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动物microRNA相关核心蛋白的生物信息学分析

摘要第1-10页
Abstract第10-12页
1 引言第12-30页
   ·非编码RNA(non-coding RNA)介绍第12-13页
     ·非编码RNA 及其研究进展第12-13页
     ·非编码RNA 的识别与鉴定第13页
     ·非编码RNA 的功能研究第13页
   ·MicroRNA 介绍及研究进展第13-15页
   ·动物中 microRNA 的生物合成过程第15页
   ·MicroRNA 与靶标mRNA 的作用机制研究进展第15-17页
   ·MicroRNA 的功能研究进展第17-18页
   ·MicroRNA 产生与功能行使中核心蛋白的结构和功能研究第18-23页
     ·RNase III 型蛋白家族第18-21页
     ·Argonaute 蛋白家族第21-23页
     ·Exportin 5 蛋白家族第23页
   ·MicroRNA 发生过程中相关蛋白进化的研究进展第23-24页
   ·MicroRNA 产生中相关蛋白的选择性剪接研究进展第24-26页
   ·MicroRNA 发生过程中相关蛋白的核定位信号研究进展第26页
   ·MicroRNA 靶标预测研究进展第26-27页
   ·MicroRNA 合成中的蛋白在不同组织中的表达研究第27页
   ·MicroRNA 产生中核心蛋白质相互作用研究进展第27-28页
   ·MicroRNA 发生相关核心蛋白中待深入研究的问题第28页
   ·本课题的主要来源、研究内容、目的及意义第28-30页
2 材料与方法第30-35页
   ·数据来源第30页
   ·11 个物种中drosha,dicer,argonaute 和exportin 5 基因的鉴定第30-31页
     ·基本序列的寻找及其在Unigene 和RefSeq 数据库中的搜索第30-31页
     ·不同物种的基因间区数据库的构建及同源蛋白质的搜索第31页
   ·系统发生树的构建第31-32页
   ·选择性剪接转录本的鉴定第32-33页
   ·蛋白家族中结构域的分析第33页
   ·核定位信号的预测第33页
   ·MicroRNA 靶标预测第33-34页
   ·在人类不同组织中的表达分析第34页
   ·蛋白质相互作用网络的构建第34-35页
3 结果与分析第35-52页
   ·MicroRNA 产生过程中编码相关蛋白的基因的鉴定第35-37页
   ·系统发生树的构建第37-40页
   ·选择性剪接转录本的鉴定第40-45页
   ·Drosha,Dicer,Argonaute 和Exportin 5 蛋白的结构域分析第45-48页
   ·核定位信号的预测第48-49页
   ·MicroRNA 靶标预测第49页
   ·在人类不同组织中的表达分析第49-50页
   ·蛋白质相互作用网络研究第50-52页
4 讨论第52-55页
   ·MicroRNA 产生过程中编码相关蛋白的基因的鉴定第52页
   ·系统发生树构建第52页
   ·选择性剪接转录本的鉴定第52-53页
   ·蛋白质结构域的分析第53-54页
   ·核定位信号的预测第54页
   ·MicroRNA 靶标预测第54页
   ·在人类不同组织中的表达分析第54页
   ·蛋白质相互作用网络研究第54-55页
5 结论第55-56页
致谢第56-57页
参考文献第57-68页
附录第68-87页
 附录A 所研究的11 个物种中的蛋白家族的成员及注释第68-73页
 附录B 蛋白质相互作用网络中的基因注释第73-77页
 附录C 蛋白质相互作用网络中基因间的互作关系注释第77-87页
攻读硕士学位期间发表的论文第87页

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