| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-11页 |
| 目录 | 第11-16页 |
| 第一章 引言 | 第16-33页 |
| ·酸性矿坑水中微生物及其多样性简介 | 第16-18页 |
| ·嗜酸微生物在生物冶金中的应用 | 第18-27页 |
| ·生物冶金及其原理 | 第18-19页 |
| ·生物冶金微生物 | 第19-20页 |
| ·单一和混合微生物浸矿 | 第20-21页 |
| ·冶金微生物之间的相互作用 | 第21-22页 |
| ·微生物群落的发展和演替 | 第22-23页 |
| ·生物冶金微生物群落结构与功能的关系 | 第23-27页 |
| ·分析生物冶金微生物及其群落的技术手段 | 第27-31页 |
| ·基因指纹图谱法 | 第27页 |
| ·分子杂交法 | 第27-28页 |
| ·定量PCR分析法 | 第28页 |
| ·基因序列系统发育分析法 | 第28-29页 |
| ·基因芯片技术 | 第29-31页 |
| ·本论文的研究目的与意义 | 第31-32页 |
| ·本论文研究的主要内容 | 第32页 |
| ·论文课题来源 | 第32-33页 |
| 第二章 嗜铁钩端螺旋菌的分离和鉴定 | 第33-42页 |
| ·前言 | 第33-34页 |
| ·材料与方法 | 第34-36页 |
| ·酸性矿坑水样品来源 | 第34页 |
| ·稀释分离路线 | 第34页 |
| ·生理生化特征 | 第34页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第34-35页 |
| ·rep-PCR及凝胶电泳 | 第35页 |
| ·16S rDNA和gyrB基因的PCR扩增、克隆、测序与序列分析 | 第35-36页 |
| ·黄铁矿的浸出 | 第36页 |
| ·结果与分析 | 第36-41页 |
| ·rep-PCR分析 | 第36-37页 |
| ·生理特征分析 | 第37-38页 |
| ·16S rDNA序列分析 | 第38-39页 |
| ·gyrB基因序列分析 | 第39-40页 |
| ·形态学观察 | 第40页 |
| ·对黄铁矿的浸出效果 | 第40-41页 |
| ·本章小结 | 第41-42页 |
| 第三章 共培养体系的构建及优化 | 第42-52页 |
| ·前言 | 第42-43页 |
| ·材料与方法 | 第43-46页 |
| ·共培养体系的组成 | 第43页 |
| ·矿样组成及颗粒特性 | 第43页 |
| ·共培养体系生长条件的优化 | 第43-44页 |
| ·共培养体系驯化过程中种群动态变化 | 第44-46页 |
| ·结果与讨论 | 第46-51页 |
| ·共培养体系生长参数优化 | 第46-48页 |
| ·共培养体系在黄铁矿中的驯化 | 第48-51页 |
| ·本章小结 | 第51-52页 |
| 第四章 土著浸矿微生物群落快速生长期引入AT.THIOOXIDANS A01对群落结构和功能的影响 | 第52-63页 |
| ·前言 | 第52-53页 |
| ·材料与方法 | 第53-55页 |
| ·菌种来源 | 第53页 |
| ·矿样组成及颗粒特性 | 第53页 |
| ·引种实验 | 第53页 |
| ·DNA的提取 | 第53-54页 |
| ·RNA的提取 | 第54页 |
| ·PCR引物、常规PCR与实时定量PCR | 第54页 |
| ·cDNA的荧光标记 | 第54页 |
| ·芯片杂交 | 第54-55页 |
| ·图像处理和数据分析 | 第55页 |
| ·结果与讨论 | 第55-62页 |
| ·引种前后土著微生物群落对黄铁矿的浸出比较 | 第55-57页 |
| ·引种前后各种群动态变化分析 | 第57-59页 |
| ·引种后20小时内种群动态变化及其功能基因表达差异性分析 | 第59-62页 |
| ·本章小结 | 第62-63页 |
| 第五章 土著浸矿微生物群落稳定生长期引入AT.THIOOXIDANS A01对群落结构和功能的影响 | 第63-72页 |
| ·前言 | 第63页 |
| ·材料与方法 | 第63-65页 |
| ·菌种来源 | 第63-64页 |
| ·矿样组成及颗粒特性 | 第64页 |
| ·引种实验 | 第64页 |
| ·DNA的提取 | 第64页 |
| ·RNA的提取 | 第64页 |
| ·PCR引物、常规PCR与实时定量PCR | 第64页 |
| ·cDNA的荧光标记 | 第64页 |
| ·芯片杂交 | 第64页 |
| ·图像处理和数据分析 | 第64-65页 |
| ·结果与讨论 | 第65-71页 |
| ·引种前后土著群落对黄铁矿的浸出比较 | 第65-66页 |
