| 论文创新点 | 第5-6页 |
| 缩略词表 | 第6-10页 |
| 摘要 | 第10-12页 |
| Abstract | 第12页 |
| 第一章 前言 | 第14-39页 |
| 1.1 表观遗传学 | 第14-29页 |
| 1.1.1 概述 | 第14-15页 |
| 1.1.2 染色质的结构 | 第15-16页 |
| 1.1.3 DNA甲基化 | 第16-18页 |
| 1.1.4 组蛋白修饰 | 第18-26页 |
| 1.1.5 表观遗传学参与的生物学过程 | 第26-28页 |
| 1.1.6 表观遗传组学及研究方法 | 第28-29页 |
| 1.2 癌症 | 第29-36页 |
| 1.2.1 概述 | 第29-30页 |
| 1.2.2 乳腺癌 | 第30-31页 |
| 1.2.3 癌症的发生机制 | 第31-33页 |
| 1.2.4 癌症中的表观遗传学 | 第33-36页 |
| 1.3 肿瘤转化模型 | 第36-37页 |
| 1.4 本文的研究思路和意义 | 第37-39页 |
| 第二章 材料与方法 | 第39-57页 |
| 2.1 实验材料 | 第39-47页 |
| 2.1.1 菌株和质粒 | 第39页 |
| 2.1.2 细胞、组织、动物和抗体 | 第39-40页 |
| 2.1.3 试剂 | 第40-41页 |
| 2.1.4 试剂盒 | 第41页 |
| 2.1.5 溶液和培养基 | 第41-43页 |
| 2.1.6 小干扰RNA | 第43页 |
| 2.1.7 KDM3A克隆载体的构建 | 第43-44页 |
| 2.1.8 实时定量PCR引物 | 第44-46页 |
| 2.1.9 仪器 | 第46-47页 |
| 2.2 实验方法 | 第47-57页 |
| 2.2.1 质粒的构建和扩增 | 第47页 |
| 2.2.2 细胞培养与转染、感染 | 第47-49页 |
| 2.2.3 乳腺癌细胞系的建立 | 第49页 |
| 2.2.4 总RNA的提取及逆转录 | 第49-50页 |
| 2.2.5 染色质免疫共沉淀 | 第50-51页 |
| 2.2.6 实时荧光定量PCR | 第51页 |
| 2.2.7 高通量测序 | 第51-52页 |
| 2.2.8 蛋白质免疫杂交 | 第52-53页 |
| 2.2.9 免疫细胞及组织染色 | 第53-54页 |
| 2.2.10 MTT法检测细胞活力 | 第54页 |
| 2.2.11 流式细胞术 | 第54页 |
| 2.2.12 彗星电泳 | 第54-55页 |
| 2.2.13 克隆形成 | 第55页 |
| 2.2.14 裸鼠成瘤 | 第55-57页 |
| 第三章 基因组水平的组蛋白甲基化在乳腺肿瘤转化过程中的动态变化 | 第57-74页 |
| 3.1 人源乳腺肿瘤发生模型的构建 | 第57-59页 |
| 3.2 乳腺肿瘤细胞的基因表达谱分析 | 第59-61页 |
| 3.3 组蛋白H3K9me2和H3K9me3水平的下降 | 第61-63页 |
| 3.4 组蛋白H3K9me3水平的降低与肿瘤发生的关系 | 第63-67页 |
| 3.4.1 H3K9me3在基因组水平的动态变化 | 第64-65页 |
| 3.4.2 H3K9me3水平的下降导致基因组不稳定 | 第65-67页 |
| 3.5 组蛋白H3K9me2水平的降低与肿瘤发生的关系 | 第67-73页 |
| 3.5.1 H3K9me2影响了癌症相关基因表达程序 | 第68-71页 |
| 3.5.2 H3K9me2水平的下降显著发生在LOCKs边缘区域 | 第71-73页 |
| 3.6 小结 | 第73-74页 |
| 第四章 组蛋白去甲基化酶KDM3A调控乳腺肿瘤细胞转化过程 | 第74-88页 |
| 4.1 肿瘤转化过程中甲基化酶和去甲基化酶的筛选 | 第74-76页 |
| 4.2 KDM3A在乳腺癌细胞中高表达 | 第76-77页 |
| 4.3 KDM3A促进了乳腺癌细胞的增殖和成瘤能力 | 第77-80页 |
| 4.4 KDM3A调控了癌症相关基因的表达 | 第80-82页 |
| 4.5 KDM3A调控了肿瘤转化过程的H3K9me2水平 | 第82-87页 |
| 4.5.1 KDM3A对全局水平H3K9甲基化的调控 | 第82-84页 |
| 4.5.2 KDM3A调控癌症相关基因的H3K9me2水平 | 第84-87页 |
| 4.6 小结 | 第87-88页 |
| 第五章 讨论与总结 | 第88-93页 |
| 5.1 癌症发生的重编程模型 | 第88-89页 |
| 5.2 H3K9me3代表的异染色质和肿瘤转化的关系 | 第89-90页 |
| 5.3 H3K9me2影响基因表达程序的机制 | 第90-91页 |
| 5.4 H3K9me3甲基化水平下降的原因猜想 | 第91-92页 |
| 5.5 总结与展望 | 第92-93页 |
| 参考文献 | 第93-103页 |
| 博士期间发表的论文 | 第103-104页 |
| 致谢 | 第104页 |
