| 摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5页 |
| 第一章 引言 | 第9-19页 |
| 1.1 影响小麦穗发芽的因素 | 第9-10页 |
| 1.2 小麦穗发芽抗性的鉴定方法 | 第10页 |
| 1.3 穗发芽抗性的遗传研究 | 第10-11页 |
| 1.3.1 种皮颜色相关基因 | 第10-11页 |
| 1.3.2 调控内源激素相关基因 | 第11页 |
| 1.3.3 其它休眠相关基因 | 第11页 |
| 1.4 穗发芽抗性基因的应用 | 第11-15页 |
| 1.5 全基因组关联分析 | 第15-17页 |
| 1.5.1 关联分析的研究方法 | 第15-17页 |
| 1.5.2 关联分析在小麦中的应用 | 第17页 |
| 1.6 三代测序技术 | 第17-18页 |
| 1.6.1 三代测序技术原理 | 第17-18页 |
| 1.6.2 三代测序技术的应用 | 第18页 |
| 1.7 试验目的和意义 | 第18-19页 |
| 第二章 材料与方法 | 第19-24页 |
| 2.1 试验材料 | 第19页 |
| 2.2 试验技术路线 | 第19-20页 |
| 2.3 试验方法 | 第20-24页 |
| 2.3.1 穗发芽抗性表型鉴定 | 第20页 |
| 2.3.2 数据统计分析 | 第20页 |
| 2.3.3 关联分析 | 第20-21页 |
| 2.3.4 小麦种皮颜色扫描 | 第21页 |
| 2.3.5 小麦基因组DNA提取 | 第21页 |
| 2.3.6 穗发芽相关基因三代测序 | 第21-24页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第24-44页 |
| 3.1 小麦发芽率表型数据分析 | 第24页 |
| 3.2 小麦发芽率不同环境下的相关性分析 | 第24-28页 |
| 3.3 小麦发芽率的全基因组关联分析 | 第28-32页 |
| 3.4 小麦种皮颜色与发芽率 | 第32-33页 |
| 3.4.1 小麦种皮颜色参数H值与发芽率的相关性分析 | 第32-33页 |
| 3.4.2 小麦种皮颜色参数H值的全基因组关联分析 | 第33页 |
| 3.5 GWAS结果中显著关联位点的单体型分析 | 第33-37页 |
| 3.5.1 TaMYB10(R)基因的单体型分析 | 第34-36页 |
| 3.5.2 籽粒发芽率中5B上显著SNP位点的单体型分析 | 第36-37页 |
| 3.6 利用PacBio RS II技术对小麦穗发芽抗性基因进行等位变异挖掘 | 第37-41页 |
| 3.6.1 构建PacBio RS II测序文库 | 第37-40页 |
| 3.6.2 穗发芽抗性基因不同等位变异发芽率分析 | 第40-41页 |
| 3.7 讨论 | 第41-44页 |
| 3.7.1 全基因组关联分析 | 第41-42页 |
| 3.7.2 小麦穗发芽抗性中R基因的遗传机制 | 第42页 |
| 3.7.3 三代测序技术 | 第42-44页 |
| 参考文献 | 第44-50页 |
| 致谢 | 第50-51页 |
| 作者简介 | 第51页 |
