| 摘要 | 第10-12页 |
| Abstract | 第12-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-30页 |
| 1.1 海洋微生物的多样性 | 第14页 |
| 1.2 沉积物微生物群落多样性的研究方法 | 第14-17页 |
| 1.2.1 传统方法 | 第14-15页 |
| 1.2.2 现代分子生物学技术在微生物多样性中的应用 | 第15-17页 |
| 1.3 PICRUSt群落功能预测 | 第17-18页 |
| 1.4 石油的组成及生物海洋的环境行为 | 第18-21页 |
| 1.4.1 石油的组分 | 第18页 |
| 1.4.2 石油的地球化学行为 | 第18-19页 |
| 1.4.3 正构烷烃和多环芳烃(PAHs)的化学指示意义 | 第19-21页 |
| 1.5 石油污染对微生物多样性的影响 | 第21-23页 |
| 1.5.1 石油降解微生物的研究 | 第21-22页 |
| 1.5.2 石油污染的微生物多样性的影响 | 第22页 |
| 1.5.3 烷烃降解基因alkB基因的研究进展 | 第22-23页 |
| 1.6 海洋沉积物的粒度分析 | 第23-24页 |
| 1.7 海洋的重金属污染 | 第24-28页 |
| 1.7.1 金属污染来源、迁移转化及危害 | 第25-26页 |
| 1.7.2 重金属污染的评价 | 第26-28页 |
| 1.7.3 重金属污染对近海沉积物中微生物群落的影响 | 第28页 |
| 1.8 本文研究的目的、意义和主要创新点 | 第28-30页 |
| 第二章 沉积物正构烷烃和多环芳烃分布特征 | 第30-52页 |
| 2.1 设备与试剂 | 第30-31页 |
| 2.1.1 标准品与主要试剂药品 | 第30-31页 |
| 2.1.2 试验仪器与设备 | 第31页 |
| 2.2 试验方法 | 第31-35页 |
| 2.2.1 海洋沉积物站位设置和样品采集 | 第31-32页 |
| 2.2.2 沉积物样品的前处理 | 第32-33页 |
| 2.2.3 烷烃和多环芳烃地气-质分析 | 第33-35页 |
| 2.2.4 烷烃、多环芳烃测试的质量控制 | 第35页 |
| 2.3 结果与分析 | 第35-50页 |
| 2.3.1 沉积物中烷烃的分布特征及指示意义 | 第35-44页 |
| 2.3.2 沉积物中多环芳烃的分布特征及指示意义 | 第44-50页 |
| 2.4 小结 | 第50-52页 |
| 第三章 沉积物中重金属污染特征及其与石油污染的关系 | 第52-75页 |
| 3.1 设备和试剂 | 第52页 |
| 3.2 试验方法 | 第52-55页 |
| 3.2.1 海洋沉积物的粒度分析 | 第52-53页 |
| 3.2.2 金属离子ICP-OES的测定 | 第53-54页 |
| 3.2.3 汞离子的测定 | 第54页 |
| 3.2.4 凯氏定氮法测定氮含量 | 第54-55页 |
| 3.2.5 采用国标法-重铬酸钾氧化-还原容量法测定TOC含量 | 第55页 |
| 3.2.6 采用国标的钒钼酸铵分光光度法测定TP含量 | 第55页 |
| 3.3 结果和分析 | 第55-73页 |
| 3.3.1 沉积物的粒度分析 | 第55-58页 |
| 3.3.2 沉积物重金属等离子的分布特征及污染评价 | 第58-64页 |
| 3.3.3 沉积物的TOC、TN和TP的含量分析 | 第64-66页 |
| 3.3.4 重金属的生态风险评价 | 第66-69页 |
| 3.3.5 粒度对重金属分布的影响 | 第69页 |
| 3.3.6 重金属、粒度等理化特征的相关性分析 | 第69-71页 |
| 3.3.7 重金属的主成分分析和污染来源解析 | 第71-73页 |
| 3.4 小结 | 第73-75页 |
| 第四章 石油污染沉积物中微生物的群落结构特征研究 | 第75-104页 |
| 4.1 设备与试剂 | 第75页 |
| 4.1.1 标准品与主要试剂药品 | 第75页 |
