| 摘要 | 第8-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-20页 |
| 1.1 甘薯研究概述 | 第10-11页 |
| 1.1.1 甘薯简介 | 第10页 |
| 1.1.2 紫薯 | 第10页 |
| 1.1.3 甘薯基因组信息研究进展 | 第10-11页 |
| 1.2 花青素研究概述 | 第11-13页 |
| 1.2.1 花青素的生理功能 | 第11-12页 |
| 1.2.2 花青素的生物合成与调控 | 第12-13页 |
| 1.3 逆境胁迫相关主要转录因子研究进展 | 第13-15页 |
| 1.3.1 MYB转录因子 | 第13-14页 |
| 1.3.2 bZIP转录因子 | 第14页 |
| 1.3.3 AP2/EREBP转录因子 | 第14页 |
| 1.3.4 SPL转录因子 | 第14-15页 |
| 1.3.5 甘薯逆境胁迫相关转录因子研究进展 | 第15页 |
| 1.4 植物miRNA研究进展 | 第15-18页 |
| 1.4.1 植物miRNA的生成机制 | 第15-16页 |
| 1.4.2 植物miRNA的作用机制 | 第16页 |
| 1.4.3 植物miRNA的生物学功能 | 第16-18页 |
| 1.4.4 miRNA的分离和鉴定 | 第18页 |
| 1.4.5 miRNA靶基因的鉴定 | 第18页 |
| 1.5 研究目的与意义 | 第18-20页 |
| 第二章 小RNA和降解组测序挖掘甘薯花青素合成及逆境胁迫相关miRNA及其靶基因 | 第20-42页 |
| 2.1 试验材料 | 第20页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第20页 |
| 2.1.2 试剂与仪器 | 第20页 |
| 2.2 试验方法 | 第20-24页 |
| 2.2.1 总RNA的提取和质量检测 | 第20-21页 |
| 2.2.2 转录组文库的构建、测序及数据分析 | 第21页 |
| 2.2.3 Small RNA文库的构建、测序及数据分析 | 第21-22页 |
| 2.2.4 已知miRNA的预测 | 第22页 |
| 2.2.5 新miRNA的预测 | 第22页 |
| 2.2.6 miRNA的差异表达分析 | 第22页 |
| 2.2.7 降解组文库的构建、测序及数据分析 | 第22页 |
| 2.2.8 靶基因鉴定及剪切位点 | 第22-23页 |
| 2.2.9 qRT-PCR验证差异表达的miRNA及其靶基因 | 第23-24页 |
| 2.3 结果与分析 | 第24-36页 |
| 2.3.1 RNA质量检测 | 第24页 |
| 2.3.2 转录组测序结果 | 第24-25页 |
| 2.3.3 小RNA测序结果 | 第25-27页 |
| 2.3.4 已知miRNA的鉴定 | 第27-28页 |
| 2.3.5 新miRNA的鉴定 | 第28页 |
| 2.3.6 miRNA差异表达分析 | 第28-29页 |
| 2.3.7 降解组测序信息 | 第29-30页 |
| 2.3.8 靶基因剪切位点的鉴定 | 第30-31页 |
| 2.3.9 差异表达miRNA靶基因的GO和KEGG分析 | 第31-33页 |
| 2.3.10 甘薯花青素合成和逆境胁迫相关miRNA | 第33-36页 |
| 2.3.11 miRNA及靶基因的qRT-PCR验证 | 第36页 |
| 2.4 讨论 | 第36-42页 |
| 2.4.1 甘薯高通量测序 | 第36-38页 |
| 2.4.2 甘薯花青素合成相关miRNA | 第38-39页 |
| 2.4.3 miRNA-target调控甘薯花青素合成模型 | 第39页 |
| 2.4.4 甘薯响应逆境胁迫的miRNA | 第39-40页 |
| 2.4.5 花青素积累对植物抗逆胁迫的影响 | 第40-42页 |
| 第三章 甘薯二倍体近缘野生种三裂叶薯MYB转录因子全基因组分析及逆境胁迫响应 | 第42-52页 |
| 3.1 试验材料 | 第42页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第42页 |
| 3.1.2 试剂与仪器 | 第42页 |
| 3.2 试验方法 | 第42-43页 |
| 3.2.1 MYB转录因子的鉴定与理化性质分析 | 第42页 |
| 3.2.2 MYB基因的染色体定位和结构分析 | 第42-43页 |
| 3.2.3 R2R3-MYB类蛋白的系统进化分析 | 第43页 |
| 3.2.5 qRT-PCR检测干旱和盐胁迫下ItbMYB基因表达 | 第43页 |
| 3.3 结果与分析 | 第43-50页 |
| 3.3.1 MYB家族成员鉴定与理化性质分析 | 第43-44页 |
| 3.3.2 MYB基因的染色体定位 | 第44-45页 |
| 3.3.3 MYB基因结构和基序组成分析 | 第45-48页 |
| 3.3.4 R2R3-MYB类蛋白的系统进化分析 | 第48页 |
| 3.3.5 R2R3-MYB在干旱胁迫下的表达分析 | 第48-49页 |
| 3.3.6 R2R3-MYB在盐胁迫下的表达分析 | 第49-50页 |
| 3.4 讨论 | 第50-52页 |
| 第四章 IbMYB4-like的克隆和生物信息学分析 | 第52-60页 |
| 4.1 试验材料 | 第52页 |
| 4.1.1 植物材料 | 第52页 |
| 4.1.2 试剂与仪器 | 第52页 |
| 4.2 试验方法 | 第52-54页 |
| 4.2.1 基因的克隆 | 第52-53页 |
| 4.2.2 大肠杆菌转化与阳性克隆筛选 | 第53页 |
| 4.2.3 IbMYB4-like基因的生物信息学分析 | 第53-54页 |
| 4.3 结果与分析 | 第54-59页 |
| 4.3.1 IbMYB4-like基因的扩增 | 第54页 |
| 4.3.2 IbMYB4-like的生物信息学分析 | 第54-59页 |
| 4.4 讨论 | 第59-60页 |
| 第五章 全文结论与展望 | 第60-62页 |
| 5.1 结论 | 第60-61页 |
| 5.2 展望 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-72页 |
| Abstract | 第72-74页 |
| 附录 | 第76-86页 |
| 研究生期间发表论文 | 第86-88页 |
| 致谢 | 第88页 |
