中文摘要 | 第1-11页 |
ABSTRACT | 第11-13页 |
一 文献综述 | 第13-31页 |
·猪抗病育种研究现状 | 第13-14页 |
·猪免疫性状相关基因研究进展及在标记辅助育种中的应用 | 第14-16页 |
·泛素—蛋白酶体途径:蛋白质的重要降解途径 | 第16-31页 |
·泛素—蛋白酶体途径的组成 | 第16-21页 |
·泛素 | 第16页 |
·蛋白酶体的组成与结构 | 第16-20页 |
·泛素一蛋白酶体途径中的酶类 | 第20-21页 |
·泛素—蛋白酶体途径的功能 | 第21-23页 |
·泛素—蛋白酶体途径与MHC Ⅰ类分子呈递 | 第21-22页 |
·泛素—蛋白酶体途径与内质网存留蛋白 | 第22页 |
·泛素—蛋白酶体途径与膜蛋白 | 第22页 |
·泛素—蛋白酶体途径与细胞周期 | 第22页 |
·泛素—蛋白酶体途径与NF-kB | 第22页 |
·泛素—蛋白酶体途径与肿瘤发生 | 第22-23页 |
·泛素—蛋白酶体途径的研究进展 | 第23-29页 |
·成熟的蛋白酶体的形成 | 第23页 |
·蛋白酶体水解功能的揭示 | 第23-24页 |
·蛋白酶体基因的研究进展 | 第24-28页 |
·泛素特异蛋白酶基因的研究进展 | 第28-29页 |
·泛素—蛋白酶体途径相关基因的研究前景 | 第29-31页 |
二 本研究的目的和意义 | 第31-32页 |
三 材料与方法 | 第32-48页 |
·材料 | 第32-35页 |
·样品 | 第32-33页 |
·DNA样品 | 第32-33页 |
·组织样品 | 第33页 |
·试剂 | 第33-34页 |
·主要试剂 | 第33页 |
·其它试剂 | 第33页 |
·菌株和培养基 | 第33页 |
·试剂的配制 | 第33-34页 |
·主要仪器设备 | 第34-35页 |
·主要分子生物学软件 | 第35页 |
·方法 | 第35-48页 |
·样品的制备方法 | 第35-36页 |
·样品DNA的提取 | 第35-36页 |
·样品RNA的提取 | 第36页 |
·cDNA的制备 | 第36页 |
·PCR产物的纯化、克隆、鉴定和测序 | 第36-38页 |
·猪泛素—蛋白酶体途径相关基因片段的分离方法 | 第38-39页 |
·电脑克隆策略 | 第38页 |
·候选基因法 | 第38页 |
·引物的设计 | 第38页 |
·PCR扩增条件 | 第38-39页 |
·PCR产物的纯化、克隆,鉴定和测序 | 第39页 |
·序列分析及新基因的鉴定 | 第39页 |
·获得基因CDS的方法 | 第39-40页 |
·引物的设计 | 第39页 |
·RNA的提取 | 第39-40页 |
·cDNA的制备 | 第40页 |
·PCR扩增条件 | 第40页 |
·PCR产物的纯化、克隆,鉴定和测序 | 第40页 |
·序列分析 | 第40页 |
·获得基因组DNA全长的方法 | 第40-41页 |
·引物设计 | 第40页 |
·PCR扩增条件 | 第40-41页 |
·PCR产物的回收纯化和克隆测序 | 第41页 |
·序列分析拼接及同源性检索 | 第41页 |
·基因物理定位的方法 | 第41-42页 |
·引物的设计 | 第41页 |
·PCR分型条件 | 第41-42页 |
·数据分析方法 | 第42页 |
·基因组织表达谱的研究方法 | 第42-43页 |
·引物的设计 | 第42页 |
·组织样的采集及总RNA的提取 | 第42页 |
·cDNA的置备 | 第42页 |
·RT-PCR反应体系 | 第42页 |
·Q-PCR | 第42-43页 |
·基因多态性的检测方法 | 第43-46页 |
·PCR-RFLP | 第43-45页 |
·PCR-DHPLC | 第45-46页 |
·基因型与性状关联的分析方法 | 第46-48页 |
四 结果 | 第48-100页 |
