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翘嘴鳜microRNA转录组及与生长发育相关miRNA的鉴定与分析

摘要第6-8页
ABSTRACT第8-10页
引言第13-21页
    1 MICRORNA第13-19页
        1.1 miRNA的生物合成第13-15页
        1.2 miRNA的结构特征第15页
        1.3 miRNA的作用机制与调控第15-17页
        1.4 miRNA的鉴定与表达检测第17-18页
        1.5 miRNA的应用第18-19页
    2 肌肉生长因子第19-20页
    3 本研究的目的和意义第20-21页
第一章 翘嘴鳜MIRNA SOLEXA测序与分析第21-31页
    1 材料第21-22页
        1.1 试验鱼第21页
        1.2 主要的试剂及仪器第21-22页
    2 方法第22-24页
        2.1 组织提取第22页
        2.2 两组翘嘴鳜RNA的提取第22页
        2.3 miRNA文库的建立第22-23页
        2.4 Small RNA数据的测序分析第23-24页
    3 结果第24-29页
        3.1 翘嘴鳜sRNA转录组深度测序结果第24-27页
        3.2 鉴定翘嘴鳜已知miRNA第27-28页
        3.3 碱基编辑情况第28-29页
    4 讨论第29-31页
第二章 两组翘嘴鳜生长差异相关MIRNA的差异表达分析第31-45页
    1 材料第31-32页
        1.1 生长存在显著差异的鳜肌肉组织第31页
        1.2 不同胚胎发育时期的鳜第31-32页
        1.3 仪器与试剂第32页
    2 方法第32-35页
        2.1 Expdiff法第32页
        2.2 用Trizol法提取各胚胎发育时期的总RNA第32-33页
        2.3 用于实时荧光定量分析差异表达miRNA引物的设计第33页
        2.4 实时荧光定量反转录PCR第33-34页
        2.5 差异表达miRNA靶基因预测及KEGG注释第34页
        2.6 miRNA预测靶基因的过滤第34-35页
        2.7 翘嘴鳜差异表达miR-192的胚胎发育时空表达第35页
    3 结果第35-42页
        3.1 差异miRNA的鉴定第35-36页
        3.2 荧光定量引物检测第36-39页
        3.3 差异miRNA的鉴定第39页
        3.4 翘嘴鳜差异表达miRNA靶基因预测与KEGG分析第39-41页
        3.5 差异miRNA的潜在靶基因第41页
        3.6 翘嘴鳜差异miR-192的时序性表达模式第41-42页
    4 讨论第42-45页
全文总结第45-46页
参考文献第46-55页
附录第55-57页
    附录 一 缩略词及中英文对照第55-56页
    附录 二 在读期间发表的文章和学术交流第56-57页
致谢第57页

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