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斑马鱼内源性逆转录病毒囊膜蛋白的结构和功能

中文摘要第5-7页
ABSTRACT第7-8页
目录第9-12页
引言第12-14页
第一章 内源性病毒研究进展第14-23页
    1.1 引言第14-15页
    1.2 内源性病毒的发现第15-16页
    1.3 现代病毒的演变第16-17页
    1.4 宿主基因组的突变第17-19页
    1.5 对宿主基因表达的影响第19-23页
        1.5.1 破坏基因调控第19-20页
        1.5.2 ERVs是丰富的启动子来源第20-21页
        1.5.3 新的转录因子结合位点的分布第21-23页
第二章 内源性逆转录病毒囊膜蛋白促融合核心结构特征的研究进展第23-34页
    2.1 引言第23-24页
    2.2 Ⅰ型囊膜病毒的融合机制研究进展第24-28页
        2.2.1 病毒膜融合基本原理第24-25页
        2.2.2 Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型囊膜病毒膜蛋白的特点第25-28页
    2.3 内源性逆转录病毒家族(ENDOGENOUS RETROVIRUS FAMILY)的囊膜蛋白(SYNCYTIN-1、SYNCYTIN-2、SYNCYTIN-A)的促融合核心结构特征第28-32页
    2.4 其它哺乳动物中的内源性逆转录病毒第32页
    2.5 斑马鱼中的内源性逆转录病毒第32-34页
第三章 发育以及药物筛选的模式动物----斑马鱼第34-40页
    3.1 斑马鱼作为模式动物研究优势第34页
    3.2 斑马鱼胚胎发育过程第34-36页
    3.3 斑马鱼的主要研究手段第36-38页
        3.3.1 显微注射第36-37页
        3.3.2 转基因斑马鱼第37页
        3.3.3 胚胎整体原位杂交第37-38页
        3.3.4 基因筛选第38页
        3.3.5 免疫组化第38页
    3.4 利用斑马鱼胚胎进行小分子药物筛选第38-40页
第四章 SYNCYTINZF N+C蛋白及其点突变蛋白的构建、表达和纯化第40-67页
    4.1 实验仪器和设备第40-41页
    4.2 实验材料第41-45页
    4.3 实验方法第45-59页
        4.3.1 SynZF基因序列比对和分析第45页
        4.3.2 SynZF N+C克隆的构建第45-57页
        4.3.4 SynZF N+C的点突变蛋白的表达和纯化第57-59页
    4.4 实验结果第59-67页
        4.4.1 SynZF N+C基因序列的比对和分析第59-60页
        4.4.2 SynZF N+C PCR扩增第60页
        4.4.3 pGEX-6p-1 SynZF N+C重组克隆的鉴定第60-61页
        4.4.4 GST-SynZF N+C融合蛋白的表达第61-62页
        4.4.5 SynZF N+C蛋白和GST蛋白的分离纯化第62-64页
        4.4.6 pGEX-6p-1 synZF N+C突变体克隆鉴定第64-66页
        4.4.7 SynZF N+C突变蛋白的表达和纯化第66-67页
第五章 SYNZF N+C蛋白的结构分析第67-86页
    5.1 引言第67页
    5.2 实验仪器和设备第67-68页
    5.3 实验材料第68-70页
    5.4 实验方法第70-73页
        5.4.1 蛋白序列比对和分析第70页
        5.4.2 高效液相色谱系统中分子筛对分子量的测定第70-71页
        5.4.3 化学交联反应第71页
        5.4.4 圆二色光谱仪对蛋白二级结构、热和酸稳定性的测定第71-72页
        5.4.5 蛋白酶K有限酶解及有限酶解片段信息的质谱分析第72-73页
        5.4.6 同源建模第73页
    5.5 实验结果第73-86页
        5.5.1 SynZF N+C的序列比对第73-75页
        5.5.2 SynZF N+C在生理条件下可能以三聚体的形式存在第75-77页
        5.5.3 SynZF N+C能形成稳定α螺旋的二级结构第77-79页
        5.5.4 SynZF N+C的有限酶解实验第79-80页
        5.5.5 SynZF N+C酶解产物的质谱分析第80-82页
        5.5.7 SynZF N+C半胱氨酸突变体的热稳定性测定第82-83页
        5.5.8 源于NHR和CHR合成肽的结构测定第83-84页
        5.5.9 SynZF N+C的核心序列的同源建模和结构假说第84-86页
第六章 研究总结和展望第86-88页
参考文献第88-99页
攻博期间发表的科研成果目录第99-100页
致谢第100页

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