| ·引种前后各个种群动态变化分析 | 第66-67页 |
| ·引种后20小时内各个种群动态变化及其功能基因表达差异性分析 | 第67-71页 |
| ·本章小结 | 第71-72页 |
| 第六章 土著浸矿微生物群落不同生长期引入L.FERRIPHILUM YSK对群落结构和功能的影响 | 第72-85页 |
| ·前言 | 第72页 |
| ·材料与方法 | 第72-74页 |
| ·土著浸矿微生物群落构建及外来菌种简介 | 第72-73页 |
| ·矿样组成及颗粒特性 | 第73页 |
| ·引种实验 | 第73-74页 |
| ·DNA的提取 | 第74页 |
| ·RNA的提取 | 第74页 |
| ·PCR引物、常规PCR与实时定量PCR | 第74页 |
| ·cDNA的荧光标记 | 第74页 |
| ·芯片杂交 | 第74页 |
| ·图像处理和数据分析 | 第74页 |
| ·结果与讨论 | 第74-83页 |
| ·土著群落在不同时期引种后对黄铁矿浸出的比较 | 第74-77页 |
| ·引种前后种群动态变化分析 | 第77-81页 |
| ·群落D引种后20小时内功能基因表达差异性分析 | 第81-83页 |
| ·本章小结 | 第83-85页 |
| 第七章 酸性矿坑水中微生物群落驯化过程中群落结构和功能演替规律研究 | 第85-96页 |
| ·前言 | 第85-86页 |
| ·材料与方法 | 第86-88页 |
| ·菌种来源 | 第86页 |
| ·矿样来源 | 第86页 |
| ·实验方法 | 第86-87页 |
| ·微生物收集、DNA抽提、纯化 | 第87页 |
| ·16S rRNA基因的PCR扩增和克隆 | 第87-88页 |
| ·序列测定及系统发育分析 | 第88页 |
| ·核苷酸序列登记号 | 第88页 |
| ·DNA的荧光标记 | 第88页 |
| ·芯片杂交 | 第88页 |
| ·图像处理和数据分析 | 第88页 |
| ·结果与讨论 | 第88-95页 |
| ·驯化过程中浸矿微生物群落对硫化矿的浸出比较 | 第88-90页 |
| ·驯化前后浸矿微生物群落结构分析 | 第90-92页 |
| ·驯化过程中各个种群动态变化分析 | 第92-93页 |
| ·驯化过程中群落功能基因丰度的动态分析 | 第93-95页 |
| ·本章小结 | 第95-96页 |
| 第八章 土著浸矿微生物群落不同生长时期引入AT.THIOOXIDANS A01对群落结构和功能的影响 | 第96-107页 |
| ·前言 | 第96-97页 |
| ·材料与方法 | 第97-99页 |
| ·菌种来源 | 第97页 |
| ·矿样来源 | 第97页 |
| ·实验方法 | 第97-98页 |
| ·微生物收集、DNA抽提、纯化 | 第98页 |
| ·PCR引物、常规PCR与实时定量PCR | 第98页 |
| ·16S rRNA基因的PCR扩增和克隆 | 第98-99页 |
| ·序列测定及系统发育分析 | 第99页 |
| ·核苷酸序列登记号 | 第99页 |
| ·DNA的荧光标记 | 第99页 |
| ·芯片杂交 | 第99页 |
| ·图像处理和数据分析 | 第99页 |
| ·结果与讨论 | 第99-105页 |
| ·引种前后群落对黄铜矿浸出的比较 | 第99-100页 |
| ·引种前后浸矿体系中pH的变化 | 第100页 |
| ·引种前后浸矿体系中电位的变化 | 第100-101页 |
| ·引种前后群落结构变化分析 | 第101-103页 |
| ·引种前后种群动态变化分析 | 第103-104页 |
| ·引种前后群落功能基因丰度变化分析 | 第104-105页 |
| ·本章小结 | 第105-107页 |
| 第九章 结论 | 第107-112页 |
| 1. 嗜铁钩端螺旋菌的分离与鉴定 | 第107页 |
| 2. 共培养体系的构建及优化 | 第107页 |
| 3. 土著浸矿微生物群落快速生长期引入AT.THIOOXIDANS A01对群落结构和功能的影响 | 第107-108页 |
| 4. 土著浸矿微生物群落稳定生长期引入AT.THIOOXIDANS A01对群落结构和功能的影响 | 第108-109页 |
| 5. 土著浸矿微生物群落不同生长期引入L.FERRIPHILUM YSK对群落结构和功能的影响 | 第109页 |
| 6. 酸性矿坑水中微生物群落驯化过程中群落结构和功能演替规律研究 | 第109-110页 |
| 7. 土著浸矿微生物群落不同生长时期引入AT.THIOOXIDANS A01对群落结构和功能的影响 | 第110-112页 |
| 参考文献 | 第112-128页 |
| 致谢 | 第128-129页 |
| 攻读博士学位期间所发表的论文 | 第129页 |
