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百菌清降解菌株分离鉴定、降解特性和降解基因克隆研究

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-10页
符号与缩略语说明第11-12页
前言第12-13页
文献综述第13-37页
    1 氯代有机污染物的微生物降解研究进展第13-21页
        1.1 氯代有机污染物的生物毒性及其残留第13-14页
        1.2 微生物对氯代有机污染物的降解第14-21页
            1.2.1 HCH和DDT微生物降解研究进展第14-16页
            1.2.2 其它氯代有机污染物微生物降解研究进展第16-18页
            1.2.3 氯代芳香族杀菌剂百菌清特性、残留和微生物降解第18-20页
            1.2.4 百菌清代谢途径第20-21页
    2 氯代芳香族环境污染物脱氯酶研究进展第21-28页
        2.1 氯代芳香族环境污染物脱氯酶分类第21-22页
        2.2 还原脱氯(严格厌氧条件)第22-23页
        2.3 巯基取代的还原脱氯(有氧条件)第23-24页
        2.4 氧化脱氯第24-26页
        2.5 水解脱氯第26-28页
    参考文献第28-37页
实验部分第37-79页
    第一章 百菌清降解菌株的分离鉴定第37-52页
        1 材料与方法第37-41页
            1.1 菌株、培养基与试剂第37-38页
            1.2 降解菌株的富集与分离第38页
            1.3 降解菌株的培养特征及生理生化鉴定第38页
            1.4 降解菌株的16S rRNA基因序列的测定第38-40页
                1.4.1 菌体基因组DNA的提取第38-39页
                1.4.2 降解菌株16S rRNA基因的PCR扩增第39页
                1.4.3 PCR产物的T/A克隆第39页
                1.4.4 E. coli DH5α感受态细胞的制备与酶连产物的转化第39页
                1.4.5 质粒DNA的小量提取第39-40页
                1.4.6 16S rRNA基因序列测定第40页
            1.5 降解菌株系统发育地位的确定第40页
            1.6 菌体生长量的测定第40页
            1.7 百菌清含量测定方法第40-41页
        2 结果与分析第41-49页
            2.1 百菌清降解菌株的富集与分离第41-42页
            2.2 降解菌株的菌落形态及生理生化特征第42-43页
            2.3 降解菌株基因组DNA提取和16S rRNA PCR扩增第43-44页
            2.4 三株降解菌系统分类地位鉴定第44-46页
            2.5 环境条件对降解菌株CTN-11生长的影响第46-49页
                2.5.1 温度对菌株CTN-11生长的影响第46-47页
                2.5.2 初始pH对菌株CTN-11生长的影响第47-48页
                2.5.3 NaCl浓度对菌株CTN-11生长的影响第48页
                2.5.4 菌株CTN-1对不同碳源利用情况第48-49页
                2.5.5 菌株CTN-1对不同氮源利用情况第49页
            2.6 菌株CTN-11对抗生素的耐受性第49页
        3 结论第49-50页
        参考文献第50-52页
    第二章 降解菌株对百菌清的降解特性研究第52-64页
        1 材料与方法第52-54页
            1.1 培养基与试剂第52页
            1.2 百菌清的液相色谱检测方法第52页
            1.3 百菌清代谢产物羟基化百菌清(CTN-OH)的紫外和液相检测第52页
            1.4 百菌清代谢产物CTN-OH的串联二级质谱检测第52-53页
            1.5 比较3株降解菌降解速率和菌株CTN-11降解特性研究第53页
            1.6 降解菌CTN-11在土壤中对百菌清的降解性能第53-54页
            1.7 降解菌株CTN-11的脱氯机制第54页
        2 结果与讨论第54-63页
            2.1 菌株生长和百菌清降解的关系第54-55页
            2.2 温度对菌株CTN-11降解百菌清的影响第55页
            2.3 初始pH值对菌株CTN-11降解百菌清的影响第55-56页
            2.4 外加碳源对菌株CTN-11降解百菌清的影响第56-57页
            2.5 外加氮源对菌株CTN-11降解百菌清的影响第57-58页
            2.6 添加金属离子对菌株CTN-11降解百菌清的影响第58页
            2.7 三株降解菌株中的代谢产物质谱鉴定第58-61页
            2.8 降解菌株CTN-11在土壤中对百菌清的降解性能第61-62页
            2.9 降解菌CTN-11粗酶液在厌氧条件下百菌清的脱氯第62-63页
        3 结论第63页
        参考文献第63-64页
    第三章 百菌清水解脱氯酶基因克隆、序列比对和水平转移的分子基础研究第64-79页
        1. 材料与方法第64-67页
            1.1 培养基与试剂第64-65页
            1.2 菌株及培养条件第65页
            1.3 质粒DNA的提取第65页
            1.4 菌体总DNA的提取第65页
            1.5 高效感受态细胞的制备第65-66页
            1.6 Chd和GST基因的PCR扩增第66页
            1.7 E.coli BL21携带降解菌CTN-11中的GST基因的功能验证第66页
            1.8 降解菌CTN-11总DNA的Sau3AI酶切与片段回收第66-67页
            1.9 酶连产物的转化与阳性克隆的筛选第67页
            1.10 序列测定和基因序列比较与分析第67页
            1.11 Chd基因水平转移的证据第67页
        2 结果与分析第67-75页
            2.1 降解菌CTN-2和CTN-4中Chd基因序列测定分析第67-68页
            2.2 降解菌CTN-11中GST基因在E.coli BL21中功能表达第68-69页
            2.3 菌株CTN-11总DNA基因文库的构建与阳性克隆筛选第69-72页
                2.3.1 菌株CTN-11总DNA基因文库的构建第69-70页
                2.3.2 阳性克隆的筛选和降解能力的验证第70-72页
            2.4 序列测定与分析第72-73页
            2.5 Chd基因水平转移的证据第73-75页
                2.5.1 间接的逻辑证据第73页
                2.5.2 Chd基因水平转移的分子基础证据第73-75页
        3 讨论第75-76页
        参考文献第76-79页
全文总结第79-81页
附录一 文中所用培养基及试剂配方第81-83页
附录二 相关DNA序列第83-89页
攻读硕士学位期间发表或已接收的论文第89-91页
致谢第91页

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