| 4.1.2 设备与仪器 | 第75页 |
| 4.2 试验方法 | 第75-80页 |
| 4.2.1 沉积物总DNA的提取 | 第75-76页 |
| 4.2.2 沉积物中细菌总量的荧光定量分析 | 第76-77页 |
| 4.2.3 荧光定量PCR测定沉积物中alkB基因拷贝数 | 第77-78页 |
| 4.2.4 DNA浓度的测定和质粒拷贝数的计算 | 第78页 |
| 4.2.5 高通量测序数据分析 | 第78-80页 |
| 4.3 结果与分析 | 第80-102页 |
| 4.3.1 样品基因组DNA提取和检测 | 第80-81页 |
| 4.3.2 细菌的定量PCR | 第81-83页 |
| 4.3.3 alkB的定量PCR分析 | 第83-87页 |
| 4.3.4 沉积物中细菌丰度和多样性指数的变化规律 | 第87-89页 |
| 4.3.5 沉积物中微生物群落结构分析 | 第89-97页 |
| 4.3.6 海洋沉积物的聚类比较分析 | 第97-99页 |
| 4.3.7 不同环境因子与沉积物菌群结构的关联分析 | 第99-102页 |
| 4.4 小结 | 第102-104页 |
| 第五章 石油污染与细菌群落的关联模型及代谢功能的差异 | 第104-126页 |
| 5.1 设备与试剂 | 第104-105页 |
| 5.2 试验方法 | 第105-106页 |
| 5.2.1 沉积物的典型样品筛选和分组 | 第105页 |
| 5.2.2 不同石油污染组间的差异物种分析 | 第105页 |
| 5.2.3 细菌群落结构的随机森林分析区分石油污染程度 | 第105-106页 |
| 5.2.4 细菌群落的PICRUSt功能预测 | 第106页 |
| 5.3 结果与分析 | 第106-124页 |
| 5.3.1 沉积物样品的筛选和分组 | 第106-109页 |
| 5.3.2 石油污染相关联的差异物种筛选 | 第109-115页 |
| 5.3.3 不同石油污染组的随机森林分析及ROC曲线验证 | 第115-117页 |
| 5.3.4 KEGGpathway的统计和差异分析 | 第117-119页 |
| 5.3.5 COG的统计和差异分析 | 第119-124页 |
| 5.4 小结 | 第124-126页 |
| 第六章 海洋土著降解石油微生物的筛选 | 第126-144页 |
| 6.1 设备与试剂 | 第127-128页 |
| 6.1.1 主要试剂 | 第127页 |
| 6.1.2 培养基 | 第127页 |
| 6.1.3 主要仪器设备 | 第127-128页 |
| 6.2 试验方法 | 第128-130页 |
| 6.2.1 不同组分烃类降解菌的富集、分离纯化 | 第128页 |
| 6.2.2 烃类降解菌的生物学鉴定 | 第128-129页 |
| 6.2.3 水溶性粗多糖的提取与纯化 | 第129页 |
| 6.2.4 石油降解菌株降解能力的测定 | 第129-130页 |
| 6.2.5 高效石油烃降解菌群的构建及石油烃降解能力测定 | 第130页 |
| 6.3 结果与分析 | 第130-142页 |
| 6.3.1 唯一碳源在不同培养条件下分离的菌株统计分析 | 第130-134页 |
| 6.3.2 不同碳源中可培养石油烃降解菌的比较分析 | 第134-137页 |
| 6.3.3 多糖的分离纯化和红外光谱分析 | 第137-138页 |
| 6.3.4 分离到的可培养菌石油降解能力的测定 | 第138-140页 |
| 6.3.5 组合菌及多糖对石油降解能力的初步研究 | 第140-142页 |
| 6.4 小结 | 第142-144页 |
| 主要结论 | 第144-146页 |
| 参考文献 | 第146-155页 |
| 附录一 可培养烃类降解菌系统发育树 | 第155-159页 |
| 附录二 各分类典型KEGGPathways | 第159-162页 |
| 致谢 | 第162-163页 |
| 攻读博士期间发表的学术论文 | 第163-164页 |
