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拟南芥蛋白质的互作机制及桑树同源基因功能的研究

致谢第1-10页
中文摘要第10-12页
前言第12-13页
第一部分 文献综述第13-38页
 第一章 蛋白质组的研究与酵母双杂交技术第13-18页
  1.蛋白质组的研究第13-16页
   ·蛋白质组学研究的主要领域第13-15页
   ·蛋白质组学研究技术第15-16页
  2.酵母双杂技术综述第16-18页
   ·酵母双杂技术第16页
   ·酵母双杂技术在蛋白质互作研究中的应用第16-17页
   ·酵母双杂技术所用的主要质粒与菌种第17-18页
 第二章 分子生物学研究的模式植物拟南芥及若干基因的研究现状第18-26页
  1.拟南芥的研究现状第18-21页
   ·研究历史第18-19页
   ·研究现状第19-20页
   ·拟南芥中与逆境(温度、水分、盐分)有关基因研究现状第20-21页
  2.拟南芥基因AtCHIP作为E3连接酶的结构与功能研究第21-24页
   ·动物中同源基因CHIP的研究第22-23页
   ·植物基因AtCHIP的研究现状第23-24页
  3.叶绿体蛋白酶基因的研究现状第24-26页
   ·主要蛋白酶基因第24-25页
   ·叶绿体中蛋白酶的分布示意图第25-26页
 第三章 泛素-蛋白酶体系及蛋白质调控第26-28页
  1.泛素-蛋白酶体系第26-27页
   ·泛素第26页
   ·泛素-蛋白酶体系中的主要酶(体)第26-27页
   ·蛋白酶体(proteasome)第27页
  2.泛素-蛋白酶体系与蛋白质降解第27-28页
 第四章 桑树遗传和生物工程的研究与应用进展第28-38页
  1.桑树的遗传资源及其利用第28-32页
   ·桑树种质资源及遗传育种第28-30页
   ·细胞工程及在桑树育种中的应用第30-32页
  2.桑树的基因工程第32-35页
   ·供转化的基因第32页
   ·转化途径第32-33页
   ·桑树转基因研究现状与进展第33-34页
   ·桑树转基因技术存在的问题第34-35页
  3.桑树基因的分离和利用现状第35-38页
   ·植物基因克隆技术第35-36页
   ·桑树等木本植物分子标记和基因克隆第36-38页
第二部分 材料与方法第38-50页
 第五章 材料与方法第38-50页
  1.材料第38-39页
   ·植物材料及处理第38页
   ·主要质粒与酵母菌菌种第38-39页
   ·大肠杆菌质粒与菌株第39页
  2.方法第39-48页
   ·质粒的构建第39-40页
   ·拟南芥cDNA文库的滴定第40页
   ·酵母菌感受态细胞的制备,转化及质粒DNA的提取,纯化第40-41页
   ·大肠杆菌感受态细胞的制备,转化及质粒DNA的提取,纯化第41-42页
   ·AtCHIP互作基因(猎物基因)的筛选第42页
   ·酵母菌双杂技术中假阳性克隆的排除第42页
   ·AtCHIP互作基因DNA序列结果分析第42-43页
   ·PET系统及质粒的构建,蛋白质的表达和提取第43-44页
   ·PET系统表达蛋白的纯化第44-45页
   ·体外泛素—蛋白质结合试验和检测第45页
   ·AtCHIP转基因植株逆境下若干互作蛋白和相关蛋白质的的消长第45页
   ·用基因过量表达,反义技术研究AtCHIP互作基因ClpP4的功能第45-46页
   ·用基因过量表达,反义技术研究AtCHIP互作基因的功能第46页
   ·桑树基因AtNHX1的克隆及拟南芥的转化第46-48页
  3.研究思路与技术路线第48-50页
第三部分 结果与分析第50-81页
 第六章 酵母双杂技术研究拟南芥基因AtCHIP的蛋白质互作基因第50-55页
  1.拟南芥cDNA文库滴定第50-51页
