致谢 | 第5-7页 |
摘要 | 第7-9页 |
Abstract | 第9-11页 |
第1章 前言 | 第15-18页 |
1.1 研究背景 | 第15-17页 |
1.1.1 肺癌简介 | 第15页 |
1.1.2 CTIL在治疗肺癌的研究 | 第15-16页 |
1.1.3 肺癌基因组学研究 | 第16-17页 |
1.2 研究目的 | 第17页 |
1.3 总结 | 第17-18页 |
第2章 循环肿瘤浸润淋巴细胞在肺癌治疗上的作用及相关特异性基因 | 第18-24页 |
2.1 CTIL免疫治疗方法 | 第18-20页 |
2.1.1 CTIL简介和作用机制 | 第18-21页 |
2.1.2 TIL作为癌症诊断标准 | 第21-19页 |
2.1.2.1 TILs能够在早期和晚期预测患者 | 第18-19页 |
2.1.2.2 TILs是一种重要的预后标志 | 第19页 |
2.1.3 肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)临床治疗 | 第19-20页 |
2.2 CD27在肿瘤免疫调节中的作用 | 第20-21页 |
2.2.1 CD27 | 第20页 |
2.2.2 CD27对T细胞活化 | 第20-21页 |
2.2.3 CD27/CD70共刺激系统与癌症免疫 | 第21页 |
2.3 CD28在肿瘤免疫调节中的作用 | 第21-22页 |
2.3.1 CD28 | 第21页 |
2.3.2 CD28协同刺激T细胞激活 | 第21-22页 |
2.4 IncRNA在肿瘤发生发展中的调控 | 第22-24页 |
第3章 材料和方法 | 第24-33页 |
3.1 实验材料 | 第24-25页 |
3.1.1 实验样品 | 第24页 |
3.1.2 主要实验仪器 | 第24页 |
3.1.3 主要试验试剂 | 第24页 |
3.1.4 引物序列 | 第24-25页 |
3.2 试验方法 | 第25-33页 |
3.2.1 血细胞分析 | 第25页 |
3.2.2 LD001样品CTIL细胞体外培养和回输 | 第25-27页 |
3.2.3 CT图分析 | 第27页 |
3.2.4 流式细胞术检测 | 第27-28页 |
3.2.5 RNA提取 | 第28页 |
3.2.6 逆转录PCR检测 | 第28-30页 |
3.2.7 Real-timePCR检测 | 第30-31页 |
3.2.8 高通量测序长链非编码RNA | 第31页 |
3.2.9 引物序列设计 | 第31页 |
3.2.10 统计学处理 | 第31-33页 |
第4章 结果与分析 | 第33-57页 |
4.1 CT统计结果 | 第33-39页 |
4.1.1 肿瘤1统计分析 | 第34-35页 |
4.1.2 肿瘤2统计分析 | 第35-36页 |
4.1.3 肿瘤3统计分析 | 第36-37页 |
4.1.4 肿瘤4统计分析 | 第37-38页 |
4.1.5 肿瘤5统计分析 | 第38-39页 |
4.1.6 小结 | 第39页 |
4.2 流式细胞术结果 | 第39-47页 |
4.2.1 T淋巴细胞的比例变化 | 第40-41页 |
4.2.2 CD4+T的细胞比例 | 第41-42页 |
4.2.3 CD8+T的细胞比例 | 第42-45页 |
4.2.3.1 CD28+的细胞比例 | 第43-44页 |
4.2.3.2 CD27+的细胞比例 | 第44-45页 |
4.2.4 CD56+NK细胞的比例 | 第45-47页 |
4.3 RNA提取结果分析 | 第47页 |
4.4 血细胞分析结果 | 第47-49页 |
4.5 高通量测序结果 | 第49-54页 |
4.5.1 数据产出情况 | 第49-50页 |
4.5.2 Reads与参考基因组比对情况统计 | 第50页 |
4.5.3 差异表达量分析 | 第50-53页 |
4.5.3.1 比较组之间差异表达基因分布 | 第50-51页 |
4.5.3.2 差异表达基因火山图 | 第51-52页 |
4.5.3.3 差异表达基因聚类图 | 第52-53页 |
4.5.4 确定差异表达基因,设计引物序列 | 第53-54页 |
4.5.4.1 通过蛋白互作网络分析确定候选基因 | 第53页 |
4.5.4.2 确定差异表达基因 | 第53-54页 |
4.6 候选基因验证结果 | 第54-57页 |
4.6.1 逆转录PCR检测 | 第54-55页 |
4.6.2 Real-timePCR检测 | 第55-57页 |
第5章 结果与讨论 | 第57-59页 |
5.1 CT肿瘤组织大小统计结果 | 第57页 |
5.2 流式细胞术结果 | 第57页 |
5.3 特异性突变基因的筛选与鉴定 | 第57-58页 |
5.4 讨论 | 第58-59页 |
参考文献 | 第59-67页 |
附录A 实验仪器 | 第67-68页 |
附录B 实验试剂 | 第68-70页 |
附录C 常用缓冲液及试剂的配置 | 第70-71页 |
附录D RNA提取的方法 | 第71-72页 |
附录E 琼脂糖凝胶电泳 | 第72-73页 |
作者简介 | 第73页 |