| 摘要 | 第5-8页 |
| ABSTRACT | 第8-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-29页 |
| 1 目前蛋鸭的研究现状 | 第15-16页 |
| 2 蛋鸭的不同养殖方式 | 第16-18页 |
| 2.1 地面平养 | 第16-17页 |
| 2.2 网上平养 | 第17页 |
| 2.3 笼养 | 第17-18页 |
| 3 家禽肠道微生物的研究进展 | 第18-26页 |
| 3.1 家禽肠道微生物的概念 | 第18-19页 |
| 3.2 家禽肠道的优势菌群 | 第19-20页 |
| 3.3 肠道微生物的作用 | 第20-23页 |
| 3.3.1 微生物--宿主代谢 | 第21页 |
| 3.3.2 免疫调节 | 第21-22页 |
| 3.3.3 影响宿主生长性能 | 第22-23页 |
| 3.4 影响家禽肠道微生物菌群结构的因素 | 第23-26页 |
| 3.4.1 遗传因素 | 第23页 |
| 3.4.2 环境因素 | 第23-24页 |
| 3.4.3 饮食和饲料添加剂 | 第24-25页 |
| 3.4.4 日龄 | 第25-26页 |
| 4 16S RRNA基因高通量测序技术的研究进展 | 第26-27页 |
| 4.1 16S rRNA的基础概念 | 第26页 |
| 4.2 16S rRNA的结构 | 第26-27页 |
| 4.3 16S rRNA的进展 | 第27页 |
| 5 研究目的和意义 | 第27-29页 |
| 第二章 不同的养殖方式对绍兴鸭的肠道微生物群落组成和宿主生理机能的影响 | 第29-57页 |
| 1 引言 | 第29-30页 |
| 2 材料与方法 | 第30-37页 |
| 2.1 实验材料 | 第31-34页 |
| 2.1.1 动物的饲养和管理 | 第31页 |
| 2.1.2 表型测定和肠腔内容物的收集 | 第31-33页 |
| 2.1.3 肝脏和血清生理生化指标的测定 | 第33-34页 |
| 2.2 实验方法 | 第34-37页 |
| 2.2.1 DNA的提取和16S rRNA扩增子测序 | 第34页 |
| 2.2.2 16S rRNA高通量测序数据分析 | 第34-35页 |
| 2.2.3 细菌多样性分析 | 第35页 |
| 2.2.4 共表达网络分析 | 第35页 |
| 2.2.5 基于16S rRNA基因的宏基因组功能预测 | 第35-36页 |
| 2.2.6 统计分析 | 第36-37页 |
| 3 结果 | 第37-52页 |
| 3.1 不同养殖方式下绍兴鸭的蛋品质 | 第37页 |
| 3.2 不同养殖方式下肝脏和血清生化指标的变化 | 第37-39页 |
| 3.3 肠道和肝脏石蜡切片的形态学描述 | 第39-41页 |
| 3.4 不同养殖方式下绍兴鸭不同肠段的肠道菌群 | 第41-42页 |
| 3.5 肠道微生物丰富度,多样性和组成的差异 | 第42-45页 |
| 3.6 胃肠道不同肠段微生物群落组成 | 第45-47页 |
| 3.7 两种不同养殖方式下绍兴鸭肠道微生物KEGG功能预测 | 第47-51页 |
| 3.8 网养和地面平养条件下盲肠微生物组成与表型的相关性分析 | 第51-52页 |
| 4 讨论 | 第52-55页 |
| 4.1 不同养殖方式对绍兴鸭不同肠段微生物的组成的影响 | 第53页 |
| 4.2 不同养殖方式下不同肠段的优势菌群与相关功能分析 | 第53-55页 |
| 4.3 盲肠微生物与不同养殖方式的相关性分析 | 第55页 |
| 5 小结 | 第55-57页 |
| 第三章 添加益生菌对蛋鸭生长性状及肠道微生物组成、功能差异分析 | 第57-88页 |
| 1 引言 | 第57-58页 |
| 2 材料与方法 | 第58-62页 |
| 2.1 实验材料 | 第58-61页 |
| 2.1.1 益生菌 | 第58页 |
| 2.1.2 实验动物管理及基础日粮 | 第58-60页 |
| 2.1.3 表型测定与回肠、盲肠内容物样品的采集 | 第60页 |
| 2.1.4 血清生化指标 | 第60页 |
| 2.1.5 回、盲肠组织石蜡切片及HE染色 | 第60-61页 |
| 2.2 实验方法 | 第61-62页 |
| 2.2.1 DNA提取 | 第61页 |
| 2.2.2 16S rRNA扩增子测序与分析 | 第61-62页 |
| 3 结果 | 第62-83页 |
| 3.1 产蛋性能 | 第62-66页 |
| 3.2 血清生化指标 | 第66-72页 |
| 3.2.1 血清蛋白指标 | 第66-67页 |
| 3.2.2 血清抗氧化指标 | 第67-69页 |
| 3.2.3 血清免疫指标 | 第69-71页 |
| 3.2.4 血清激素水平 | 第71-72页 |
| 3.3 回、盲肠肠道组织切片形态学分析 | 第72-76页 |
| 3.3.1 益生菌对回肠肠组织的形态学影响 | 第72-74页 |
| 3.3.2 益生菌对盲肠肠组织的形态学影响 | 第74-76页 |
| 3.4 益生菌对山麻鸭肠道微生物组成的影响 | 第76-83页 |
| 4 讨论 | 第83-86页 |
| 4.1 饲粮中添加益生菌对山麻鸭生长性能的影响 | 第83-84页 |
| 4.2 饲粮中添加益生菌对山麻鸭血清生化指标的影响 | 第84-85页 |
| 4.3 饲粮中添加益生菌对山麻鸭肠道组织形态学的影响 | 第85页 |
| 4.4 饲粮中添加益生菌对山麻鸭肠回肠、盲肠菌群组成的影响 | 第85-86页 |
| 5 小结 | 第86-88页 |
| 参考文献 | 第88-97页 |
| 附录A 缩略词表 | 第97-98页 |
| 攻读学位期间取得的研究成果 | 第98-99页 |
| 致谢 | 第99-101页 |
