| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-9页 |
| 第一章 综述 | 第9-13页 |
| ·美洲异源四倍体野生稻的分布和形态特征概述 | 第9-10页 |
| ·多倍体中倍增基因的分子进化 | 第10-11页 |
| ·异源多倍体中倍增基因的表达 | 第11-12页 |
| ·研究中存在的问题: | 第12-13页 |
| 第二章 异源四倍体中低拷贝核基因的分子进化 | 第13-42页 |
| 1 引言 | 第13-14页 |
| 2 材料和方法 | 第14-21页 |
| ·植物材料 | 第14-15页 |
| ·单拷贝基因的选择 | 第15-16页 |
| ·实验方法 | 第16-20页 |
| ·总DNA提取 | 第16-17页 |
| ·PCR扩增和纯化回收 | 第17-18页 |
| ·克隆 | 第18-19页 |
| ·连接 | 第18页 |
| ·转化 | 第18-19页 |
| ·提取包含目的片段的质粒DNA | 第19页 |
| ·序列测定 | 第19-20页 |
| ·DNA的测序策略 | 第19-20页 |
| ·测序方法 | 第20页 |
| ·数据处理 | 第20-21页 |
| 3 结果 | 第21-39页 |
| ·总DNA的提取、PCR扩增、质粒酶切和DNA测序 | 第21-22页 |
| ·三个单拷贝核基因的分子进化分析 | 第22-39页 |
| ·Lhs1基因序列 | 第22-28页 |
| ·基因序列特点 | 第22-24页 |
| ·核苷酸多态性 | 第24-25页 |
| ·基因谱系 | 第25页 |
| ·重组、中性进化和核苷酸置换速率 | 第25-28页 |
| ·Waxy基因序列 | 第28-34页 |
| ·基因序列特点 | 第28-30页 |
| ·核苷酸多态性 | 第30页 |
| ·基因谱系树 | 第30页 |
| ·重组、中性进化和核苷酸置换速率 | 第30-34页 |
| ·Gbss Ⅱ基因序列 | 第34-39页 |
| ·基因序列特点 | 第34页 |
| ·核苷酸多态性 | 第34-37页 |
| ·基因谱系 | 第37页 |
| ·重组、中性进化和核苷酸置换速率 | 第37-39页 |
| 4 讨论 | 第39-42页 |
| ·稻属CCDD染色体组异源四倍体低水平的核苷酸多样性 | 第39-40页 |
| ·稻属异源四倍体中C和D染色体组进化动态比较 | 第40-42页 |
| 第三章 异源四倍体倍增基因的表达差异研究 | 第42-56页 |
| 1 引言 | 第42-43页 |
| 2 研究方法 | 第43-51页 |
| ·植物材料和引物设计 | 第43-44页 |
| ·引物设计 | 第44页 |
| ·实验流程 | 第44-51页 |
| ·前期处理去除外源性RNase的污染 | 第44-45页 |
| ·总RNA的提取 | 第45页 |
| ·甲醛-变性琼脂糖凝胶电泳 | 第45-46页 |
| ·除去RNA中的基因组DNA | 第46页 |
| ·反转录 | 第46-47页 |
| ·反转录产物的纯化回收 | 第47-48页 |
| ·聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第48页 |
| ·准备工作见分子克隆指南 | 第48页 |
| ·制胶方法见分子克隆指南 | 第48页 |
| ·不同浓度溶液的配制 | 第48页 |
| ·上样与变性 | 第48页 |
| ·电泳 | 第48-49页 |
| ·银染 | 第49页 |
| ·序列测定 | 第49-51页 |
| 3 结果 | 第51-53页 |
| ·样品总RNA的提取、RT-PCR扩增 | 第51页 |
| ·DNA测序结果 | 第51-52页 |
| ·cDNA-SSCP聚丙烯酰胺凝胶电泳结果 | 第52-53页 |
| ·幼苗期叶片中5对同源基因的cDNA-SSCP统计结果 | 第53页 |
| 4 讨论 | 第53-56页 |
| ·倍增基因对异源四倍体转录物的贡献 | 第53-54页 |
| ·异源多倍体中同源基因沉默机制 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-63页 |
| 读研期间发表的论文 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64页 |
