| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-14页 |
| ·研究背景及意义 | 第9-11页 |
| ·计算机辅助药物设计 | 第11-12页 |
| ·本文主要研究内容与工作 | 第12-14页 |
| 第二章 分子对接概述 | 第14-23页 |
| ·理论基础 | 第14-15页 |
| ·对接原理 | 第15-20页 |
| ·对接的优化方法 | 第15-16页 |
| ·评分函数 | 第16-19页 |
| ·对接中结合位点的选择 | 第19-20页 |
| ·对接方法分类 | 第20-21页 |
| ·分子表达 | 第21-22页 |
| ·常用分子对接软件 | 第22-23页 |
| ·Dock | 第22页 |
| ·AutoDOCK | 第22-23页 |
| 第三章 基于最优化方法的分子对接数学模型建立 | 第23-28页 |
| ·最优化方法的基本理论 | 第23-24页 |
| ·问题分析 | 第24-25页 |
| ·数学建模 | 第25-28页 |
| ·分子对接的网格表达 | 第25页 |
| ·AutoDock-Model建立 | 第25-28页 |
| 第四章 基于克隆选择算法的分子对接设计与实现 | 第28-40页 |
| ·克隆选择算法 | 第28-29页 |
| ·均匀设计原理 | 第29-30页 |
| ·分子对接方法AutoDockCLA的设计 | 第30-34页 |
| ·AutoDock-Model在克隆选择算法中的转化 | 第30-33页 |
| ·基于均匀设计原理的克隆选择算法参数设计 | 第33-34页 |
| ·分子对接方法AutoDockCLA验证 | 第34-40页 |
| ·实验方案 | 第34-37页 |
| ·分子对接流程以及系统配置 | 第37页 |
| ·实验结果与分析 | 第37-40页 |
| 第五章 基于免疫遗传算法的分子对接设计与实现 | 第40-55页 |
| ·免疫遗传算法 | 第40-44页 |
| ·遗传算法 | 第40-42页 |
| ·免疫遗传算法 | 第42-44页 |
| ·分子对接方法AutoDockIGA设计 | 第44-48页 |
| ·分子对接方法AutoDockIGA验证 | 第48-55页 |
| ·实验目的 | 第48-49页 |
| ·实验方案 | 第49-51页 |
| ·分子对接流程以及系统设置 | 第51页 |
| ·实验结果与分析 | 第51-55页 |
| 第六章 总结与展望 | 第55-57页 |
| ·总结 | 第55-56页 |
| ·下一步工作 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-61页 |
| 研究生期间发表的论文与获奖情况 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62页 |