| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 引言 | 第12-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-24页 |
| 1.1 水体氮污染现状及危害 | 第13-15页 |
| 1.1.1 水体氮污染现状 | 第13-14页 |
| 1.1.2 水体氮污染危害 | 第14-15页 |
| 1.2 生物脱氮途径及相关脱氮技术 | 第15-17页 |
| 1.3 脱氮相关细菌研究进展 | 第17-18页 |
| 1.4 细菌氮代谢相关酶的研究进展 | 第18-21页 |
| 1.4.1 氨单加氧酶 | 第18-19页 |
| 1.4.2 羟胺氧化酶 | 第19页 |
| 1.4.3 亚硝酸盐氧化还原酶 | 第19页 |
| 1.4.4 周质硝酸盐还原酶 | 第19页 |
| 1.4.5 膜质硝酸盐还原酶 | 第19-20页 |
| 1.4.6 同化型硝酸盐还原酶 | 第20页 |
| 1.4.7 亚硝酸盐还原酶 | 第20-21页 |
| 1.4.8 氧化亚氮还原酶 | 第21页 |
| 1.5 异养细菌氮代谢途径相关研究 | 第21-22页 |
| 1.6 课题研究背景、研究目的意义和研究内容 | 第22-24页 |
| 1.6.1 课题来源 | 第22页 |
| 1.6.2 研究背景、研究目的和意义 | 第22页 |
| 1.6.3 本文的研究内容 | 第22-24页 |
| 第二章 Halomonas alkaliphila X3氮代谢路径的初步验证 | 第24-31页 |
| 2.1 实验材料 | 第24页 |
| 2.1.1 样品来源 | 第24页 |
| 2.1.2 培养基与试剂 | 第24页 |
| 2.1.3 试剂盒 | 第24页 |
| 2.2 实验方法 | 第24-26页 |
| 2.2.1 基因组DNA提取 | 第24-25页 |
| 2.2.2 功能基因的PCR验证 | 第25-26页 |
| 2.2.3 硝化路径中羟胺生成与否的验证 | 第26页 |
| 2.2.4 反硝化路径中气体产物检测 | 第26页 |
| 2.3 实验结果 | 第26-29页 |
| 2.3.1 PCR | 第26-28页 |
| 2.3.2 羟胺生成验证结果 | 第28-29页 |
| 2.3.3 气体生成验证结果 | 第29页 |
| 2.4 讨论 | 第29-30页 |
| 2.5 本章小结 | 第30-31页 |
| 第三章 Halomonas alkaliphila X3中异化型硝酸盐还原酶编码基因簇功能验证及生物信息学分析 | 第31-39页 |
| 3.1 实验材料 | 第31页 |
| 3.1.1 菌株来源 | 第31页 |
| 3.1.2 培养基 | 第31页 |
| 3.1.3 主要药品与试剂 | 第31页 |
| 3.2 实验方法 | 第31-32页 |
| 3.2.1 酶活测定 | 第31页 |
| 3.2.2 qRT-PCR验证 | 第31-32页 |
| 3.2.3 生物信息学分析 | 第32页 |
| 3.3 实验结果 | 第32-36页 |
| 3.3.1 酶活验证结果 | 第32-33页 |
| 3.3.2 qRT-PCR验证结果 | 第33页 |
| 3.3.3 生物信息学分析结果 | 第33-35页 |
| 3.3.4 系统发育树 | 第35-36页 |
| 3.4 讨论 | 第36-38页 |
| 3.5 本章小结 | 第38-39页 |
| 第四章 Halomonas alkaliphila X3中编码同化硝酸盐还原酶编码基因(nasA)的功能验证及生物信息学分析 | 第39-47页 |
| 4.1 实验材料 | 第39页 |
| 4.1.1 菌株来源 | 第39页 |
| 4.1.2 培养基与试剂 | 第39页 |
| 4.2 实验方法 | 第39-41页 |
| 4.2.1 酶活验证 | 第39页 |
| 4.2.2 基因连接 | 第39-40页 |
| 4.2.3 生物信息学分析 | 第40页 |
| 4.2.4 qRT-PCR验证表达量 | 第40-41页 |
| 4.3 实验结果 | 第41-45页 |
| 4.3.1 酶活验证结果 | 第41页 |
| 4.3.2 基因拼接与蛋白质预测 | 第41-42页 |
| 4.3.3 蛋白质结构预测 | 第42-43页 |
| 4.3.4 系统发育树 | 第43-44页 |
| 4.3.5 不同氧环境下的表达量 | 第44-45页 |
| 4.4 讨论 | 第45-46页 |
| 4.5 本章小结 | 第46-47页 |
| 结论 | 第47-49页 |
| 参考文献 | 第49-58页 |
| 附录 | 第58-59页 |
| 致谢 | 第59页 |
