第73页

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