| 摘要 | 第4-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 1 文献综述 | 第12-28页 |
| 1.1 玉米果穗发育的特征 | 第12-13页 |
| 1.2 发育中的玉米雌花序的特点 | 第13-14页 |
| 1.3 玉米果穗发育的研究进展 | 第14-24页 |
| 1.3.1 影响玉米花序发育的主要基因 | 第14-22页 |
| 1.3.2 玉米雌穗发育相关基因的研究进展 | 第22-23页 |
| 1.3.3 玉米雌穗发育的功能基因组研究进展 | 第23-24页 |
| 1.4 高通量测序技术 | 第24-25页 |
| 1.5 数字基因表达谱 | 第25-26页 |
| 1.5.1 数字基因表达谱的定义及特点 | 第25页 |
| 1.5.2 数字基因表达谱(DGE)的应用 | 第25-26页 |
| 1.6 本研究的目的和意义 | 第26-27页 |
| 1.7 技术路线 | 第27-28页 |
| 2 材料与方法 | 第28-39页 |
| 2.1 实验材料 | 第28-29页 |
| 2.1.1 供试材料 | 第28-29页 |
| 2.1.2 主要仪器设备 | 第29页 |
| 2.1.3 主要试剂盒及生化试剂 | 第29页 |
| 2.2 试验方法 | 第29-39页 |
| 2.2.1 总RNA的制备 | 第29-30页 |
| 2.2.2 Solexa测序及数据分析 | 第30-35页 |
| 2.2.3 表达谱结果验证 | 第35-39页 |
| 3 结果与分析 | 第39-53页 |
| 3.0 总RNA质量分析 | 第39页 |
| 3.1 测序数据统计 | 第39-41页 |
| 3.2 测序饱和度分析 | 第41-43页 |
| 3.3 玉米果穗4个不同发育阶段基因表达量的分析 | 第43-46页 |
| 3.4 基因表达动态分析与测序结果验证 | 第46-49页 |
| 3.5 GENE ONTOLOGY功能显著性富集分析 | 第49页 |
| 3.6 PATHWAY显著性富集分析 | 第49-52页 |
| 3.7 解析差异表达基因中的转录因子 | 第52-53页 |
| 4 讨论 | 第53-60页 |
| 4.1 雌穗花序建成过程的各个时期划分以及取样原则 | 第53页 |
| 4.2 以SOLEXA测序为代表的第二代测序技术的应用 | 第53-54页 |
| 4.3 在转录组水平上分析在果穗发育四个阶段中差异表达的基因 | 第54-55页 |
| 4.4 基因功能注释的应用 | 第55页 |
| 4.5 PATHWAY显著性富集分析 | 第55-56页 |
| 4.6 不同发育阶段间显著差异表达基因可能的调控功能 | 第56-60页 |
| 5 小结与展望 | 第60-62页 |
| 参考文献 | 第62-68页 |
| 附表 | 第68-83页 |
| 致谢 | 第83-85页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文 | 第85页 |
