| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 缩略词表(Abbreviations) | 第10-11页 |
| 第一章 大肠杆菌烷基过氧化氢还原酶(AhpF-AhpC)的结构与功能研究 | 第11-45页 |
| 1.1 研究背景 | 第11-21页 |
| 1.1.1 活性氧概况 | 第11页 |
| 1.1.2 Peroxiredoxin的抗氧化机制及其分类 | 第11-18页 |
| 1.1.3 烷基过氧化氢还原酶 | 第18-21页 |
| 1.2 实验材料和方法 | 第21-31页 |
| 1.2.1 材料和仪器 | 第21-24页 |
| 1.2.2 目的基因的克隆和质粒构建 | 第24-27页 |
| 1.2.3 AhpF(C132S)/AhpC(C47S)突变体的构建 | 第27-29页 |
| 1.2.4 AhpF-AhpC交联实验 | 第29-30页 |
| 1.2.5 蛋白的表达与纯化 | 第30页 |
| 1.2.6 蛋白质晶体筛选 | 第30-31页 |
| 1.3 结果与讨论 | 第31-43页 |
| 1.3.1 内源性AhpF表达纯化 | 第31-33页 |
| 1.3.2 AhpC的纯化 | 第33-34页 |
| 1.3.3 AhpF(C132S)和AhpC(C47S)交联实验结果 | 第34-36页 |
| 1.3.4 内源性AhpF的晶体生长和优化 | 第36页 |
| 1.3.5 AhpC的晶体生长与优化 | 第36-37页 |
| 1.3.6 蛋白晶体衍射数据收集和结构解析 | 第37-40页 |
| 1.3.7 AhpF结构概述 | 第40-42页 |
| 1.3.8 AhpC结构概述 | 第42-43页 |
| 1.4 小结 | 第43-45页 |
| 第二章 大肠杆菌YcjY蛋白结构和功能研究 | 第45-73页 |
| 2.1 研究背景 | 第45-50页 |
| 2.1.1 肽聚糖的功能、组成和生物合成 | 第45-46页 |
| 2.1.2 肽聚糖的代谢和循环利用 | 第46-47页 |
| 2.1.3 细菌细胞分裂及其调节 | 第47-49页 |
| 2.1.4 细菌细胞分裂与丝状表型 | 第49-50页 |
| 2.2 实验材料和方法 | 第50-60页 |
| 2.2.1 YcjY基因的克隆和质粒构建 | 第50-54页 |
| 2.2.2 YcjY蛋白的表达与纯化 | 第54-56页 |
| 2.2.3 硒代甲硫氨酸(Se-Met)替代的YcjY蛋白的制备 | 第56-57页 |
| 2.2.4 YcjY蛋白晶体的生长和晶体优化 | 第57-58页 |
| 2.2.5 组成型表达系统的构建 | 第58-59页 |
| 2.2.6 YcjY突变体的构建 | 第59-60页 |
| 2.3 实验结果与讨论 | 第60-72页 |
| 2.3.1 YcjY蛋白纯化 | 第60-62页 |
| 2.3.2 YcjY蛋白晶体筛选和晶体优化 | 第62-64页 |
| 2.3.3 YcjY硒代蛋白晶体生长与优化 | 第64页 |
| 2.3.4 YcjY蛋白晶体衍射数据收集和结构解析 | 第64-66页 |
| 2.3.5 YcjY蛋白晶体结构 | 第66-68页 |
| 2.3.6 分子筛分析YcjY在溶液中的聚集状态 | 第68-69页 |
| 2.3.7 YcjY的催化位点和催化口袋 | 第69-70页 |
| 2.3.8 YcjY同源结构比对分析 | 第70-71页 |
| 2.3.9 YcjY活性位点分析 | 第71-72页 |
| 2.4 小结 | 第72-73页 |
| 参考文献 | 第73-80页 |
| 致谢 | 第80页 |
