肠炎沙门氏菌感染引起的白来航蛋鸡脾脏全基因组表达谱分析
| 中文摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 1 前言 | 第11-24页 |
| ·沙门氏菌病 | 第11-15页 |
| ·沙门氏菌的致病机理和危害 | 第11-12页 |
| ·沙门氏菌病的临床症状及病理变化 | 第12-13页 |
| ·沙门氏菌感染的发病机制 | 第13-14页 |
| ·沙门氏菌的检测方法 | 第14-15页 |
| ·基因芯片技术概述 | 第15-22页 |
| ·基因芯片的基本概念 | 第16页 |
| ·基因芯片的分类 | 第16-17页 |
| ·基因芯片的应用 | 第17-19页 |
| ·基因芯片的图像采集和处理 | 第19-20页 |
| ·芯片数据的预处理和归一化 | 第20页 |
| ·基因芯片的基因注释和功能分析 | 第20-22页 |
| ·基因芯片在动物研究中的应用 | 第22页 |
| ·鸡对沙门氏菌抗性的研究进展 | 第22页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第22-24页 |
| 2 材料与方法 | 第24-37页 |
| ·试验材料 | 第24-28页 |
| ·动物试验场所及菌株来源 | 第24页 |
| ·试验设计 | 第24-25页 |
| ·基因芯片 | 第25页 |
| ·常规试剂和药品及耗材 | 第25-26页 |
| ·主要仪器 | 第26-27页 |
| ·试验试剂及其配制 | 第27-28页 |
| ·分析工具及其网站 | 第28页 |
| ·试验方法 | 第28-37页 |
| ·血液生理指标的检测 | 第28页 |
| ·总 RNA 的提取 | 第28-29页 |
| ·RNA 变性琼脂糖凝胶电泳法检测 RNA 质量 | 第29页 |
| ·双标芯片实验操作流程 | 第29-33页 |
| ·QRT-PCR 及数据分析 | 第33-36页 |
| ·聚类分析 | 第36页 |
| ·差异表达基因的 GO 和 PATHWAY 分析 | 第36-37页 |
| 3 结果与分析 | 第37-54页 |
| ·血细胞计数 | 第37-38页 |
| ·RNA 提取 | 第38-40页 |
| ·芯片数据的预处理与归一化 | 第40-41页 |
| ·芯片结果分析 | 第41-42页 |
| ·芯片结果验证 | 第42-44页 |
| ·免疫相关基因的聚类分析 | 第44-45页 |
| ·差异表达基因的 GO 和 PATHWAY 分析 | 第45-52页 |
| ·不同时间点的差异表达基因分析 | 第52-54页 |
| 4 讨论 | 第54-59页 |
| ·肠炎沙门氏菌对蛋鸡血液生理指标的影响 | 第54页 |
| ·RNA 的质量对芯片结果的影响 | 第54-55页 |
| ·芯片结果的验证及分析 | 第55-56页 |
| ·差异表达基因的 GO 和 PATHWAY 分析 | 第56-57页 |
| ·肠炎沙门氏菌感染随时间的变化 | 第57页 |
| ·免疫相关基因在抗病机理中的作用 | 第57-59页 |
| 5 结论 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-69页 |
| 致谢 | 第69页 |
