摘要 | 第6-8页 |
ABSTRACT | 第8-10页 |
引言 | 第13-21页 |
1 MICRORNA | 第13-19页 |
1.1 miRNA的生物合成 | 第13-15页 |
1.2 miRNA的结构特征 | 第15页 |
1.3 miRNA的作用机制与调控 | 第15-17页 |
1.4 miRNA的鉴定与表达检测 | 第17-18页 |
1.5 miRNA的应用 | 第18-19页 |
2 肌肉生长因子 | 第19-20页 |
3 本研究的目的和意义 | 第20-21页 |
第一章 翘嘴鳜MIRNA SOLEXA测序与分析 | 第21-31页 |
1 材料 | 第21-22页 |
1.1 试验鱼 | 第21页 |
1.2 主要的试剂及仪器 | 第21-22页 |
2 方法 | 第22-24页 |
2.1 组织提取 | 第22页 |
2.2 两组翘嘴鳜RNA的提取 | 第22页 |
2.3 miRNA文库的建立 | 第22-23页 |
2.4 Small RNA数据的测序分析 | 第23-24页 |
3 结果 | 第24-29页 |
3.1 翘嘴鳜sRNA转录组深度测序结果 | 第24-27页 |
3.2 鉴定翘嘴鳜已知miRNA | 第27-28页 |
3.3 碱基编辑情况 | 第28-29页 |
4 讨论 | 第29-31页 |
第二章 两组翘嘴鳜生长差异相关MIRNA的差异表达分析 | 第31-45页 |
1 材料 | 第31-32页 |
1.1 生长存在显著差异的鳜肌肉组织 | 第31页 |
1.2 不同胚胎发育时期的鳜 | 第31-32页 |
1.3 仪器与试剂 | 第32页 |
2 方法 | 第32-35页 |
2.1 Expdiff法 | 第32页 |
2.2 用Trizol法提取各胚胎发育时期的总RNA | 第32-33页 |
2.3 用于实时荧光定量分析差异表达miRNA引物的设计 | 第33页 |
2.4 实时荧光定量反转录PCR | 第33-34页 |
2.5 差异表达miRNA靶基因预测及KEGG注释 | 第34页 |
2.6 miRNA预测靶基因的过滤 | 第34-35页 |
2.7 翘嘴鳜差异表达miR-192的胚胎发育时空表达 | 第35页 |
3 结果 | 第35-42页 |
3.1 差异miRNA的鉴定 | 第35-36页 |
3.2 荧光定量引物检测 | 第36-39页 |
3.3 差异miRNA的鉴定 | 第39页 |
3.4 翘嘴鳜差异表达miRNA靶基因预测与KEGG分析 | 第39-41页 |
3.5 差异miRNA的潜在靶基因 | 第41页 |
3.6 翘嘴鳜差异miR-192的时序性表达模式 | 第41-42页 |
4 讨论 | 第42-45页 |
全文总结 | 第45-46页 |
参考文献 | 第46-55页 |
附录 | 第55-57页 |
附录 一 缩略词及中英文对照 | 第55-56页 |
附录 二 在读期间发表的文章和学术交流 | 第56-57页 |
致谢 | 第57页 |