·猪泛素—蛋白酶体途径新基因的片段的分离鉴定 | 第48-64页 |
·所设计的引物 | 第48-52页 |
·猪特异性引物扩增结果 | 第52-53页 |
·扩增产物的序列分析结果 | 第53-61页 |
·扩增产物的鉴定结果 | 第61-64页 |
·猪泛素—蛋白酶体途径新基因的物理定位 | 第64-70页 |
·所设计的引物 | 第64-65页 |
·部分PCR扩增图片 | 第65-66页 |
·PCR分型结果 | 第66-68页 |
·RH定位结果 | 第68-70页 |
·猪泛素—蛋白酶体途径新基因CDS全长和基因组全长的分离 | 第70-78页 |
·总RNA的提取 | 第70页 |
·PSMB4基因CDS全长和基因组全长的分离 | 第70-72页 |
·PSMB6基因CDS全长和基因组全长的分离 | 第72-73页 |
·PSMB8基因CDS全长和基因组全长的分离 | 第73-75页 |
·PSMB9基因CDS全长和部分基因组片段的分离 | 第75页 |
·PSMB10基因CDS全长和基因组全长的分离 | 第75-78页 |
·猪蛋白酶体新基因的多态性检测 | 第78-90页 |
·PSMA1基因的多态性检测 | 第78-80页 |
·PSMA6基因的多态性检测 | 第80-81页 |
·PSMB4基因的多态性检测 | 第81-83页 |
·PSMB6基因的多态性检测 | 第83-86页 |
·PSMB8基因的多态性检 | 第86-87页 |
·PSMB10基因的多态性检测 | 第87-90页 |
·猪泛素—蛋白酶体途径新基因基因型与性状关联的分析 | 第90-96页 |
·PSMA1基因基因型与性状关联的分析 | 第90-91页 |
·PSMA6基因基因型与性状关联的分析 | 第91页 |
·PSMB6基因基因型与性状关联的分析 | 第91-92页 |
·PSMB8基因基因型与性状关联的分析 | 第92-93页 |
·PSMB10基因基因型与性状关联的分析 | 第93-96页 |
·猪蛋白酶体新基因的组织表达谱分析 | 第96-100页 |
·用RT-PCR对PSMB6基因进行组织表达谱分析 | 第96页 |
·用RT-PCR对PSMB8基因进行组织表达谱分析 | 第96-97页 |
·用RT-PCR对PSMB10基因进行组织表达谱分析 | 第97页 |
·用QPCR对PSMB4,PSMB6,PSMB8,PSMB10基因进行组织表达谱分析 | 第97-100页 |
五 讨论 | 第100-109页 |
·关于引物设计的模板 | 第100页 |
·关于如何设计引物 | 第100-102页 |
·进行新基因的分离 | 第100-101页 |
·定位 | 第101页 |
·多态检测 | 第101-102页 |
·关于PCR的扩增条件 | 第102页 |
·关于PCR产物测序 | 第102-103页 |
·关于克隆结果的鉴定 | 第103页 |
·关于新基因的定位 | 第103-104页 |
·关于新基因CDS全长和基因组DNA全长的获得 | 第104-105页 |
·新基因CDS全长的获得 | 第104-105页 |
·新基因基因组DNA全长的获得 | 第105页 |
·关于基因SNP的发现 | 第105-106页 |
·关于基因多态性的检测方法 | 第106-107页 |
·关于基因型与性状关联的分析 | 第107-109页 |
六 小结 | 第109-112页 |
·本研究得到了如下结果 | 第109-110页 |
·本研究的创新点 | 第110页 |
·本研究的不足之处及对进一步研究的建议 | 第110-112页 |
参考文献 | 第112-122页 |
附录1 缩略词表 | 第122-123页 |
附录2 主要性状的中英文对照和缩写 | 第123-124页 |
附录3 五个基因的cDNA序列 | 第124-129页 |
在读期间已发表论文题录 | 第129-130页 |
致谢 | 第130页 |