| 致谢 | 第10-11页 |
| 中文摘要 | 第11-13页 |
| Abstract | 第13-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-40页 |
| 1.1 贝类生物矿化机制研究进展 | 第16-31页 |
| 1.1.1 贝壳的结构 | 第16-19页 |
| 1.1.2 有机基质 | 第19-31页 |
| 1.2 贝类Ca~(2+)代谢研究进展 | 第31-36页 |
| 1.3 三角帆蚌生物矿化机制研究进展 | 第36-38页 |
| 1.4 本研究的目的和意义 | 第38-40页 |
| 第二章 三角帆蚌生物矿化相关基因的克隆与功能分析 | 第40-69页 |
| 第一节 三角帆蚌钙调蛋白及其类蛋白基因的克隆与功能分析 | 第40-54页 |
| 1 材料和方法 | 第41-45页 |
| 1.1 材料和样品采集 | 第41页 |
| 1.2 cDNA全长RACE扩增 | 第41-43页 |
| 1.3 序列分析 | 第43页 |
| 1.4 组织特异性表达分析 | 第43页 |
| 1.5 CaM和CaLP蛋白的原核表达及纯化 | 第43-44页 |
| 1.6 重组蛋白Ca~(2+)迁移电泳实验 | 第44页 |
| 1.7 Ca~(2+)刺激实验 | 第44-45页 |
| 1.8 统计分析 | 第45页 |
| 2 结果 | 第45-52页 |
| 2.1 CaM和CaLP cDNA全长 | 第45-47页 |
| 2.2 CaM和CaLP推测蛋白质的氨基酸序列 | 第47-48页 |
| 2.3 CaM和CaLP mRNA的组织特异性表达 | 第48页 |
| 2.4 Ca~(2+)迁移电泳分析 | 第48页 |
| 2.5 不同Ca~(2+)浓度下体重、珍珠质沉积和mRNA表达水平的差异 | 第48-52页 |
| 3 讨论 | 第52-54页 |
| 第二节 三角帆蚌碳酸苷酶基因克隆与功能分析 | 第54-69页 |
| 1 实验材料和方法 | 第55-59页 |
| 1.1 实验材料 | 第55页 |
| 1.2 HcCA cDNA片段扩增 | 第55页 |
| 1.3 cDNA全长RACE扩增 | 第55-56页 |
| 1.4 生物信息学分析 | 第56-57页 |
| 1.5 HcCA mRNA的时空表达分析 | 第57-58页 |
| 1.6 荧光定量PCR(qRT-PCR)分析 | 第58页 |
| 1.7 不同环境条件下HcCA mRNA的表达特征 | 第58-59页 |
| 1.7.1 干露实验 | 第58页 |
| 1.7.2 低pH和低温暴露实验 | 第58-59页 |
| 1.8 统计分析 | 第59页 |
| 2 结果 | 第59-66页 |
| 2.1 HcCA cDNA序列 | 第59页 |
| 2.2 HcCA蛋白结构 | 第59-62页 |
| 2.3 序列比对和系统发育分析 | 第62页 |
| 2.4 HcCA mRNA的时空表达分析 | 第62-65页 |
| 2.5 不同环境条件下HcCA mRNA的表达特征 | 第65-66页 |
| 2.5.1 干露实验 | 第65页 |
| 2.5.2 低pH和低温暴露实验 | 第65-66页 |
| 3 讨论 | 第66-69页 |
| 第三章 环境钙离子浓度对三角帆蚌珍珠质沉积的影响 | 第69-80页 |
| 1 材料与方法 | 第70-72页 |
| 1.1 实验材料 | 第70页 |
| 1.2 手术操作 | 第70页 |
| 1.3 养殖实验 | 第70-71页 |
| 1.4 珍珠质和珍珠沉积测定 | 第71页 |
| 1.5 拉曼光谱分析 | 第71页 |
| 1.6 SEM晶体结构分析 | 第71页 |
| 1.7 酶活力的测定 | 第71页 |
| 1.8 统计分析 | 第71-72页 |
| 2 结果与分析 | 第72-75页 |
| 2.1 生长性状 | 第72-74页 |
| 2.2 晶体结构特征 | 第74-75页 |
| 2.3 酶活性 | 第75页 |
| 3 讨论 | 第75-80页 |
| 第四章 三角帆蚌不同Ca~(2+)浓度处理下外套膜组织表达谱分析 | 第80-124页 |
| 第一节 三角帆蚌外套膜组织转录组分析 | 第80-108页 |
| 1 材料与方法 | 第80-82页 |
| 1.1 实验材料 | 第80页 |
| 1.2 实验方法 | 第80-82页 |
| 2 结果与分析 | 第82-101页 |
| 2.1 RNA质量 | 第82页 |
| 2.2 测序结果和序列组装 | 第82-83页 |
| 2.3 Unigene功能注释 | 第83页 |
| 2.4 Unigene的COG分类 | 第83-84页 |
| 2.5 Unigene的GO功能分类 | 第84-85页 |
| 2.6 Unigene的KEGG代谢途径分析 | 第85-87页 |
| 2.7 生物矿化相关基因 | 第87-101页 |
| 3 讨论 | 第101-108页 |
| 第二节 三角帆蚌不同Ca~(2+)浓度处理下外套膜组织表达谱分析 | 第108-124页 |
| 1 材料与方法 | 第108-110页 |
| 1.1 实验材料 | 第108页 |
| 1.2 实验方法 | 第108-109页 |
| 1.3 统计分析 | 第109-110页 |
| 2 结果与分析 | 第110页 |
| 2.1 测序结果 | 第110-119页 |
| 2.2 差异表达基因统计和基因表达模式聚类分析 | 第112-113页 |
| 2.3 差异表达基因GO功能富集分析 | 第113页 |
| 2.4 差异表达基因KEGG代谢途径显著性富集分析 | 第113-114页 |
| 2.5 差异表达的生物矿化相关基因 | 第114-119页 |
| 3 讨论 | 第119-124页 |
| 研究小结、创新点及展望 | 第124-126页 |
| 研究小结 | 第124页 |
| 创新点 | 第124-125页 |
| 研究展望 | 第125-126页 |
| 博士期间发表论文 | 第126-127页 |
| 参考文献 | 第127-146页 |
| 附录 | 第146-157页 |