   ·滴定结果第50页
   ·候选阳性克隆的初次筛选第50-51页
  2.阳性“猎物”克隆的筛选第51-52页
   ·酵母菌质粒DNA转化大肠杆菌KC8第51页
   ·KC8质粒DNA的提取,转化第51-52页
  3.假阳性克隆的排除第52-53页
   ·回转试验结果第52页
   ·β-半乳糖培养基筛选第52-53页
  4.阳性克隆DNA测序及分析第53-55页
   ·供测序的阳性克隆DNA第53页
   ·测序结果与拟南芥Genebank分析第53-55页
 第七章 AtCHIP若干互作基因的蛋白质表达及体外泛素—蛋白质结合试验第55-59页
  1.蛋白质表达质粒构建,大肠杆菌BL21转化第55页
  2.目标蛋白的诱导,提取,纯化第55-57页
  3.AtCHIP作E3连接酶的泛素化作用及测验第57-58页
  4.AtCHIP在逆境胁迫下蛋白互作中的位置分析第58-59页
 第八章 AtCHIP转基因植株逆境下若干互作蛋白的消长第59-64页
  1.AtCHIP过量表达植株正常条件下Clp的蛋白质第59页
  2.AtCHIP过量表达植株低温处理下Clp的蛋白质第59-60页
  3.AtCHIP过量表达植株高温处理下Clp的蛋白质第60页
  4.AtCHIP若干互作基因在植物光合修复中的作用第60-64页
   ·植物光损伤后的酶修复体系第60-61页
   ·AtCHIP过量表达植株强光处理下的表型及Clp、Deg和FtsH的蛋白质第61-63页
   ·AtCHIP过量表达植株强光处理下D1蛋白质与AtCHIP的调控第63-64页
 第九章 AtCHIP互作基因ClpP4的功能研究第64-70页
  1.ClpP4基因敲除植株的鉴定第64-66页
  2.ClpP4基因敲除后植株的表型第66-67页
  3.ClpP4基因过量表达及反义转基因植株的鉴定第67-69页
   ·转基因植株的PCR鉴定第67-68页
   ·转基因植株的Northern Blot鉴定第68-69页
   ·转基因植株的Western Blot鉴定第69页
  4.ClpP4基因过量表达及反义转基因植株的表型第69-70页
 第十章 桑树(Morus alba Linne)基因mNHX1的克隆及其功能研究第70-75页
  1.桑树基因NHX1的克隆第70-71页
   ·RT-PCR法合成桑芽cDNA第70-71页
   ·PCR扩增桑芽基因mNHX1 cDNA第71页
   ·mNHX1的克隆、鉴定第71页
  2.桑树基因mNHX1转拟南芥植株的鉴定第71-72页
   ·转基因植株纯系第71页
   ·转基因植株的PCR鉴定第71-72页
  3.拟南芥转基因植株的表型第72-75页
   ·盐浓度与转基因种子发芽率第72-74页
   ·盐浓度与转基因植株的生长第74-75页
 第十一章 讨论与结论第75-81页
  1.讨论第75-79页
   ·酵母菌双杂技术的实践与应用第75页
   ·翻译后蛋白调控第75-76页
   ·AtCHIP互作蛋白UBQ1、UBQ5—泛素因子第76页
   ·AtCHIP互作蛋白UBC8、UBC9和UBC10—泛素缀合酶蛋白E2第76页
   ·AtCHIP互作蛋白ATP依赖性Clp蛋白酶,FtSH蛋白酶第76-77页
   ·AtCHIP是蛋白分解系统原核生物向真核生物发展的一个实例第77-79页
  2.结论第79-81页
参考文献第81-93页
英文摘要第93-97页
附录第97-105页
 附录1.试剂、缓冲液和培养基的配制及主要仪器设备第97-102页
 附录2.主要质粒构图第102-105页
 附录3.博士期间形成的主要学术论文目录第105页

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