| 致谢 | 第1-9页 |
| 摘要 | 第9-11页 |
| ABSTRACT | 第11-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-49页 |
| ·腐霉属的形态和分类学研究 | 第14-26页 |
| ·引言 | 第14页 |
| ·腐霉属分类历史、分类地位及属下分类单位 | 第14-17页 |
| ·分类历史 | 第14-15页 |
| ·分类地位 | 第15-16页 |
| ·属下分类单位 | 第16-17页 |
| ·腐霉形态特征 | 第17-20页 |
| ·营养体 | 第18页 |
| ·孢子囊和游动孢子 | 第18-19页 |
| ·藏卵器、卵孢子和雄器 | 第19-20页 |
| ·腐霉分类研究 | 第20-21页 |
| ·只形成膨大体腐霉 | 第21页 |
| ·异宗配合腐霉 | 第21-22页 |
| ·具重寄生作用腐霉 | 第22-25页 |
| ·我国腐霉分类研究 | 第25-26页 |
| ·腐霉分子系统学研究进展 | 第26-35页 |
| ·蛋白质电泳和同工酶技术 | 第27-28页 |
| ·RFLP技术 | 第28-29页 |
| ·RAPD技术 | 第29-30页 |
| ·nrDNA-ITS技术 | 第30-35页 |
| ·ITS结构 | 第30-32页 |
| ·ITS序列分析过程 | 第32页 |
| ·ITS区域的DNA序列比对 | 第32页 |
| ·ITS序列在腐霉菌鉴定和系统发育分析中的应用 | 第32-35页 |
| ·腐霉菌分类与鉴定研究存在的问题与展望 | 第35-37页 |
| ·本研究的目的与研究思路 | 第37页 |
| 参考文献 | 第37-49页 |
| 第二章 腐霉种的形态学研究 | 第49-66页 |
| ·材料与方法 | 第49-50页 |
| ·培养基 | 第49-50页 |
| ·VP_3选择性培养基 | 第49页 |
| ·CMA培养基 | 第49-50页 |
| ·PCA培养基 | 第50页 |
| ·PS液 | 第50页 |
| ·腐霉种的鉴定 | 第50页 |
| ·鉴定依据 | 第50页 |
| ·鉴定方法 | 第50页 |
| ·培养性状的观察 | 第50页 |
| ·结果与分析 | 第50-59页 |
| ·各腐霉种培养性状及形态特征的描述 | 第51-59页 |
| ·Pythium acanthicum Drechsler | 第51页 |
| ·Pythium aphanidermatum (Edson) Fitzp. | 第51-52页 |
| ·Pythium debaryanum Hesse | 第52-53页 |
| ·Pythium dissotocum Drechsler | 第53-54页 |
| ·Pythium. graminicola Subramanian | 第54页 |
| ·Pythium irregulare Buisman | 第54-55页 |
| ·Pythium myriotylum Drechsler | 第55-56页 |
| ·Pythium oligandrum Drechsler | 第56-57页 |
| ·Pythium spinosum Sawada | 第57页 |
| ·Pythium sylvaticum Campbell & Hendrix | 第57-58页 |
| ·Pythium ultimum var. ultimum Trow | 第58-59页 |
| ·腐霉种的来源及杭州郊区优势腐霉种 | 第59页 |
| ·讨论 | 第59-64页 |
| ·腐霉属模式种与模式菌株 | 第59-61页 |
| ·杭州郊区腐霉优势种 | 第61页 |
| ·腐霉种类分离与鉴定 | 第61-63页 |
| ·异宗配合腐霉种P.sylvaticum的鉴定 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-66页 |
| 第三章 基于ITS序列探讨部分腐霉种的系统发育与其形态特征 | 第66-83页 |
| ·材料与方法 | 第67-70页 |
| ·腐霉基因组DNA的提取 | 第67-69页 |
| ·供试腐霉菌株 | 第67-68页 |
| ·腐霉菌丝体的培养与收集 | 第68页 |
| ·腐霉菌基因组DNA的提取与纯化 | 第68-69页 |
| ·基因组DNA浓度测定 | 第69页 |
| ·腐霉rDNA ITS序列的测定 | 第69-70页 |
| ·PCR反应体系和循环参数 | 第69页 |
| ·PCR扩增产物检测 | 第69页 |
| ·核糖体DNA ITS序列测定 | 第69-70页 |
| ·基于rDNA ITS序列构建系统发育树 | 第70页 |
| ·用于腐霉系统发育分析的菌株 | 第70页 |
| ·系统发育分析 | 第70页 |
| ·结果与分析 | 第70-72页 |
| ·腐霉基因组DNA | 第70页 |
| ·腐霉的系统发育分析及其与形态特征的关系 | 第70-72页 |
| ·杭州郊区9种腐霉与模式菌株或代表性菌株的相似性比较 | 第72页 |
| ·讨论 | 第72-80页 |
| 参考文献 | 第80-83页 |
| 第四章 基于rDNA ITS序列探讨终极腐霉变种之间的亲缘关系 | 第83-90页 |
| ·材料与方法 | 第83-85页 |
| ·终极腐霉菌株的鉴定 | 第83页 |
| ·用P.ultimum特异性引物扩增PCR | 第83-84页 |
| ·供试菌株 | 第84页 |
| ·DNA提取、PCR扩增、序列测定 | 第84页 |
| ·用于构建系统发育树的菌株 | 第84页 |
| ·序列分析和系统树的构建 | 第84-85页 |
| ·结果与分析 | 第85页 |
| ·用特异性和通用PCR引物扩增P.ultimum | 第85页 |
| ·序列比对分析 | 第85页 |
| ·亲缘关系分析 | 第85页 |
| ·讨论 | 第85-89页 |
| 参考文献 | 第89-90页 |
| 第五章 Pythium sylvaticum专一性PCR引物的研究 | 第90-99页 |
| ·材料与方法 | 第90-94页 |
| ·供试菌株 | 第90页 |
| ·PCR种专性引物设计 | 第90-93页 |
| ·引物特异性测定 | 第93页 |
| ·PCR扩增产物检测 | 第93-94页 |
| ·结果与分析 | 第94页 |
| ·P.sylvaticum核糖体内转录间隔区(ITS)核苷酸序列测定和相似性比较 | 第94页 |
| ·寡聚核苷酸PCR引物的设计 | 第94页 |
| ·引物PSF1和PSR2专性扩增P.sylvaticum核糖体DNA的有效性 | 第94页 |
| ·讨论 | 第94-98页 |
| 参考文献 | 第98-99页 |
| 全文小结 | 第99-101页 |
| 附录A 博士期间发表与本论文相关的文章 | 第101-102页 |
| 附录B 图表目录 | 第102-104页 |
| 附录C 主要化学试剂及缓冲液配制 | 第104-105页 |
| 附录D 缩略词 | 第105-106页 |
| 附录E 分子系统研究中序列比对结果 | 第106-113页 |
