| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 第1章 绪言 | 第10-20页 |
| ·计算机辅助药物设计方法简介 | 第10页 |
| ·分子对接方法的发展 | 第10-16页 |
| ·分子对接的理论基础与方法简介 | 第11-12页 |
| ·分子构象采样方法概述 | 第12页 |
| ·打分函数 | 第12-16页 |
| ·针对核酸的分子对接方法 | 第16-18页 |
| ·核酸在药物研发中的意义 | 第16-17页 |
| ·针对核酸体系的分子对接方法的研究现状 | 第17-18页 |
| ·本文的主要研究思路与内容 | 第18-19页 |
| ·本章小结 | 第19-20页 |
| 第2章 DNA-配体分子对接方法的研究 | 第20-32页 |
| ·研究背景与意义 | 第20-22页 |
| ·DNA靶标简介 | 第20-21页 |
| ·iDNASBinder方法简介 | 第21-22页 |
| ·方法流程 | 第22-25页 |
| ·测试集的准备与处理 | 第22页 |
| ·对接精度测试 | 第22-23页 |
| ·虚拟筛选精度测试 | 第23-24页 |
| ·iDNASBinder对配体与DNA序列的选择性识别性评估 | 第24-25页 |
| ·结果与讨论 | 第25-30页 |
| ·对接精度测试结果 | 第25-29页 |
| ·虚拟筛选精度测试结果 | 第29页 |
| ·iDNASBinder对配体与DNA碱基序列选择性识别模拟结果 | 第29-30页 |
| ·本章小结 | 第30-32页 |
| 第3章 RNA-配体分子对接方法RNABinder的发展 | 第32-52页 |
| ·研究背景与意义 | 第32-33页 |
| ·RNA靶标简介 | 第32-33页 |
| ·RNABinder的算法设计 | 第33-43页 |
| ·RNA-配体打分函数的设计 | 第33-39页 |
| ·RNABinder的设计 | 第39-43页 |
| ·结果与讨论 | 第43-51页 |
| ·RNA-配体知识型打分函数 | 第43-45页 |
| ·RNABinder的精度测试 | 第45-48页 |
| ·RNABinder的虚拟筛选精度测评 | 第48-51页 |
| ·本章小结 | 第51-52页 |
| 第4章 全文总结与展望 | 第52-54页 |
| ·全文总结 | 第52-53页 |
| ·展望 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-64页 |
| 硕士期间发表论文 | 第64-65页 |
| 致谢 | 第65-67页 |
| 附录1 | 第67-68页 |
