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Ccd1激活Wnt信号通路的分子机制

摘要第1-5页
Abstract第5-12页
第1章 引言第12-49页
   ·Wnt 信号通路第12-18页
     ·经典的Wnt 信号通路第14-15页
     ·Wnt 通路的启动模型第15-17页
     ·Wnt 信号与肿瘤的发生第17-18页
   ·β-catenin 的结构生物学研究进展第18-22页
   ·Dvl 研究进展第22-30页
     ·总述第22-24页
     ·Dvl 与信号通路分子的相互作用第24-27页
     ·Dvl 结构生物学研究进展第27-30页
   ·Axin 研究进展第30-37页
     ·总述第30页
     ·Wnt 信号通路中的Axin 结合蛋白第30-33页
     ·Axin 与 JNK 信号通路第33-34页
     ·Axin 结构生物学研究进展第34-37页
   ·Ccd1 的研究进展第37-40页
     ·总述第37-39页
     ·长型 Ccd1 可以与细胞骨架结合第39-40页
     ·Ccd1 参与调控 JNK 信号通路第40页
   ·DIX 结构域的研究进展第40-47页
     ·Dvl 和Axin 通过DIX 结构域进行自身多聚化第40-41页
     ·DIX 结构域的动态特性第41-42页
     ·DIX 结构域在Dvl-Axin 相互识别中的作用第42-44页
     ·DIX 结构域的结构生物学研究第44-47页
   ·本文研究内容和意义第47-49页
第2章 DIX 相关蛋白的表达与纯化第49-63页
   ·蛋白的表达第49-52页
     ·蛋白性质分析第49-50页
     ·表达载体的构建第50-51页
     ·蛋白产量、可溶性分析第51-52页
   ·蛋白纯化第52-56页
     ·His 标签蛋白的纯化第53-55页
     ·GST 标签蛋白的纯化第55-56页
   ·实验结果第56-63页
     ·Dvl-DIX 的蛋白纯化第56-58页
     ·Axin 相关蛋白的纯化第58-61页
     ·Ccd1-DIX 的蛋白纯化第61-63页
第3章 Ccd1-DIX 蛋白的晶体生长与结构解析第63-79页
   ·蛋白质的结晶第63-68页
     ·蛋白晶体的初筛第63-64页
     ·蛋白结晶条件的优化第64-65页
     ·衍射初试及防冻液条件的摸索第65页
     ·Dvl-DIX 的晶体优化第65-66页
     ·Ccd1-DIX 的晶体优化第66-68页
   ·数据收集和指标化第68-69页
   ·相位问题的解决第69-73页
     ·解决相位问题的方法第69-71页
     ·Ccd1-DIX 硒代蛋白的表达、纯化及晶体生长第71-72页
     ·硒代蛋白晶体的数据收集与处理第72-73页
   ·结构模型的建立、修正及质量检测第73-79页
     ·结构模型的建立第73-74页
     ·结构模型的修正第74页
     ·结构模型的质量检测第74-75页
     ·Ccd1-DIX 最终结构模型的质量评估第75-79页
第4章 Ccd1-DIX 晶体结构的分析与讨论第79-90页
   ·Ccd1-DIX 是单体第79页
   ·Ccd1-DIX 晶体结构的描述第79-81页
   ·与Axin-DIX 的结构比较第81-83页
   ·Ccd1-DIX 晶体排列中的螺旋纤维第83-86页
   ·Site I 和 Site II 的结构细节分析第86-88页
   ·Site I 和 Site II 的结构细节分析第86-87页
     ·Site II 的结构细节分析第87-88页
   ·Swap 突变实验第88-90页
     ·突变设计思路第88页
     ·定点突变的实验方法与原理第88页
     ·实验结果第88-90页
第5章 Dvl-DIX 通过两个Site 进行多聚化第90-101页
   ·本章实验思路第90-91页
   ·实验方法与原理第91-93页
     ·蛋白的定点突变第91页
     ·细胞培养与传代第91页
     ·瞬时转染第91页
     ·Wnt 报告基因的检测第91-92页
     ·免疫染色实验第92-93页
   ·实验结果第93-101页
     ·Dvl1-DIX(Y17D)的晶体结构第93-96页
     ·两个Site 内的突变导致Dvl2-DIX 解聚第96-97页
     ·利用免疫荧光技术对Dvl2-DIX 突变体进行亚细胞定位第97-98页
     ·Dvl2 突变体对Wnt 信号的激活第98-101页
第6章 Ccd1-DIX 与Dvl2-DIX 的相互作用第101-114页
   ·本章实验思路第101页
   ·实验方法与原理第101-106页
     ·核磁共振(Nuclear Magnetic Resonance,NMR)第101-105页
     ·检测蛋白间的相互作用第105-106页
     ·细胞质膜分离技术(Subcellular Fractionation)第106页
   ·实验结果分析第106-114页
     ·用化学滴定的方法研究Ccd1-DIX 与Dvl2-DIX 的相互作用第106-108页
     ·Ccd1-DIX 的‘tail’区与Dvl 的‘head’区相互作用第108-110页
     ·Ccd1 通过与Dvl 相互作用激活Wnt 信号第110-111页
     ·Ccd1 在Dvl2 作用下膜定位增强第111-112页
     ·Ccd1 结合促进Dvl2 的轻微解聚第112-114页
第7章 Ccd1 与Dvl 和Axin 形成三元复合物第114-120页
   ·本章实验思路第114页
   ·实验方法与原理第114-115页
   ·实验结果与分析第115-120页
     ·Ccd1 通过 Coiled Coil 结构域进行自身多聚化第115-116页
     ·Ccd1 通过DIX 结构域与Dvl/Axin 相互作用第116-117页
     ·AxinΔDIX 不影响其与Dvl 的相互作用第117-118页
     ·Ccd1 通过Coiled Coil 及DIX 与Dvl 和Axin 形成三元复合物第118-120页
第8章 讨论第120-126页
   ·Site II 在介导 Dvl 自身多聚化中的重要作用第120-121页
   ·DIX 结构域头对尾的识别方式第121-122页
   ·Ccd1 对Dvl 多聚体的解离第122-123页
   ·Ccd1 与Dvl 和Axin 形成了三元复合物第123-124页
   ·Ccd1 激活Wnt 的机制第124页
   ·未来工作待解决的问题第124-126页
参考文献第126-136页
致谢第136-138页
附录A Ccd1 CC 结构域的结构生物学研究第138-142页
 A.1 Ccd1-CC 的基本性质第138页
 A.2 Ccd1-CC 的蛋白表达与纯化第138-141页
  A.2.1 Ni 柱亲和层析与离子交换层析第139-140页
  A.2.2 Thrombin 酶切过夜第140页
  A.2.3 凝胶过滤层析第140-141页
 A.3 Ccd1-CC 晶体的筛选第141-142页
个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果第142页

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