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牛支原体NM 2012株全基因组测序缺口修补及序列分析

摘要第1-4页
Abstract第4-9页
缩略语表第9-10页
1 引言第10-23页
   ·牛支原体简介第10-19页
     ·病原学第11页
     ·流行病学第11-12页
     ·致病机理第12-13页
     ·临床症状与病理变化第13-14页
     ·牛支原体免疫原学研究第14-15页
     ·实验室诊断第15-18页
     ·疫苗第18页
     ·防治第18-19页
   ·牛支原体粘附因子的研究第19-20页
   ·牛支原体膜表面蛋白的研究进展第20-22页
     ·牛支原体可变表面脂蛋白第20-21页
     ·牛支原体P81蛋白第21页
     ·其他第21-22页
   ·牛支原体全基因组测序第22-23页
   ·本研究的目的及意义第23页
2 材料与方法第23-29页
   ·材料第23-25页
     ·菌株第23页
     ·试剂与仪器第23-24页
     ·主要溶液及配置方法第24-25页
   ·方法第25-29页
     ·选择参考基因序列第25页
     ·确定缺口个数和缺口前后的位置关系第25页
     ·引物设计与合成第25页
     ·M.bovis培养及基因组提取第25-26页
     ·PCR的扩增第26页
     ·纯化PCR产物第26-27页
     ·目的基因与PEASY-T1载体的连接与转化第27页
     ·重组质粒鉴定与提取第27-28页
     ·重组质粒的PCR鉴定第28页
     ·DNA序列测定第28页
     ·M.bovis NM 2012菌株全基因组的完成第28页
     ·M.bovis NM 2012菌株的基因组注释第28-29页
     ·基因组学和比较基因组分析第29页
3 结果第29-40页
   ·参考序列基因组的选择第29-30页
   ·确定未完成的基因序列结果第30页
   ·未完成的基因序列的克隆测序结果第30-31页
   ·M.bovis NM 2012基因组概况第31页
   ·KEGG数据库分析结果第31页
   ·COG数据库分析结果第31-34页
   ·M.bovis NM 2012与其他四株M.bovis基因组比较分析结果第34-40页
     ·M.bovis NM 2012与其他四株M.bovis的同源性分析结果第35-37页
     ·基因组共线性分析结果第37-38页
     ·一个潜在毒力因子的比较分析结果第38-39页
     ·可变表面脂蛋白的比较分析结果第39-40页
   ·基因组的毒力因子第40页
4 讨论第40-42页
5 结论第42-44页
致谢第44-45页
参考文献第45-50页
作者简介第50页

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