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黄河鲤CcDMRT1基因的克隆、表达及相关家族成员的功能解析

摘要第3-5页
ABSTRACT第5-6页
1 前言第9-23页
    1.1 动物的性别决定与分化第9-15页
        1.1.1 动物的性别决定类型第10-12页
        1.1.2 鱼类性别决定相关基因的研究第12-15页
    1.2 DMRT基因家族第15-17页
        1.2.1 DMRT基因的发现、分类和命名第15页
        1.2.2 DMRT基因家族的结构特点第15-16页
        1.2.3 人类、鸟类和爬行类的DMRT基因第16页
        1.2.4 DMRT基因在发育中的作用第16-17页
    1.3 DMRT1——参与性别决定的重要基因第17-18页
        1.3.1 DMRT1基因的发现与命名第17页
        1.3.2 DMRT1基因的分布与表达第17页
        1.3.3 DMRT1的研究进展第17-18页
    1.4 转录组测序(RNA-seq)技术第18-19页
    1.5 选择性剪接第19-21页
        1.5.1 mRNA剪接的基本模式及形式第20页
        1.5.2 选择性剪接的生物学意义及研究技术第20-21页
    1.6 本研究的目的和意义第21-23页
2 材料与方法第23-39页
    2.1 材料第23-26页
        2.1.1 实验动物第23页
        2.1.2 宿主菌株和载体第23页
        2.1.3 主要仪器设备第23-24页
        2.1.4 溶液和培养基的配制引物第24-25页
        2.1.5 引物第25-26页
    2.2 方法第26-39页
        2.2.1 总RNA的制备第26页
        2.2.2 反转录反应第26-29页
        2.2.3 黄河鲤CcDMRT1基因序列的克隆、测序及分析第29-32页
        2.2.4 黄河鲤CcDMRT1基因cDNA全序列拼接第32页
        2.2.5 黄河鲤CcDMRT1基因序列分析和进化树的构建第32页
        2.2.6 黄河鲤CcDMRT1基因时空特异性表达模式分析第32-33页
        2.2.7 黄河鲤CcDMRT1基因原位杂交分析第33-37页
        2.2.8 黄河鲤精巢分化不同时期转录组中DMRT RNA-seq文库的构建第37-39页
3 结果与分析第39-61页
    3.1 黄河鲤CcDMRT1基因cDNA全长的克隆第39-41页
        3.1.1 黄河鲤精巢总RNA的提取第39页
        3.1.2 黄河鲤CcDMRT1保守区域的克隆第39-40页
        3.1.3 黄河鲤CcDMRT1基因的非翻译区第40-41页
    3.2 黄河鲤中CcDMRT1基因的生物信息学分析第41-47页
        3.2.1 黄河鲤CcDMRT1基因的序列分析第41-43页
        3.2.2 黄河鲤CcDMRT1基因聚类分析第43-46页
        3.2.3 氨基酸序列跨膜特性与组成分析第46-47页
        3.2.4 黄河鲤中CcDMRT1蛋白质结构分析第47页
    3.3 黄河鲤中CcDMRT1基因的表达模式分析第47-51页
        3.3.1 黄河鲤在胚胎发育时期中CcDMRT1基因的表达模式分析第48-49页
        3.3.2 黄河鲤CcDMRT1在未成熟个体组织中的表达模式分析第49-50页
        3.3.3 黄河鲤CcDMRT1在性成熟个体组织中的表达模式分析第50-51页
    3.4 CcDMRT1基因的原位杂交结果与分析第51-53页
    3.5 黄河鲤RNA-seq数据库中DMRT家族基因的分析第53-61页
        3.5.1 黄河鲤DMRT家族基因的序列分析第53-59页
        3.5.2 黄河鲤DMRT家族基因的reads数目比对分析第59页
        3.5.3 黄河鲤DMRT家族基因的表达量分析第59-61页
4 讨论第61-67页
    4.1 黄河鲤CcDMRT1基因的保守性分析第61-62页
    4.2 黄河鲤CcDMRT1基因的表达分析及功能预测第62-64页
    4.3 利用转录组数据库对黄河鲤DMRT家族基因的分析第64-67页
参考文献第67-79页
致谢第79-81页
攻读学位期间发表的学术论文目录第81-83页

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