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大脑中动脉闭塞的芯片数据挖掘及生物信息学分析

中文摘要第10-15页
ABSTRACT第15-20页
第一部分 研究背景第21-34页
    1.1 缺血性脑血管病概况第21-22页
    1.2 大脑中动脉闭塞的危险因素第22-23页
    1.3 缺血性脑血管病的发生机制第23-25页
    1.4 生物信息学和基因芯片技术概述第25-27页
    1.5 基因芯片的应用第27-28页
    1.6 基因芯片数据的分析及常用数据库和分析工具第28-32页
    1.7 生物信息学发展的意义第32-33页
    1.8 研究目的及意义第33-34页
第二部分 大脑中动脉闭塞差异表达基因的筛选与生物信息学分析第34-50页
    2.1 数据与方法第34-35页
        2.1.1 芯片数据来源第34页
        2.1.2 表达谱数据预处理与差异表达基因筛选第34-35页
        2.1.3 差异表达基因分析及功能注释第35页
        2.1.4 差异表达基因文氏图分析第35页
        2.1.5 蛋白质互作(PPI)网络构建第35页
    2.2 分析结果第35-38页
        2.2.1 数据标准化第36页
        2.2.2 差异表达基因分析结果第36页
        2.2.3 差异表达基因的功能富集分析结果第36-37页
        2.2.4 不同时间点大脑动脉闭塞差异表达基因的文氏图分析第37页
        2.2.5 差异表达基因对应的蛋白质互作网络第37-38页
    2.3 讨论第38-41页
    2.4 小结第41页
    2.5 附图表第41-50页
第三部分 PACAP38对大脑中动脉闭塞影响的分子机制研究第50-81页
    3.1 数据与方法第50-53页
        3.1.1 表达谱数据来源第50页
        3.1.2 原始数据预处理第50-51页
        3.1.3 差异表达基因筛选第51页
        3.1.4 差异表达基因功能富集分析第51页
        3.1.5 蛋白质互作(PPI)网络构建第51-52页
        3.1.6 差异表达基因文氏图分析第52页
        3.1.7 缺血核心区和半影区组织基因比较分析第52-53页
    3.2 分析结果第53-57页
        3.2.1 差异表达分析基本信息统计第53页
        3.2.2 缺血核心区(ischemia)组织差异表达基因富集分析结果第53-54页
        3.2.3 半影区(penumbra)组织差异表达基因富集分析结果第54页
        3.2.4 缺血核心区(ischemia)组织差异表达基因的蛋白质互作网络第54-55页
        3.2.5 半影区(penumbra)组织差异表达基因的蛋白质互作网络第55页
        3.2.6 缺血核心区差异表达基因文氏图分析第55-56页
        3.2.7 半影区差异表达基因文氏图分析第56页
        3.2.8 缺血核心区和半影区组织的交集基因分析第56-57页
    3.3 讨论第57-59页
    3.4 小结第59-60页
    3.5 附图表第60-81页
第四部分 基因芯片GSE35338和GSE62884整合分析第81-97页
    4.1 分析方法第81-83页
        4.1.1 GSE35338和GSE62884差异表达基因交集分析第81页
        4.1.2 交集基因功能富集分析第81-82页
        4.1.3 基因功能作用网络分析第82页
        4.1.4 预测分析调控交集基因的转录调控网络第82页
        4.1.5 miRNA-靶基因关系对分析第82-83页
    4.2 分析结果第83-85页
        4.2.1 基因统计结果第83页
        4.2.2 功能富集分析第83-84页
        4.2.3 基因功能作用网络分析第84页
        4.2.4 转录调控网络第84页
        4.2.5 miRNA-靶基因关系对分析第84-85页
    4.3 讨论第85-89页
    4.4 小结第89-90页
    4.5 附图表第90-97页
参考文献第97-103页
综述 大脑中动脉狭窄的诊断及治疗研究进展第103-108页
    参考文献第106-108页
致谢第108-109页
博士期间发表文献第109-110页
English paper one第110-128页
English paper two第128-144页
学位论文评阅及答辩情况表第144页

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