小分子抗菌肽的虚拟组合设计、筛选与效应研究
| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-13页 |
| 第1章 文献综述 | 第13-19页 |
| ·抗生素发展历史回顾 | 第13-14页 |
| ·抗生素耐药性 | 第14-15页 |
| ·抗菌肽发展历史 | 第15页 |
| ·抗菌肽的作用机制 | 第15-16页 |
| ·抗菌肽构效关系及结构改造 | 第16-17页 |
| ·抗菌肽研究的发展趋势 | 第17-19页 |
| 第2章 绪论 | 第19-23页 |
| ·研究目的与意义 | 第19-20页 |
| ·主要研究内容 | 第20-23页 |
| 第3章 构效关系建模方法 | 第23-37页 |
| ·定量构效关系研究简介 | 第23-26页 |
| ·概述 | 第23-24页 |
| ·定量构效关系结构参数 | 第24-25页 |
| ·定量构效关系研究步骤 | 第25-26页 |
| ·定量构效关系建模方法 | 第26-29页 |
| ·变量的优化选择 | 第26-27页 |
| ·多元线性回归 | 第27页 |
| ·逐步回归 | 第27-28页 |
| ·偏最小二乘回归 | 第28-29页 |
| ·估计能力与预测能力 | 第29-30页 |
| ·常用统计量 | 第30页 |
| ·分子力学 | 第30-32页 |
| ·分子动力学方法 | 第32-34页 |
| ·比较分子力场分析 | 第34页 |
| ·比较分子相似指数分析 | 第34-37页 |
| 第4章 基于氨基结构信息的抗菌肽构效关系研究 | 第37-47页 |
| ·引言 | 第37-38页 |
| ·数据来源与研究方法 | 第38-41页 |
| ·数据来源 | 第38-39页 |
| ·抗菌肽的结构表征 | 第39-40页 |
| ·建模方法 | 第40页 |
| ·氨基酸贡献分析 | 第40页 |
| ·保守残基分析 | 第40-41页 |
| ·研究结果与分析 | 第41-43页 |
| ·CAMEL-s研究结果分析与讨论 | 第41-42页 |
| ·Novispirin抗菌肽结果分析与讨论 | 第42-43页 |
| ·表面粘附抗菌肽结果分析与讨论 | 第43页 |
| ·小结 | 第43-47页 |
| 第5章 小分子抗菌肽的设计与筛选 | 第47-67页 |
| ·抗菌肽的二维构效关系分析 | 第47-48页 |
| ·二维定量构效关系建模结果 | 第47-48页 |
| ·二维定量构效关系模型分析 | 第48页 |
| ·抗菌肽的三维定量构效关系研究 | 第48-51页 |
| ·抗菌肽活性构象分析 | 第49页 |
| ·抗菌肽CoMFA与CoMSIA分析 | 第49-50页 |
| ·基于N-端公共骨架的分子叠合 | 第50-51页 |
| ·基于C-端公共骨架的分子叠合 | 第51页 |
| ·抗菌肽组合设计方案 | 第51-52页 |
| ·抗菌肽组合设计与筛选 | 第52-67页 |
| 第6章 抗菌肽的合成、纯化与鉴定 | 第67-73页 |
| ·多肽固相合成原理 | 第67-68页 |
| ·多肽固相合成方法的优点 | 第68页 |
| ·实验原料与仪器 | 第68-69页 |
| ·20种常规保护氨基酸 | 第68页 |
| ·常规树脂 | 第68页 |
| ·常规溶剂 | 第68页 |
| ·实验仪器 | 第68-69页 |
| ·实验步骤 | 第69页 |
| ·抗菌肽的制备 | 第69页 |
| ·抗菌肽的纯化 | 第69页 |
| ·结果分析与讨论 | 第69-73页 |
| 第7章 抗菌肽体外抗菌活性测定 | 第73-79页 |
| ·实验材料和仪器 | 第73-74页 |
| ·菌株 | 第73页 |
| ·主要试剂 | 第73页 |
| ·实验仪器 | 第73-74页 |
| ·实验方法 | 第74-75页 |
| ·抑菌活性定性测定 | 第74页 |
| ·抗菌活性的定量测定 | 第74-75页 |
| ·结果分析与讨论 | 第75-79页 |
| 第8章 抗菌肽体外溶血活性测定 | 第79-83页 |
| ·材料和仪器 | 第79页 |
| ·主要试剂 | 第79页 |
| ·实验仪器 | 第79页 |
| ·实验方法 | 第79-80页 |
| ·体外溶血活性测定 | 第79-80页 |
| ·体外溶血率测定 | 第80页 |
| ·结果分析与讨论 | 第80-83页 |
| 第9章 结论与展望 | 第83-85页 |
| 参考文献 | 第85-97页 |
| 附录 | 第97-113页 |
| 在学期间发表的研究成果 | 第113-115页 |
| 致谢 | 第115页 |
