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嗜酸硫氧化细菌元素硫活化氧化机制研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-14页
符号说明第14-15页
第一章 绪论第15-29页
   ·金属硫化矿生物浸出的硫化学第15-18页
     ·金属硫化矿生物浸出的机理第15-16页
     ·元素硫化学形态的多样性第16-17页
     ·生物浸出过程含硫物质的累积与转化第17-18页
   ·硫氧化微生物的多样性第18-20页
   ·嗜酸硫氧化微生物的硫代谢第20-25页
     ·微生物元素的硫氧化过程第21-22页
     ·RISCs好氧代谢相关的酶第22-23页
     ·嗜酸氧化亚铁硫杆菌的RISCs氧化模型第23-25页
   ·嗜酸硫氧化微生物的组学研究第25-27页
     ·基因组学研究第25-26页
     ·转录组学研究第26页
     ·蛋白质组学研究第26-27页
   ·论文的研究目的及意义第27-28页
   ·论文的主要研究内容第28页
   ·论文课题来源第28-29页
第二章 浸矿体系中硫酸根离子浓度测定方法的建立第29-37页
   ·引言第29页
   ·材料与方法第29-30页
     ·仪器与试剂第29页
     ·硫酸钡比浊法分散体系稳定性研究第29-30页
     ·矿物浸出体系中硫酸根离子浓度测定第30页
   ·结果与讨论第30-35页
     ·最佳波长的确定第30页
     ·稳定剂对硫酸钡分散体系的影响第30-31页
     ·Tween-80用量对硫酸钡体系的影响第31-32页
     ·醇用量对硫酸钡体系的影响第32页
     ·pH值对硫酸钡体系的影响第32-33页
     ·硫酸钡比浊法工作曲线的建立第33页
     ·检出限及定量限的确定第33-34页
     ·重复性实验第34页
     ·回收率实验第34-35页
     ·比浊法在生物冶金浸出体系硫酸根离子浓度测定中的应用第35页
   ·本章小结第35-37页
第三章 嗜酸氧化亚铁硫杆菌细胞特化空间蛋白质选择性提取与双向电泳分离体系建立第37-48页
   ·引言第37-38页
   ·材料和方法第38-40页
     ·菌株和培养条件第38页
     ·细菌包被蛋白的制备第38-39页
     ·SDS-PAGE分析第39页
     ·2D电泳分析第39-40页
     ·细胞超微结构观察第40页
   ·结果与讨论第40-46页
     ·Triton X-114对A.ferrooxidans细胞的作用第40-42页
     ·细胞特化空间蛋白质的分离结果比较第42-44页
     ·特化空间蛋白质双向电泳图谱的比较第44-46页
   ·本章小结第46-48页
第四章 嗜酸硫氧化细菌的筛选和硫氧化生理特征研究第48-63页
   ·引言第48页
   ·材料与方法第48-51页
     ·主要试剂第48页
     ·样品来源第48-49页
     ·培养条件第49-50页
     ·富集与分离第50页
     ·生理生化研究第50页
     ·微分析第50页
     ·基因组DNA的提取和GC含量测定第50页
     ·16S rRNA的扩增、序列测定和系统发育分析第50-51页
     ·菌株BY-05的浸矿实验研究第51页
   ·结果第51-59页
     ·菌落特征第51-52页
     ·形态特征与超微结构第52-54页
     ·最适生长条件第54页
     ·典型底物代谢特征第54-55页
     ·铁/硫氧化活性第55-58页
     ·系统发育分析第58-59页
     ·菌株BY-05的对硫化矿的浸出效果第59页
   ·讨论第59-62页
     ·元素硫在硫氧化细菌体内外的分布第59-60页
     ·菌株及分类情况第60-61页
     ·A.albertensis在生物冶金中的应用潜力第61-62页
     ·浸矿细菌筛选及培养特点第62页
   ·本章小结第62-63页
第五章 嗜酸硫杆菌浸出黄铜矿过程含硫中间产物转化研究第63-74页
   ·引言第63页
   ·材料与方法第63-65页
     ·实验菌株及培养条件第63-64页
     ·样品来源第64页
     ·浸出试验第64页
     ·浸出化学行为及矿物组成分析第64页
     ·硫的K边XANES检测第64-65页
   ·结果第65-72页
     ·黄铜矿浸出过程细菌硫氧化活性比较分析第65-67页
     ·细菌对黄铜矿的浸出行为比较分析第67-69页
     ·黄铜矿浸出过程表面硫形态变化的比较分析第69-72页
   ·讨论第72-73页
   ·本章小结第73-74页
第六章 基于比较蛋白质组学的嗜酸氧化亚铁硫杆菌硫氧化相关蛋白质的筛选研究第74-92页
   ·引言第74页
   ·材料与方法第74-79页
     ·蛋白质分离纯化与2-DE图谱的建立第74页
     ·差异蛋白质斑点的质谱鉴定第74-75页
     ·生物信息学分析第75页
     ·RT-qPCR验证第75-78页
     ·细菌细胞表面蛋白质巯基含量差异原位比较第78-79页
   ·结果与讨论第79-90页
     ·A.ferrooxidans细胞包被蛋白质的2-DE差异表达谱第79-81页
     ·差异蛋白质点的MALDI-TOF MS/MS鉴定结果第81页
     ·筛选蛋白质的生物信息学分析第81-83页
     ·相关关键蛋白质在硫氧化过程中的功能探讨第83-85页
     ·硫氧化相关蛋白质差异表达的RT-qPCR验证第85-89页
     ·A.ferrooxidans细胞表面蛋白质巯基含量差异第89-90页
   ·本章小结第90-92页
第七章 Tween-80对嗜酸氧化亚铁硫杆菌硫氧化及相关蛋白质基因表达的影响研究第92-106页
   ·引言第92页
   ·材料与方法第92-95页
     ·实验菌株与培养条件第92-93页
     ·傅立叶红外(FT-IR)光谱测定第93页
     ·RT-qPCR第93-95页
   ·结果第95-103页
     ·Tween-80对A.ferrooxidans在不同能源底物中生长和硫氧化的影响第95-99页
     ·红外光谱学分析第99-100页
     ·Tween-80对A.ferrooxidans硫代谢相关蛋白质基因表达的影响第100-103页
   ·讨论第103-105页
   ·本章小结第105-106页
第八章 嗜酸氧化亚铁硫杆菌对线状硫和环状硫的氧化利用差异研究第106-120页
   ·引言第106-107页
   ·材料与方法第107-110页
     ·样品制备和预处理第107页
     ·菌株和培养条件第107页
     ·微生物吸附和硫的亲疏水性测定第107-108页
     ·细胞生长和硫氧化的测定第108页
     ·α-S和μ-S的表征第108页
     ·RT-qPCR第108-110页
   ·结果与讨论第110-119页
     ·α-S和μ-S的制备和表征第110-111页
     ·A.ferrooxidans分别在α-S和μ-S培养基中的生长和硫氧化第111-112页
     ·A.ferrooxidans吸附行为及其对底物亲水性的改善第112-113页
     ·A.ferrooxidans生长对α-S和μ-S表面形貌的改变第113-114页
     ·DRIFTS分析第114-115页
     ·XRD分析第115-116页
     ·α-S和μ-S对硫氧化相关基因表达的影响第116-119页
   ·本章小结第119-120页
第九章 全文总结第120-122页
参考文献第122-144页
附录第144-155页
致谢第155-156页
攻读学位期间主要的研究成果第156-158页

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