| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第一章 引言 | 第9-11页 |
| 1.1 本课题的意义及相关的研究 | 第9-10页 |
| 1.2 本课题的技术路线 | 第10-11页 |
| 第二章 DNA测序技术的介绍 | 第11-19页 |
| 2.1 第一代测序技术 | 第11-12页 |
| 2.1.1 Sanger双脱氧链终止法 | 第11-12页 |
| 2.1.2 Maxam-Gilbert化学降解法 | 第12页 |
| 2.2 第二代测序技术（Next-Generation Sequencing，NGS） | 第12-17页 |
| 2.2.1 焦磷酸测序技术 | 第12-13页 |
| 2.2.2 Solexa测序技术 | 第13页 |
| 2.2.3 SOLiD测序技术 | 第13-14页 |
| 2.2.4 半导体测序技术 | 第14-17页 |
| 2.3 第三代测序技术 | 第17-19页 |
| 2.3.1 并行单分子合成测序技术 | 第17页 |
| 2.3.2 单分子实时合成测序技术 | 第17-18页 |
| 2.3.3 纳米孔单分子测序技术 | 第18-19页 |
| 第三章 材料与方法 | 第19-26页 |
| 3.1 实验材料 | 第19-20页 |
| 3.1.1 主要试剂与耗材 | 第19-20页 |
| 3.1.2 主要仪器与设备 | 第20页 |
| 3.2 样本的采集、保存和运输 | 第20-22页 |
| 3.2.1 样本的采集和保存 | 第20-22页 |
| 3.2.2 样本的运输 | 第22页 |
| 3.3 实验方法 | 第22-26页 |
| 3.3.1 样本前处理 | 第22页 |
| 3.3.2 降低宿主核酸 | 第22-23页 |
| 3.3.3 DNA提取 | 第23页 |
| 3.3.4 病原建库 | 第23-24页 |
| 3.3.5 信息分析 | 第24页 |
| 3.3.6 报告解读 | 第24页 |
| 3.3.7 敏感性测试 | 第24-25页 |
| 3.3.8 重复性测试 | 第25页 |
| 3.3.9 特异性测试 | 第25页 |
| 3.3.10 准确性测试 | 第25-26页 |
| 第四章 技术流程确立及方法学验证 | 第26-42页 |
| 4.1 检测技术的流程确立 | 第26-33页 |
| 4.1.1 痰液液化处理方法优化 | 第26页 |
| 4.1.2 样本浓缩技术研究 | 第26-27页 |
| 4.1.3 降低宿主核酸方法确定 | 第27-29页 |
| 4.1.4 DNA提取方法确立 | 第29-30页 |
| 4.1.5 病原建库方法优化 | 第30-33页 |
| 4.2 检测技术的方法学验证 | 第33-39页 |
| 4.2.1 敏感性验证 | 第33-36页 |
| 4.2.2 稳定性验证 | 第36-37页 |
| 4.2.3 特异性验证 | 第37页 |
| 4.2.4 准确性验证 | 第37-39页 |
| 4.3 检测技术的应用 | 第39-42页 |
| 第五章 结论与展望 | 第42-44页 |
| 5.1 结论 | 第42页 |
| 5.2 展望 | 第42-44页 |
| 参考文献 | 第44-47页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第47-48页 |
| 致谢 | 第48-49页 |
| 附件 | 第49页 |