拟南芥突变体网络分析平台开发
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 1 绪论 | 第8-11页 |
| ·研究意义 | 第8页 |
| ·国内外研究现状及发展动态 | 第8-9页 |
| ·拟南芥突变体资源丰富 | 第8-9页 |
| ·拟南芥突变体表型分类标准各异 | 第9页 |
| ·拟南芥相关的功能基因组学、蛋白质组学研究进展 | 第9页 |
| ·网络平台运行环境介绍 | 第9-11页 |
| ·Apache服务器 | 第10页 |
| ·mysql数据库 | 第10页 |
| ·php脚本语言 | 第10-11页 |
| 2 数据本地化与数据库建设 | 第11-19页 |
| ·基本分子生物学信息数据本地化 | 第11-12页 |
| ·DNA数据库 | 第11页 |
| ·蛋白数据库 | 第11-12页 |
| ·SNP数据库 | 第12页 |
| ·UniGene数据库 | 第12页 |
| ·TAIR数据库 | 第12页 |
| ·突变体表型信息数据收集及存储标准 | 第12-14页 |
| ·种子资源数据库 | 第12-13页 |
| ·插入突变体系数据库 | 第13页 |
| ·突变体研究文献 | 第13页 |
| ·突变体信息存储标准 | 第13-14页 |
| ·突变体表型信息注释标准 | 第14页 |
| ·功能基因组学数据资源收集 | 第14-16页 |
| ·基因表达谱信息收集 | 第14-15页 |
| ·蛋白相互作用信息数据收集 | 第15页 |
| ·基因转录调控数据收集 | 第15页 |
| ·蛋白质质谱数据 | 第15-16页 |
| ·蛋白质磷酸化数据 | 第16页 |
| ·不同数据资源数据采集方法 | 第16-17页 |
| ·FTP数据下载支持类 | 第16页 |
| ·网络程序接口下载支持类 | 第16页 |
| ·网站文件数据包下载支持类 | 第16-17页 |
| ·网站页面结果反馈类 | 第17页 |
| ·限制性下载支持类 | 第17页 |
| ·研究本地化数据信息统计 | 第17页 |
| ·数据库建设与数据收录 | 第17-19页 |
| ·数据库建设 | 第17-18页 |
| ·数据整理提交 | 第18页 |
| ·数据库安全控制与完整性检验 | 第18-19页 |
| 3 应用程序开发 | 第19-32页 |
| ·基因表达谱芯片分析程序开发 | 第19-25页 |
| ·R&Bioconductor简介 | 第19页 |
| ·差异表达分析与Limma程序包 | 第19页 |
| ·突变体芯片差异表达分析 | 第19-20页 |
| ·突变体间表达谱关联分析 | 第20-24页 |
| ·在线相关性分析展示工具 | 第24-25页 |
| ·复杂生物关系网络在线展示工具开发 | 第25-28页 |
| ·开发环境介绍 | 第25页 |
| ·程序功能展示 | 第25-28页 |
| ·网络展示页面程序开发 | 第28-32页 |
| ·分析阶段 | 第28页 |
| ·实现阶段 | 第28页 |
| ·发布阶段 | 第28-32页 |
| 4 讨论 | 第32-34页 |
| 结论 | 第34-35页 |
| 参考文献 | 第35-39页 |
| 附录 | 第39-44页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第44-45页 |
| 致谢 | 第45-46页 |
