在GM12878和K562两种细胞系中组蛋白修饰的分布及其与基因表达关系研究
| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-14页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第10-13页 |
| 1.1.1 组蛋白修饰的简介 | 第10-11页 |
| 1.1.2 组蛋白修饰的研究现状 | 第11页 |
| 1.1.3 血癌 | 第11-12页 |
| 1.1.4 超级增强子 | 第12-13页 |
| 1.2 论文结构 | 第13-14页 |
| 第二章 数据预处理和方法介绍 | 第14-16页 |
| 2.1 组蛋白修饰数据来源以及计算方法 | 第14页 |
| 2.2 基因表达值的计算和数据选取 | 第14-16页 |
| 第三章 组蛋白修饰在血癌中的特征 | 第16-26页 |
| 3.1 基因表达值比较 | 第16页 |
| 3.2 组蛋白修饰分布情况 | 第16-19页 |
| 3.3 启动子区域组蛋白修饰水平 | 第19-20页 |
| 3.4 相关性大小的计算 | 第20-24页 |
| 3.5 构造多元线性回归方程 | 第24-25页 |
| 3.6 本章小结 | 第25-26页 |
| 第四章 血癌中组蛋白修饰的调控规律 | 第26-36页 |
| 4.1 筛选差异表达基因 | 第26页 |
| 4.2 计算Spearman相关系数 | 第26-28页 |
| 4.3 组蛋白修饰和基因表达规律 | 第28-31页 |
| 4.4 血癌中的组蛋白修饰密码 | 第31-33页 |
| 4.5 偏相关性的计算 | 第33-35页 |
| 4.6 本章小结 | 第35-36页 |
| 第五章 寻找调控血癌的关键基因 | 第36-43页 |
| 5.1 筛选差异组蛋白修饰基因 | 第36页 |
| 5.2 KEGG分析 | 第36-38页 |
| 5.3 GO功能分析 | 第38-40页 |
| 5.4 超级增强子调控细胞身份基因 | 第40-41页 |
| 5.5 本章小结 | 第41-43页 |
| 第六章 全文总结与展望 | 第43-45页 |
| 6.1 论文工作总结 | 第43页 |
| 6.2 工作展望 | 第43-45页 |
| 参考文献 | 第45-50页 |
| 致谢 | 第50-51页 |
| 硕士时期发表和完成的论文 | 第51页 |
