| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 1 绪论 | 第8-12页 |
| 1.1 论文工作的背景和意义 | 第8-9页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第9-11页 |
| 1.3 论文的研究工作 | 第11-12页 |
| 2 理论基础 | 第12-25页 |
| 2.1 分子力场 | 第12-13页 |
| 2.2 分子力学 | 第13-16页 |
| 2.2.1 一级微商算法 | 第14-15页 |
| 2.2.2 二级微商算法 | 第15-16页 |
| 2.3 分子动力学 | 第16-22页 |
| 2.3.1 基本理论 | 第17-18页 |
| 2.3.2 积分算法 | 第18-20页 |
| 2.3.3 初始化 | 第20-22页 |
| 2.3.4 长程静电力 | 第22页 |
| 2.4 结合自由能计算 | 第22-25页 |
| 3 R823W突变对ANKS3-ANKS6相互作用的分子动力学模拟研究 | 第25-41页 |
| 3.1 前言 | 第25-26页 |
| 3.2 计算方法 | 第26-28页 |
| 3.2.1 理论模型的建立 | 第26页 |
| 3.2.2 分子动力学模拟 | 第26页 |
| 3.2.3 轨迹的分析 | 第26-27页 |
| 3.2.4 相关性分析 | 第27页 |
| 3.2.5 主成分分析 | 第27页 |
| 3.2.6 结合自由能计算 | 第27-28页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第28-41页 |
| 3.3.1 ANKS-ANKS6的动力学特征 | 第28-32页 |
| 3.3.2 氢键分析 | 第32-33页 |
| 3.3.3 聚类分析和相关性分析 | 第33-35页 |
| 3.3.4 主成分分析 | 第35-37页 |
| 3.3.5 自由能计算 | 第37-39页 |
| 3.3.6 小结 | 第39-41页 |
| 结论 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-46页 |
| 附录 | 第46-57页 |
| 攻读硕士学位期间学术成果情况 | 第57-58页 |
| 致谢 | 第58页 |