摘要 | 第3-5页 |
ABSTRACT | 第5-6页 |
1 前言 | 第9-23页 |
1.1 动物的性别决定与分化 | 第9-15页 |
1.1.1 动物的性别决定类型 | 第10-12页 |
1.1.2 鱼类性别决定相关基因的研究 | 第12-15页 |
1.2 DMRT基因家族 | 第15-17页 |
1.2.1 DMRT基因的发现、分类和命名 | 第15页 |
1.2.2 DMRT基因家族的结构特点 | 第15-16页 |
1.2.3 人类、鸟类和爬行类的DMRT基因 | 第16页 |
1.2.4 DMRT基因在发育中的作用 | 第16-17页 |
1.3 DMRT1——参与性别决定的重要基因 | 第17-18页 |
1.3.1 DMRT1基因的发现与命名 | 第17页 |
1.3.2 DMRT1基因的分布与表达 | 第17页 |
1.3.3 DMRT1的研究进展 | 第17-18页 |
1.4 转录组测序(RNA-seq)技术 | 第18-19页 |
1.5 选择性剪接 | 第19-21页 |
1.5.1 mRNA剪接的基本模式及形式 | 第20页 |
1.5.2 选择性剪接的生物学意义及研究技术 | 第20-21页 |
1.6 本研究的目的和意义 | 第21-23页 |
2 材料与方法 | 第23-39页 |
2.1 材料 | 第23-26页 |
2.1.1 实验动物 | 第23页 |
2.1.2 宿主菌株和载体 | 第23页 |
2.1.3 主要仪器设备 | 第23-24页 |
2.1.4 溶液和培养基的配制引物 | 第24-25页 |
2.1.5 引物 | 第25-26页 |
2.2 方法 | 第26-39页 |
2.2.1 总RNA的制备 | 第26页 |
2.2.2 反转录反应 | 第26-29页 |
2.2.3 黄河鲤CcDMRT1基因序列的克隆、测序及分析 | 第29-32页 |
2.2.4 黄河鲤CcDMRT1基因cDNA全序列拼接 | 第32页 |
2.2.5 黄河鲤CcDMRT1基因序列分析和进化树的构建 | 第32页 |
2.2.6 黄河鲤CcDMRT1基因时空特异性表达模式分析 | 第32-33页 |
2.2.7 黄河鲤CcDMRT1基因原位杂交分析 | 第33-37页 |
2.2.8 黄河鲤精巢分化不同时期转录组中DMRT RNA-seq文库的构建 | 第37-39页 |
3 结果与分析 | 第39-61页 |
3.1 黄河鲤CcDMRT1基因cDNA全长的克隆 | 第39-41页 |
3.1.1 黄河鲤精巢总RNA的提取 | 第39页 |
3.1.2 黄河鲤CcDMRT1保守区域的克隆 | 第39-40页 |
3.1.3 黄河鲤CcDMRT1基因的非翻译区 | 第40-41页 |
3.2 黄河鲤中CcDMRT1基因的生物信息学分析 | 第41-47页 |
3.2.1 黄河鲤CcDMRT1基因的序列分析 | 第41-43页 |
3.2.2 黄河鲤CcDMRT1基因聚类分析 | 第43-46页 |
3.2.3 氨基酸序列跨膜特性与组成分析 | 第46-47页 |
3.2.4 黄河鲤中CcDMRT1蛋白质结构分析 | 第47页 |
3.3 黄河鲤中CcDMRT1基因的表达模式分析 | 第47-51页 |
3.3.1 黄河鲤在胚胎发育时期中CcDMRT1基因的表达模式分析 | 第48-49页 |
3.3.2 黄河鲤CcDMRT1在未成熟个体组织中的表达模式分析 | 第49-50页 |
3.3.3 黄河鲤CcDMRT1在性成熟个体组织中的表达模式分析 | 第50-51页 |
3.4 CcDMRT1基因的原位杂交结果与分析 | 第51-53页 |
3.5 黄河鲤RNA-seq数据库中DMRT家族基因的分析 | 第53-61页 |
3.5.1 黄河鲤DMRT家族基因的序列分析 | 第53-59页 |
3.5.2 黄河鲤DMRT家族基因的reads数目比对分析 | 第59页 |
3.5.3 黄河鲤DMRT家族基因的表达量分析 | 第59-61页 |
4 讨论 | 第61-67页 |
4.1 黄河鲤CcDMRT1基因的保守性分析 | 第61-62页 |
4.2 黄河鲤CcDMRT1基因的表达分析及功能预测 | 第62-64页 |
4.3 利用转录组数据库对黄河鲤DMRT家族基因的分析 | 第64-67页 |
参考文献 | 第67-79页 |
致谢 | 第79-81页 |
攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第81-83页 |