| 摘要 | 第8-10页 |
| 英文摘要 | 第10-11页 |
| 符号说明 | 第12-13页 |
| 第一章 蛋白质分子结构模拟与分子动力学 | 第13-24页 |
| 1 引言 | 第13-24页 |
| 1.1 分子动力学基本概念 | 第15-16页 |
| 1.2 分子动力学在生物大分子模拟中的应用进展 | 第16-19页 |
| 1.3 蛋白质结构预测,序列分析与蛋白质折叠 | 第19-24页 |
| 第二章 BHLH区域中突变对DEC家族蛋白质结构以及蛋白质-DNA结合能力的影响研究 | 第24-35页 |
| 1 引言 | 第24-26页 |
| 2 研究方法与步骤 | 第26-28页 |
| 2.2.1 建立DEC1/DEC2二聚体三维结构模型 | 第26-27页 |
| 2.2.2 模型评估 | 第27页 |
| 2.2.3 分子动力学模拟 | 第27-28页 |
| 3 实验结果 | 第28-32页 |
| 2.3.1 预测DEC1和DEC2的模型结构 | 第28-29页 |
| 2.3.2 模型质量评估 | 第29-30页 |
| 2.3.3 分子动力学模拟结果 | 第30-32页 |
| 2.3.4 通过动力学方法研究各个区域在溶液中的运动轨迹 | 第32页 |
| 2.3.5 蛋白质-DNA结合能 | 第32页 |
| 4 讨论 | 第32-35页 |
| 第三章 胃癌中的LIPF以及相关的DGKA表达量降低与患者预后关系的研究 | 第35-45页 |
| 1 引言 | 第35页 |
| 2 实验方法与步骤 | 第35-39页 |
| 3.2.1 胃癌病人RNA测序数据库分析 | 第35-36页 |
| 3.2.2 胃癌病人的表达谱芯片数据分析 | 第36-38页 |
| 3.2.3 基因功能富集分析 | 第38页 |
| 3.2.4 免疫组织化学实验 | 第38-39页 |
| 3.2.5 统计学分析 | 第39页 |
| 3.3 结果 | 第39-42页 |
| 3.3.1 胃癌组织的RNA-测序以及表达谱芯片数据挖掘 | 第39-41页 |
| 3.3.2 基因功能注释 | 第41页 |
| 3.3.3 免疫组织化学染色结果 | 第41页 |
| 3.3.4 生存期分析 | 第41-42页 |
| 3.4 讨论 | 第42-45页 |
| 附录 | 第45-47页 |
| 附图表 | 第47-75页 |
| 参考文献 | 第75-80页 |
| 致谢 | 第80-82页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第82-83页 |
| 附件 | 第83-116页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第116页 |
