| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-12页 |
| 第1章 前言 | 第12-30页 |
| ·转录组简介 | 第12-17页 |
| ·转录组 | 第12页 |
| ·转录组学 | 第12-13页 |
| ·转录组学技术平台 | 第13-16页 |
| ·转录组学研究现状 | 第16-17页 |
| ·测序技术进展及其在转录组学中的应用 | 第17-21页 |
| ·传统测序技术 | 第17-18页 |
| ·下一代高通量测序技术 | 第18-20页 |
| ·RNA-Seq技术 | 第20-21页 |
| ·转录组的生物信息学分析 | 第21-26页 |
| ·数据的组装 | 第21-22页 |
| ·生物信息学分析内容 | 第22-24页 |
| ·线粒体转录组作图研究 | 第24-26页 |
| ·短额负蝗研究进展 | 第26-29页 |
| ·短额负蝗简介 | 第26页 |
| ·短额负蝗研究现状 | 第26-27页 |
| ·蝗虫转录组研究进展 | 第27-29页 |
| ·研究目的和意义 | 第29-30页 |
| 第2章 实验材料和方法 | 第30-46页 |
| ·实验材料 | 第30-32页 |
| ·实验标本 | 第30页 |
| ·实验仪器与试剂 | 第30-32页 |
| ·实验方法 | 第32-37页 |
| ·实验准备 | 第32-33页 |
| ·短额负蝗总RNA的提取及纯化 | 第33-34页 |
| ·总RNA样品质量检测 | 第34-35页 |
| ·RNA测序文库的构建 | 第35-36页 |
| ·cDNA文库测序 | 第36-37页 |
| ·生物信息学分析流程 | 第37-46页 |
| ·原始测序数据的储存 | 第37页 |
| ·Clean Reads数据的获得 | 第37页 |
| ·数据的组装 | 第37-38页 |
| ·Unigene的数据分析 | 第38-42页 |
| ·差异表达基因分析 | 第42-46页 |
| 第3章 实验结果 | 第46-50页 |
| ·总RNA的质量检测 | 第46-49页 |
| ·总RNA的琼脂糖凝胶电泳检测 | 第46-47页 |
| ·紫外分光光度计检测 | 第47-48页 |
| ·Agilent 2100 Bioanalyzer检测 | 第48-49页 |
| ·测序产量统计 | 第49-50页 |
| 第4章 短额负蝗转录组的全局分析 | 第50-64页 |
| ·测序数据的组装结果 | 第50-52页 |
| ·短额负蝗转录组测序数据的组装质量统计 | 第50页 |
| ·短额负蝗All-Unigene长度分布统计 | 第50-51页 |
| ·All-Unigene预测的CDS的长度分布统计 | 第51-52页 |
| ·All-Unigene的功能注释 | 第52-62页 |
| ·Nr数据库 | 第53-55页 |
| ·SwissProt数据库 | 第55-57页 |
| ·COG分类 | 第57-58页 |
| ·GO分类 | 第58-60页 |
| ·KEGG分析 | 第60-62页 |
| ·小结 | 第62-64页 |
| 第5章 短额负蝗若虫和雌雄成虫的基因差异表达分析 | 第64-72页 |
| ·若虫与成虫的基因差异表达分析 | 第64-67页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第64-65页 |
| ·差异基因的GO功能分析 | 第65页 |
| ·差异基因的KEGG pathway分析 | 第65-67页 |
| ·雌性成虫与雄性成虫的基因差异表达分析 | 第67-70页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第67-69页 |
| ·差异基因的GO功能分析 | 第69页 |
| ·差异基因的KEGG pathway分析 | 第69-70页 |
| ·小结 | 第70-72页 |
| 第6章 短额负蝗线粒体的转录组作图研究 | 第72-74页 |
| 结论 | 第74-76页 |
| 参考文献 | 第76-84页 |
| 致谢 | 第84-86页 |
| 攻读硕士学位期间的研究成果 | 第86页 |