| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第10-21页 |
| 1.1 线粒体基因组的研究概述 | 第10-15页 |
| 1.1.1 线粒体基因组的性质 | 第10页 |
| 1.1.2 线粒体基因组的组成 | 第10-12页 |
| 1.1.3 线粒体基因组的遗传特征 | 第12页 |
| 1.1.4 线粒体基因组的研究方法 | 第12-15页 |
| 1.1.5 双壳纲动物的线粒体基因组研究进展 | 第15页 |
| 1.2 核基因的研究概述 | 第15-18页 |
| 1.2.1 常用核基因及其应用 | 第15-17页 |
| 1.2.2 核基因在双壳类研究中的应用 | 第17-18页 |
| 1.3 岩扇贝的研究概述 | 第18-20页 |
| 1.3.1 分类、分布及命名 | 第18-19页 |
| 1.3.2 生物学特征 | 第19页 |
| 1.3.3 国内外研究进展 | 第19-20页 |
| 1.4 本研究的目的及意义 | 第20-21页 |
| 第二章 岩扇贝线粒体基因组的测定及其与三种扇贝的比较分析 | 第21-39页 |
| 2.1 引言 | 第21页 |
| 2.2 材料与方法 | 第21-25页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第21页 |
| 2.2.2 线粒体基因组的测序 | 第21-23页 |
| 2.2.3 数据分处理与析 | 第23-25页 |
| 2.3 结果 | 第25-36页 |
| 2.3.1 岩扇贝线粒体基因组的组装与分析 | 第25-31页 |
| 2.3.2 岩扇贝与海湾扇贝、栉孔扇贝、虾夷扇贝线粒体基因组的比较分析 | 第31-36页 |
| 2.4 讨论 | 第36-39页 |
| 2.4.1 岩扇贝线粒体基因组组成分析 | 第36页 |
| 2.4.2 四种扇贝线粒体基因组的碱基组成分析 | 第36-37页 |
| 2.4.3 四种扇贝PCGs的起始/终止密码子分析 | 第37页 |
| 2.4.4 四种扇贝的基因排列分析 | 第37页 |
| 2.4.5 系统进化分析 | 第37-39页 |
| 第三章 扇贝线粒体Cytb和12S基因的遗传变异及亲缘关系探讨 | 第39-52页 |
| 3.1 引言 | 第39页 |
| 3.2 材料与方法 | 第39-45页 |
| 3.2.1 主要仪器设备 | 第39-40页 |
| 3.2.2 主要试剂 | 第40页 |
| 3.2.3 实验材料 | 第40-41页 |
| 3.2.4 基因组DNA的提取 | 第41页 |
| 3.2.5 引物设计 | 第41-42页 |
| 3.2.6 PCR扩增 | 第42-43页 |
| 3.2.7 PCR产物回收 | 第43页 |
| 3.2.8 回收产物的连接 | 第43页 |
| 3.2.9 DNA片段的克隆和测序 | 第43-44页 |
| 3.2.10 数据处理与分析 | 第44-45页 |
| 3.3 结果 | 第45-50页 |
| 3.3.1 Cytb基因序列的碱基组成 | 第45-46页 |
| 3.3.2 12S rRNA基因序列的碱基组成 | 第46页 |
| 3.3.3 Cytb和12SrRNA基因序列的遗传变异 | 第46-47页 |
| 3.3.4 种间遗传距离 | 第47-48页 |
| 3.3.5 系统发育树构建 | 第48-50页 |
| 3.4 讨论 | 第50-52页 |
| 3.4.1 Cytb基因和12SrRNA基因序列的碱基组成分析 | 第50页 |
| 3.4.2 Cytb基因和12SrRNA基因序列的遗传变异分析 | 第50页 |
| 3.4.3 种间遗传距离分析 | 第50-51页 |
| 3.4.4 系统进化分析 | 第51-52页 |
| 第四章 扇贝核糖体ITS1和5SrDNA序列的遗传变异及亲缘关系探讨 | 第52-61页 |
| 4.1 引言 | 第52页 |
| 4.2 材料与方法 | 第52-54页 |
| 4.2.1 主要仪器设备 | 第52-53页 |
| 4.2.2 主要试剂 | 第53页 |
| 4.2.3 实验材料 | 第53页 |
| 4.2.4 基因组DNA的提取 | 第53页 |
| 4.2.5 引物设计 | 第53页 |
| 4.2.6 PCR扩增 | 第53页 |
| 4.2.7 PCR产物回收 | 第53页 |
| 4.2.8 PCR产物回收 | 第53页 |
| 4.2.9 回收产物的连接 | 第53-54页 |
| 4.2.10 数据分析 | 第54页 |
| 4.3 结果 | 第54-59页 |
| 4.3.1 ITS1序列的碱基组成及遗传变异 | 第54-55页 |
| 4.3.2 5S rDNA序列的碱基组成及遗传变异 | 第55-56页 |
| 4.3.3 种间遗传距离 | 第56-57页 |
| 4.3.4 系统发育树构建 | 第57-59页 |
| 4.4 讨论 | 第59-61页 |
| 4.4.1 ITS1序列特征分析 | 第59页 |
| 4.4.2 5S rDNA序列特征分析 | 第59-60页 |
| 4.4.3 ITS1和5SrDNA序列的遗传变异分析 | 第60页 |
| 4.4.4 种间遗传距离分析 | 第60页 |
| 4.4.5 系统进化分析 | 第60-61页 |
| 结论 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-73页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第73-76页 |
| 致谢 | 第76页 |
