中文摘要 | 第10-15页 |
ABSTRACT | 第15-20页 |
第一部分 研究背景 | 第21-34页 |
1.1 缺血性脑血管病概况 | 第21-22页 |
1.2 大脑中动脉闭塞的危险因素 | 第22-23页 |
1.3 缺血性脑血管病的发生机制 | 第23-25页 |
1.4 生物信息学和基因芯片技术概述 | 第25-27页 |
1.5 基因芯片的应用 | 第27-28页 |
1.6 基因芯片数据的分析及常用数据库和分析工具 | 第28-32页 |
1.7 生物信息学发展的意义 | 第32-33页 |
1.8 研究目的及意义 | 第33-34页 |
第二部分 大脑中动脉闭塞差异表达基因的筛选与生物信息学分析 | 第34-50页 |
2.1 数据与方法 | 第34-35页 |
2.1.1 芯片数据来源 | 第34页 |
2.1.2 表达谱数据预处理与差异表达基因筛选 | 第34-35页 |
2.1.3 差异表达基因分析及功能注释 | 第35页 |
2.1.4 差异表达基因文氏图分析 | 第35页 |
2.1.5 蛋白质互作(PPI)网络构建 | 第35页 |
2.2 分析结果 | 第35-38页 |
2.2.1 数据标准化 | 第36页 |
2.2.2 差异表达基因分析结果 | 第36页 |
2.2.3 差异表达基因的功能富集分析结果 | 第36-37页 |
2.2.4 不同时间点大脑动脉闭塞差异表达基因的文氏图分析 | 第37页 |
2.2.5 差异表达基因对应的蛋白质互作网络 | 第37-38页 |
2.3 讨论 | 第38-41页 |
2.4 小结 | 第41页 |
2.5 附图表 | 第41-50页 |
第三部分 PACAP38对大脑中动脉闭塞影响的分子机制研究 | 第50-81页 |
3.1 数据与方法 | 第50-53页 |
3.1.1 表达谱数据来源 | 第50页 |
3.1.2 原始数据预处理 | 第50-51页 |
3.1.3 差异表达基因筛选 | 第51页 |
3.1.4 差异表达基因功能富集分析 | 第51页 |
3.1.5 蛋白质互作(PPI)网络构建 | 第51-52页 |
3.1.6 差异表达基因文氏图分析 | 第52页 |
3.1.7 缺血核心区和半影区组织基因比较分析 | 第52-53页 |
3.2 分析结果 | 第53-57页 |
3.2.1 差异表达分析基本信息统计 | 第53页 |
3.2.2 缺血核心区(ischemia)组织差异表达基因富集分析结果 | 第53-54页 |
3.2.3 半影区(penumbra)组织差异表达基因富集分析结果 | 第54页 |
3.2.4 缺血核心区(ischemia)组织差异表达基因的蛋白质互作网络 | 第54-55页 |
3.2.5 半影区(penumbra)组织差异表达基因的蛋白质互作网络 | 第55页 |
3.2.6 缺血核心区差异表达基因文氏图分析 | 第55-56页 |
3.2.7 半影区差异表达基因文氏图分析 | 第56页 |
3.2.8 缺血核心区和半影区组织的交集基因分析 | 第56-57页 |
3.3 讨论 | 第57-59页 |
3.4 小结 | 第59-60页 |
3.5 附图表 | 第60-81页 |
第四部分 基因芯片GSE35338和GSE62884整合分析 | 第81-97页 |
4.1 分析方法 | 第81-83页 |
4.1.1 GSE35338和GSE62884差异表达基因交集分析 | 第81页 |
4.1.2 交集基因功能富集分析 | 第81-82页 |
4.1.3 基因功能作用网络分析 | 第82页 |
4.1.4 预测分析调控交集基因的转录调控网络 | 第82页 |
4.1.5 miRNA-靶基因关系对分析 | 第82-83页 |
4.2 分析结果 | 第83-85页 |
4.2.1 基因统计结果 | 第83页 |
4.2.2 功能富集分析 | 第83-84页 |
4.2.3 基因功能作用网络分析 | 第84页 |
4.2.4 转录调控网络 | 第84页 |
4.2.5 miRNA-靶基因关系对分析 | 第84-85页 |
4.3 讨论 | 第85-89页 |
4.4 小结 | 第89-90页 |
4.5 附图表 | 第90-97页 |
参考文献 | 第97-103页 |
综述 大脑中动脉狭窄的诊断及治疗研究进展 | 第103-108页 |
参考文献 | 第106-108页 |
致谢 | 第108-109页 |
博士期间发表文献 | 第109-110页 |
English paper one | 第110-128页 |
English paper two | 第128-144页 |
学位论文评阅及答辩情况表 | 第144页 |